Menghasilkan PNG dengan matplotlib ketika DISPLAY tidak ditentukan

Saya mencoba menggunakan networkx dengan Python. Ketika saya menjalankan program ini ia mendapatkan kesalahan ini. Apakah ada yang hilang?

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Saya mendapatkan kesalahan yang berbeda sekarang:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Saya mendapatkan kesalahan yang berbeda sekarang:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Masalah utama adalah bahwa (pada sistem Anda) matplotlib memilih backend x-using secara default. Saya baru saja mengalami masalah yang sama pada salah satu server saya. Solusi bagi saya adalah menambahkan kode berikut di tempat yang dapat dibaca sebelum impor pylab / matplotlib / pyplot lainnya :

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')

Alternatifnya adalah mengaturnya di .matplotlibrc Anda

Sama seperti pelengkap dari jawaban Reinout.

Cara permanen untuk memecahkan masalah semacam ini adalah dengan mengedit file .matplotlibrc. Temukan via

>>> import matplotlib
>>> matplotlib.matplotlib_fname()
# This is the file location in Ubuntu
'/etc/matplotlibrc'

Kemudian modifikasi backend di file itu menjadi backend : Agg. Hanya itu saja.

Jawaban bersihnya adalah mengambil sedikit waktu dengan benar mempersiapkan lingkungan eksekusi Anda.

Teknik pertama yang harus Anda persiapkan untuk lingkungan eksekusi Anda adalah dengan menggunakan matplotlibrcfile, seperti yang direkomendasikan oleh Chris Q. , pengaturan

backend : Agg

dalam file itu. Anda bahkan dapat mengontrol - tanpa perubahan kode - bagaimana dan di mana matplotlib mencari dan menemukanmatplotlibrc file .

Teknik kedua yang harus Anda persiapkan untuk lingkungan eksekusi Anda adalah dengan menggunakan MPLBACKENDvariabel lingkungan (dan beri tahu pengguna Anda untuk menggunakannya):

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>

Ini berguna karena Anda bahkan tidak perlu menyediakan file lain pada disk untuk membuatnya berfungsi. Saya telah menggunakan pendekatan ini dengan, misalnya, pengujian dalam integrasi berkelanjutan, dan berjalan pada mesin jarak jauh yang tidak memiliki tampilan.

Hard-coding backend matplotlib Anda ke "Agg" dalam kode Python Anda seperti bashing pasak persegi ke dalam lubang bundar dengan palu besar, ketika, sebaliknya, Anda bisa saja mengatakan matplotlib itu perlu lubang persegi.

Saya mendapat kesalahan saat menggunakan matplotlib melalui Spark. matplotlib.use('Agg')tidak bekerja untuk saya. Pada akhirnya, kode berikut ini berfungsi untuk saya. Lebih lanjut di sini

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')

Saya hanya akan mengulangi apa yang dikatakan @Ivo Bosticky yang bisa diabaikan. Masukan garis-garis ini di sangat mulai dari file py.

import matplotlib
matplotlib.use('Agg') 

Atau seseorang akan mendapatkan kesalahan

* / usr / lib / pymodules / python2.7 / matplotlib / __ init__.py:923: UserWarning: Panggilan ini ke matplotlib.use () tidak memiliki efek
karena backend telah dipilih;
matplotlib.use () harus dipanggil * sebelum * pylab, matplotlib.pyplot, *

Ini akan menyelesaikan semua masalah Tampilan

Saya menemukan potongan ini berfungsi dengan baik ketika beralih antara lingkungan X dan tidak-X.

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

Saat masuk ke server untuk menjalankan kode, gunakan ini sebagai gantinya:

ssh -X username@servername

itu -Xakan menghilangkan nama tampilan dan tidak ada kesalahan variabel lingkungan $ DISPLAY

:)

Sistem apa yang Anda pakai? Sepertinya Anda memiliki sistem dengan X11, tetapi variabel lingkungan DISPLAY tidak diatur dengan benar. Coba jalankan perintah berikut dan jalankan kembali program Anda:

export DISPLAY=localhost:0

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

Ini bekerja untuk saya.

Satu hal lagi yang perlu diperiksa adalah apakah pengguna Anda saat ini berwenang untuk terhubung ke layar X. Dalam kasus saya, root tidak diizinkan untuk melakukan itu dan matplotlib mengeluh dengan kesalahan yang sama.

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm

sumber: http://www.debian-administration.org/articles/494 https://debian-administration.org/article/494/Getting_X11_forwarding_through_ssh_working_after_running_su

Untuk memastikan kode Anda portabel di Windows, Linux dan OSX dan untuk sistem dengan dan tanpa tampilan, saya sarankan cuplikan berikut:

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt

Kredit: https://stackoverflow.com/a/45756291/207661

Untuk Mesin Pembelajaran Mesin Google Cloud:

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages

Dan kemudian untuk mencetak ke file:

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()

dan untuk membuat PDF:

multi_page(report_name)