Ya, Anda akan kehilangan pembaruan, bersama dengan aplikasi terpasang lainnya yang tidak disertai stok. Tetapi Anda akan dapat memperbarui kembali aplikasi melalui Google Play, dan Anda tidak akan kehilangan pembelian yang Anda lakukan (disimpan selamanya di cloud Google).
Saya tidak yakin mengapa Anda khawatir tentang itu. Saya mengerti tidak ingin kehilangan pengaturan dan data Anda, tetapi satu-satunya downside untuk kehilangan pembaruan aplikasi adalah waktu dan bandwidth yang diperlukan untuk memperbarui mereka setelah itu.
Sunting: Anda mungkin bertanya tentang pembaruan OS. Ponsel Anda tidak menyimpan gambar OS asli. Dengan demikian, setelah Anda memperbarui OS Anda (baik dengan pembaruan OTA atau dengan menginstal custom Rom), Anda tidak akan dapat kembali ke versi Android yang lebih lama. Melakukan reset pabrik hanya akan mengatur ulang ponsel ke versi yang bersih dari versi Android saat ini.