Menginstal SciPy dan NumPy menggunakan pip

Saya mencoba membuat perpustakaan yang diperlukan dalam sebuah paket yang saya bagikan. Itu membutuhkan perpustakaan SciPy dan NumPy . Saat mengembangkan, saya menginstal keduanya menggunakan

apt-get install scipy

yang menginstal SciPy 0.9.0 dan NumPy 1.5.1, dan bekerja dengan baik.

Saya ingin melakukan hal yang sama dengan menggunakan pip install- agar dapat menentukan dependensi dalam setup.py dari paket saya sendiri.

Masalahnya adalah, ketika saya mencoba:

pip install 'numpy==1.5.1'

ini bekerja dengan baik.

Tapi kemudian

pip install 'scipy==0.9.0'

gagal total, dengan

raise self.notfounderror(self.notfounderror.__doc__)

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError:

Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.

Directories to search for the libraries can be specified in the

numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting

the BLAS environment variable.

Bagaimana saya membuatnya bekerja?

Saya mengasumsikan pengalaman Linux dalam jawaban saya; Saya menemukan bahwa ada tiga prasyarat pip install scipyuntuk melanjutkan dengan baik.

Buka di sini: Menginstal SciPY

Ikuti instruksi untuk mengunduh, membangun, dan mengekspor variabel env untuk BLAS dan kemudian LAPACK . Berhati-hatilah untuk tidak hanya membabi buta cut'n'paste perintah shell - akan ada beberapa baris yang perlu Anda pilih tergantung pada arsitektur Anda, dll., Dan Anda harus memperbaiki / menambahkan direktori yang benar yang secara salah diasumsikan sebagai baik.

Hal ketiga yang Anda butuhkan adalah menginstal yump-f2py atau yang setara.

Oh, ya dan terakhir, Anda mungkin perlu menginstal yum gcc-gfortran karena pustaka di atas adalah sumber Fortran .

Ini bekerja untuk saya di Ubuntu 14.04:

sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev gfortran
pip install scipy

Anda membutuhkan paket dev libblas dan liblapack jika Anda menggunakan Ubuntu.

aptitude install libblas-dev liblapack-dev
pip install scipy

Karena instruksi sebelumnya untuk menginstal dengan yum rusak di sini adalah instruksi terbaru untuk menginstal pada sesuatu seperti fedora. Saya sudah menguji ini di "Amazon Linux AMI 2016.03"

sudo yum install atlas-devel lapack-devel blas-devel libgfortran
pip install scipy

Saya sedang mengerjakan sebuah proyek yang bergantung pada numpy dan scipy. Dalam instalasi bersih Fedora 23, menggunakan lingkungan virtual python untuk Python 3.4 (juga bekerja untuk Python 2.7), dan dengan yang berikut ini di setup.py saya (dalam setup()metode)

setup_requires=[
    'numpy',
],
install_requires=[
    'numpy',
    'scipy',
],

Saya menemukan saya harus menjalankan yang berikut ini untuk mulai pip install -e .bekerja:

pip install --upgrade pip

dan

sudo dnf install atlas-devel gcc-{c++,gfortran} subversion redhat-rpm-config

The redhat-rpm-configuntuk digunakan scipy tentang redhat-hardened-cc1yang bertentangan dengan biasacc1

Di windows python 3.5 , saya berhasil menginstal scipydengan conda tidak pip :

conda install scipy

Sistem operasi apa ini? Jawabannya mungkin tergantung pada OS yang terlibat. Namun, sepertinya Anda perlu menemukan perpustakaan BLAS ini dan menginstalnya. Tampaknya tidak berada di PIP (Anda harus melakukannya dengan tangan demikian), tetapi jika Anda menginstalnya, itu harus membiarkan Anda meningkatkan instalasi SciPy Anda.

dalam kasus saya, meningkatkan pip melakukan trik. Juga, saya telah menginstal scipy dengan parameter -U (upgrade semua paket ke versi terakhir yang tersedia)