Susun ulang bilah di geom_bar ggplot2


119

Saya mencoba membuat bar-plot dimana plot diurutkan dari miRNAyang paling tinggi valueke yang miRNApaling rendah. Mengapa kode saya tidak berfungsi?

> head(corr.m)

        miRNA         variable value
1    mmu-miR-532-3p      pos     7
2    mmu-miR-1983        pos    75
3    mmu-miR-301a-3p     pos    70
4    mmu-miR-96-5p       pos     5
5    mmu-miR-139-5p      pos    10
6    mmu-miR-5097        pos    47

ggplot(corr.m, aes(x=reorder(miRNA, value), y=value, fill=variable)) + 
  geom_bar(stat="identity")

Jawaban:


216

Kode Anda berfungsi dengan baik, kecuali bahwa barplot diurutkan dari rendah ke tinggi. Saat Anda ingin memesan bar dari tinggi ke rendah, Anda harus menambahkan -tanda sebelum value:

ggplot(corr.m, aes(x = reorder(miRNA, -value), y = value, fill = variable)) + 
  geom_bar(stat = "identity")

pemberian yang mana:

masukkan deskripsi gambar di sini


Data yang digunakan:

corr.m <- structure(list(miRNA = structure(c(5L, 2L, 3L, 6L, 1L, 4L), .Label = c("mmu-miR-139-5p", "mmu-miR-1983", "mmu-miR-301a-3p", "mmu-miR-5097", "mmu-miR-532-3p", "mmu-miR-96-5p"), class = "factor"),
                         variable = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "pos", class = "factor"),
                         value = c(7L, 75L, 70L, 5L, 10L, 47L)),
                    class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"))

itu tidak dipesan di plot saya karena alasan tertentu
user3741035

@ user3741035 Aneh. Apakah Anda menggunakannya pada contoh kumpulan data yang Anda berikan di atas atau di seluruh kumpulan data?
Jaap

Versi R & ggplot manakah yang Anda gunakan? Dapatkah Anda juga memberikan sampel kumpulan data yang lebih besar (sebaiknya dengan lebih dari satu nilai untuk variable)?
Jaap

6
menemukan solusinya: Saya telah memuat perpustakaan (gplots) yang mengacaukan banyak hal
user3741035

1
@maycca Ini memberi saya hasil yang benar (pada OSX 10.10.4 / Windows 7, R 3.2.3 & ggplot2 2.1.0). Mungkin Anda harus memulai dengan sesi baru?
Jaap
Dengan menggunakan situs kami, Anda mengakui telah membaca dan memahami Kebijakan Cookie dan Kebijakan Privasi kami.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.