pydot dan graphviz error: Tidak dapat mengimpor dot_parser, pemuatan file dot tidak dapat dilakukan

Ketika saya menjalankan kode yang sangat sederhana dengan pydot

import pydot
graph = pydot.Dot(graph_type='graph')

for i in range(3):

  edge = pydot.Edge("king", "lord%d" % i)
  graph.add_edge(edge)

vassal_num = 0
for i in range(3):
  for j in range(2):
    edge = pydot.Edge("lord%d" % i, "vassal%d" % vassal_num)
    graph.add_edge(edge)
    vassal_num += 1

graph.write_png('example1_graph.png')

Ini mencetak saya pesan kesalahan:

Couldn't import dot_parser, loading of dot files will not be possible.

Saya menggunakan python 2.7.3

Jawaban untuk pydot >= 1.1:

Ketidakcocokan (upstream) pydottelah diperbaiki oleh 6dff94b3f1 , dan dengan demikian pydot >= 1.1akan kompatibel denganpyparsing >= 1.5.7 .

Jawaban berlaku untuk pydot <= 1.0.28:

Bagi siapa pun yang menemukan ini, itu karena perubahan pyparsing dari 1.x ke rilis 2.x. Untuk menginstal pydot menggunakan pip, instal pyparsing versi lama terlebih dahulu:

pip install pyparsing==1.5.7
pip install pydot==1.0.28

Jika Anda tidak menginstal pyparsingmenggunakan pip, tetapi malah digunakan setup.py, lihat solusi ini untuk menghapus paket. Terima kasih @qtips.

Ada paket baru di repo pip yang disebut pydot2 yang berfungsi dengan benar dengan pyparsing2. Saya tidak dapat menurunkan versi paket saya karena matplotlib bergantung pada paket pyparsing yang lebih baru.

Catatan: python2.7 dari macports

pydot menggunakan variabel modul privat (_noncomma) dari pyparsing. Diff di bawah ini memperbaikinya untuk digunakan untuk pyparsing 2.0.1:

diff --git a/dot_parser.py b/dot_parser.py
index dedd61a..138d152 100644
--- a/dot_parser.py
+++ b/dot_parser.py
@@ -25,8 +25,9 @@ from pyparsing import __version__ as pyparsing_version
 from pyparsing import ( nestedExpr, Literal, CaselessLiteral, Word, Upcase, OneOrMore, ZeroOrMore,
     Forward, NotAny, delimitedList, oneOf, Group, Optional, Combine, alphas, nums,
     restOfLine, cStyleComment, nums, alphanums, printables, empty, quotedString,
-    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, _noncomma, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )
+    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )

+_noncomma = "".join( [ c for c in printables if c != "," ] )

 class P_AttrList:

Saya membuat fork repositori pydot [1], menerapkan patch Gabi Davar dan beberapa perubahan untuk mendukung python-3. Paket ini tersedia di PyPI [2].

Bersulang

• [1] https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32
• [2] https://pypi.python.org/pypi/pydot2

$ sudo pip uninstall pydot

$ sudo pip install pydot2

Lihat tautan berikut: http://infidea.net/troubleshooting-couldnt-import-dot_parser-loading-of-dot-files-will-not-be-possible/

Solusinya bukanlah menginstal pydot dari suatu tempat, tetapi "python-pydot" dari repositori resmi ubuntu.

Sekarang ada setidaknya 2 versi lagi yang tampaknya mendukung PyParsing-2 dan Python-3:

• PyDotPlus oleh Carlos Jenkins dengan travis buildbot yang bagus dan dokumentasi yang mewah . Namun Anda perlu mengubah nama foldernya dari site-packages\pydotplusmenjadi site-packages\pydotagar dapat bekerja dengan program yang ada yang mengimpor pydot.
• pydot3k oleh bmcorser . Sayangnya, tidak berhasil!
• prologic / pydot oleh James Mills ditautkan dari halaman kode resmi Google pydot sebagai ...

  cabang untuk kompatibilitas Python 3

• dan berikut ini tautan yang berfungsi ke pydot2 David Villa yang berfungsi dengan baik: https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32

Saya mengalami masalah lagi dan solusi saya di atas tidak berhasil. Jika itu benar untuk Anda dan Anda juga menggunakan Anaconda di Mac dengan El Capitan, coba ini:

conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG graphviz`
conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG pydot

Apa yang saya lakukan di akhir setelah begitu banyak percobaan dari apa yang saya lihat di sini (urutan semu agar berfungsi untuk networkx):

apt-get remove python-pydot
pip install pydotplus
apt-get install libcgraph6
apt-get install python-pygraphviz


# pip freeze | grep pydot
 pydotplus==2.0.2
# pip freeze | grep pyparsing
pyparsing==2.2.0
# pip freeze | grep graphviz
pygraphviz==1.2
# python -c 'import pydotplus'
#

Ini berhasil untuk saya (Mac OS X 10.9 dengan Python 2.7.10 di Anaconda):

conda uninstall pydot

Kemudian,

conda install pydot

Pyparsing kemudian diturunkan (dari 2.x ke 1.5.7) setelah instalasi pydot. Karyawan Google Masa Depan: ini memungkinkan saya menginstal dan mengimpor Theano dengan benar.

Di OSX Mavericks, berikut ini melakukan triknya ... Saya mendapat kesalahan yang sama tetapi di bagian bawah ada juga keluhan bahwa graphviz dapat dieksekusi tidak ada ... Saya pikir masalahnya adalah saya telah menginstal graphviz sebelum modul lain?

brew uninstall graphviz
brew install graphviz

Ketika solusi lain tidak berfungsi, ini adalah metode cepat dan kotor untuk menyelesaikan masalah:

Contoh ini dari python 2.7 di Ubuntu 16.04.

Edit file python2.7 / site-packages / keras / utils / visualize_util.py dan beri komentar pada segmen kode di bawah.

if not pydot.find_graphviz():
    raise ImportError('Failed to import pydot. You must install pydot'
                      ' and graphviz for `pydotprint` to work.')

find_graphviz () redundan pada versi pydot yang lebih baru, dan panggilan di atas tidak berfungsi.

Saya juga menemui masalah dan pydot saya == 1.0.28 saat pyparsing == 2.2.0. Saya memperbaiki masalah dengan mengunduh pydot 1.2.3 (tar.gz) terbaru dari google dan kemudian menginstalnya secara offline. Ketika saya memperbarui pydot di ubuntu 14.04, dikatakan bahwa pydot 1.0.28 adalah versi terbaru. Oleh karena itu saya mendownload dari google versi 1.2.3.

Anda perlu menurunkan pyparsing dari versi 2.x ke versi 1.5.7 agar pydot berfungsi dengan benar.

Untuk win-64, menggunakan Conda, ini berhasil untuk saya:

conda install -c https://conda.anaconda.org/Trentonoliphant pyparsing=1.5.7

Saya kemudian menonaktifkan / mencopot pemasangan versi 2.x dan memuat ulang pyparsing di skrip saya:

pyparsing = reload(pyparsing)
pydot = reload(pydot)

Untuk memeriksa apakah Anda menjalankan versi yang benar:

print pyparsing.__version__