Peter Shor menunjukkan bahwa dua masalah NP-intermediate yang paling penting, anjak piutang dan masalah log diskrit, ada di BQP. Sebaliknya, algoritma kuantum yang paling dikenal untuk SAT (pencarian Grover) hanya menghasilkan peningkatan kuadratik daripada algoritma klasik, mengisyaratkan bahwa masalah NP-complete masih sulit diterapkan pada komputer kuantum. Seperti yang ditunjukkan Arora dan Barak, ada juga masalah dalam BQP yang tidak diketahui dalam NP, yang mengarah pada dugaan bahwa kedua kelas tidak dapat dibandingkan.
Apakah ada pengetahuan / dugaan mengapa masalah NP-intermediate ini ada di BQP, tapi mengapa SAT (sejauh yang kita tahu) tidak? Apakah masalah NP-intermediate lainnya mengikuti tren ini? Secara khusus, apakah grafik isomorfisme dalam BQP? (yang ini tidak google dengan baik).