Jawaban:
Jika App store tidak tahu tentang pembaruan, aplikasi itu seharusnya tidak dapat memberi tahu Anda - jadi di dalam System Preferences, masuk ke panel preferensi "App Store" dan nonaktifkan opsi untuk mencari pembaruan secara otomatis.
Di OSX Mavericks :
Anda dapat menonaktifkan notifikasi untuk sementara waktu dengan menggulir ke bawah di panel notifikasi dan mengalihkan "Jangan Ganggu" ke Hidup. Pemahaman saya adalah bahwa durasi waktu ini berlaku ditentukan oleh pengaturan Anda di System Preferences> Notifications> Do Not Disturb> Dari XXX ke XXX.