Memotong tabel html ke dalam bingkai data R menggunakan paket XML


153

Bagaimana cara mengikis tabel html menggunakan paket XML?

Ambil, misalnya, halaman wikipedia ini tentang tim sepak bola Brasil . Saya ingin membacanya di R dan mendapatkan tabel "daftar semua pertandingan yang dimainkan Brasil melawan tim yang diakui FIFA" sebagai data.frame. Bagaimana saya bisa melakukan ini?


11
Untuk bekerja di luar pemilih xpath, periksa selectorgadget.com/ - itu mengagumkan
hadley

Jawaban:


144

... atau coba yang lebih singkat:

library(XML)
library(RCurl)
library(rlist)
theurl <- getURL("https://en.wikipedia.org/wiki/Brazil_national_football_team",.opts = list(ssl.verifypeer = FALSE) )
tables <- readHTMLTable(theurl)
tables <- list.clean(tables, fun = is.null, recursive = FALSE)
n.rows <- unlist(lapply(tables, function(t) dim(t)[1]))

meja yang dipilih adalah yang terpanjang di halaman

tables[[which.max(n.rows)]]

Bantuan readHTMLTable juga memberikan contoh membaca tabel teks biasa dari elemen HTML PRE menggunakan htmlParse (), getNodeSet (), textConnection () dan read.table ()
Dave X

48
library(RCurl)
library(XML)

# Download page using RCurl
# You may need to set proxy details, etc.,  in the call to getURL
theurl <- "http://en.wikipedia.org/wiki/Brazil_national_football_team"
webpage <- getURL(theurl)
# Process escape characters
webpage <- readLines(tc <- textConnection(webpage)); close(tc)

# Parse the html tree, ignoring errors on the page
pagetree <- htmlTreeParse(webpage, error=function(...){})

# Navigate your way through the tree. It may be possible to do this more efficiently using getNodeSet
body <- pagetree$children$html$children$body 
divbodyContent <- body$children$div$children[[1]]$children$div$children[[4]]
tables <- divbodyContent$children[names(divbodyContent)=="table"]

#In this case, the required table is the only one with class "wikitable sortable"  
tableclasses <- sapply(tables, function(x) x$attributes["class"])
thetable  <- tables[which(tableclasses=="wikitable sortable")]$table

#Get columns headers
headers <- thetable$children[[1]]$children
columnnames <- unname(sapply(headers, function(x) x$children$text$value))

# Get rows from table
content <- c()
for(i in 2:length(thetable$children))
{
   tablerow <- thetable$children[[i]]$children
   opponent <- tablerow[[1]]$children[[2]]$children$text$value
   others <- unname(sapply(tablerow[-1], function(x) x$children$text$value)) 
   content <- rbind(content, c(opponent, others))
}

# Convert to data frame
colnames(content) <- columnnames
as.data.frame(content)

Diedit untuk menambahkan:

Output sampel

                     Opponent Played Won Drawn Lost Goals for Goals against  % Won
    1               Argentina     94  36    24   34       148           150  38.3%
    2                Paraguay     72  44    17   11       160            61  61.1%
    3                 Uruguay     72  33    19   20       127            93  45.8%
    ...

7
Bagi siapa pun yang cukup beruntung untuk menemukan posting ini, skrip ini kemungkinan tidak akan dijalankan kecuali pengguna menambahkan informasi "User-Agent" mereka, seperti yang dijelaskan dalam posting bermanfaat lainnya: stackoverflow.com/questions/9056705/…
Rguy

26

Opsi lain menggunakan Xpath.

library(RCurl)
library(XML)

theurl <- "http://en.wikipedia.org/wiki/Brazil_national_football_team"
webpage <- getURL(theurl)
webpage <- readLines(tc <- textConnection(webpage)); close(tc)

pagetree <- htmlTreeParse(webpage, error=function(...){}, useInternalNodes = TRUE)

# Extract table header and contents
tablehead <- xpathSApply(pagetree, "//*/table[@class='wikitable sortable']/tr/th", xmlValue)
results <- xpathSApply(pagetree, "//*/table[@class='wikitable sortable']/tr/td", xmlValue)

# Convert character vector to dataframe
content <- as.data.frame(matrix(results, ncol = 8, byrow = TRUE))

# Clean up the results
content[,1] <- gsub(" ", "", content[,1])
tablehead <- gsub(" ", "", tablehead)
names(content) <- tablehead

Menghasilkan hasil ini

> head(content)
   Opponent Played Won Drawn Lost Goals for Goals against % Won
1 Argentina     94  36    24   34       148           150 38.3%
2  Paraguay     72  44    17   11       160            61 61.1%
3   Uruguay     72  33    19   20       127            93 45.8%
4     Chile     64  45    12    7       147            53 70.3%
5      Peru     39  27     9    3        83            27 69.2%
6    Mexico     36  21     6    9        69            34 58.3%

Panggilan luar biasa untuk menggunakan xpath. Minor point: Anda dapat sedikit menyederhanakan argumen path dengan mengubah // * / menjadi //, mis. "// table [@ class = 'wikitable sortable'] / tr / th"
Richie Cotton

Saya mendapatkan kesalahan "Skrip harus menggunakan string Agen-Pengguna informatif dengan informasi kontak, atau mereka mungkin diblokir IP tanpa pemberitahuan." [2] "Apakah ada cara untuk menerapkan metode ini?
pssguy

2
opsi (RCurlOptions = daftar (useragent = "zzzz")). Lihat juga omegahat.org/RCurl/FAQ.html bagian "Runtime" untuk alternatif dan diskusi lainnya.
belajar

25

Paket rvestbersama xml2adalah paket populer lainnya untuk mem-parsing halaman web html.

library(rvest)
theurl <- "http://en.wikipedia.org/wiki/Brazil_national_football_team"
file<-read_html(theurl)
tables<-html_nodes(file, "table")
table1 <- html_table(tables[4], fill = TRUE)

Sintaks lebih mudah digunakan daripada xmlpaket dan untuk sebagian besar halaman web paket menyediakan semua opsi yang dibutuhkan.


Read_html memberi saya file kesalahan "': ///Users/grieb/Auswertungen/tetyana-snp-2016/data/snp-nexus/15/SNP%20Annotation%20Tool.html' tidak ada di direktori kerja saat ini (' / Pengguna / grieb / Auswertungen / tetyana-snp-2016 / kode '). "
scs
Dengan menggunakan situs kami, Anda mengakui telah membaca dan memahami Kebijakan Cookie dan Kebijakan Privasi kami.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.