Perbedaan antara R MarkDown dan R NoteBook

Saya mencoba memahami pada tingkat tinggi apa perbedaan antara R Markdowndan R NoteBook. Saya tahu mereka saling terkait tetapi saya ingin mencari tahu bagaimana mereka terkait. Pemahaman saya adalah ini:

Saya tahu R Notebook benar-benar dokumen R Markdown tetapi saya bingung tentang terminologinya.

Opsi file baru RStudio memiliki keduanya R Markdowndan R NoteBookdan memilih salah satunya membuka R Markdownfile tetapi dengan perbedaan kecil. Jadi hanya mencoba mencari tahu mengapa ada dua opsi dan apa perbedaan antara keduanya?

Saya mengerti R Notebook baru saja diperkenalkan dan R Markdown telah ada untuk sementara waktu. Bagian dari kebingungan bisa jadi karena saya tidak pernah menggunakan R Markdownsebelum R Notebook diperkenalkan sehingga pertanyaan terkait atau lebih spesifik saya

Apa yang dilakukan R NoteBook berbeda dari hanya menggunakan R MarkDown atau kemampuan baru apa yang dibawa R NoteBook?

Semua hit saya di pencarian web menunjukkan bahwa R Notebook menggunakan R Markdown tetapi saya tidak menemukan bantuan apa pun yang secara khusus berbeda di antara keduanya.

Sejauh yang saya mengerti dan dari pengaturan saya tidak ada perbedaan pengkodean. Perbedaannya ada pada rendering. Ekstensi file sama.

Ketika Anda membuat R Notebook baru itu menambahkan html_notebookdalam opsi output di header. Itulah bedanya. Anda kemudian dapat melihat pratinjau rendering dengan cepat tanpa harus merajutnya. Itu juga menyegarkan pratinjau setiap kali Anda menyimpan. Namun dalam pratinjau itu Anda tidak memiliki output kode (tidak ada angka, tidak ada tabel ..) (setidaknya di setup saya). Tanpa html_notebookdi output tidak ada pratinjau tombol

karena Anda dapat melihat opsi Pratinjau muncul tetapi Anda juga dapat merajutnya dalam format apa pun yang Anda inginkan. Ini akan menambahkannya ke kode header ketika Anda melakukannya.

Namun jika Anda tidak memilikinya html_notebookdi tajuk, Anda hanya dapat merajut kode Anda untuk melihat seperti apa (seluruh buku) (abaikan opsi default tambahan yang saya masukkan ke dalam gambar)

dan opsi untuk melihat dulu tidak muncul di menu drop down

Kalau tidak, ia bekerja sama. Untuk beberapa konfigurasi default, output juga disembunyikan secara default di bagian kode.

Perhatikan bahwa Anda dapat mencampur beberapa opsi output di header Anda sehingga Anda dapat menyimpan pratinjau dan mempertahankan opsi rajutan Anda untuk ekspor.

Baru-baru ini saya menemukan posting ini yang membuat saya jelas tentang masalah R Markdown vs R Notebook. http://uc-r.github.io/r_notebook

Berikut adalah beberapa baris yang relevan:

Menulis dokumen R Notebook tidak berbeda dengan menulis dokumen R Markdown. Sintaks potongan teks dan kode tidak berbeda dari yang Anda pelajari di tutorial Markdown R. Perbedaan utama adalah pada interativeness R Notebook. Utamanya ketika mengeksekusi potongan dalam dokumen R Markdown, semua kode dikirim ke konsol sekaligus , tetapi dalam R Notebook, hanya satu baris pada satu waktu yang dikirim . Ini memungkinkan eksekusi untuk berhenti jika suatu baris menimbulkan kesalahan.

Juga ada ini pada rajutan vs pratinjau saat Anda membuat R Notebook di RStudio:

Pratinjau menunjukkan kepada Anda salinan HTML yang diberikan dari konten editor. Akibatnya, tidak seperti Knit , Preview tidak menjalankan potongan kode R. Sebagai gantinya, output dari chunk ketika dijalankan terakhir di editor ditampilkan.

Semoga bermanfaat.

Salah satu perbedaan terpenting tidak sepenuhnya jelas dari jawaban di atas.

Dari Bagian 3.2.1.3 dari buku Bookdown :

Ada juga Restart R and Run All Chunksitem di Runmenu pada bilah alat editor, yang memberi Anda sesi R baru sebelum menjalankan semua potongan. Ini mirip dengan Knittombol, yang meluncurkan sesi R terpisah untuk mengkompilasi dokumen.

Dengan kata lain, merajut menciptakan lingkungan baru dan menjalankan semua kode di sana. Sebaliknya, Notebook R menggunakan Lingkungan Global sebagaimana adanya untuk membuat file HTML. Bahkan, untuk R Notebook, perubahan pada file HTML terjadi setiap kali .Rmddokumen disimpan. The Previewtombol hanya membuka file HTML dalam keadaan saat ini. Tidak ada kode yang dijalankan. Previewsecara harfiah berarti apa yang dikatakannya: itu hanya menunjukkan kepada Anda apa yang telah dilakukan.

Mengapa ini penting? Misalnya, jika .Rmdfile R Notebook dibuka, tetapi tidak ada potongan kode yang dijalankan, maka file HTML akan membuat semua markdown dan kode input baik-baik saja, tetapi tidak ada output yang akan muncul. Atau, misalkan Anda mendefinisikan beberapa variabel xdi Konsol, tetapi tidak dalam potongan kode. Jika Anda mencoba menggunakan xsuatu tempat di Notebook R, itu akan berfungsi dengan baik. Pratinjau dokumen HTML juga akan berfungsi dengan baik. Di sisi lain, merajut dokumen akan menghasilkan kesalahan "variabel tidak dikenal" karena merajut menjalankan semua kode di lingkungan baru, dan variabel xtidak pernah didefinisikan dalam file penurunan harga di mana pun.

Perbedaannya adalah bahwa di R Notebok Anda dapat menulis Markdown dan R-code Chunks dan langsung menjalankannya dan melihat hasilnya segera. Ini semacam Notebook untuk Anda sendiri.

R Markdown ada untuk membuat output yang terlihat bagus dalam html, pdf, atau dokumen Word. Menggabungkan Penurunan Harga dan R-Code-Chunks. Pengantar dan motivasi singkat dapat ditemukan di sini .

Jika Anda ingin mendapatkan info lebih lanjut tentang Paket rajutan klik di sini.

Inilah satu perbedaan praktis yang saya temukan:

Ketika Anda perlu mengomentari sebagian teks, RMarkdown menyisipkan #di setiap baris teks Anda, sedangkan RNotebook merangkum teks dengan rapi di antara sepasang tanda <!--, --->(seperti dalam file html)

Bisa dikatakan, apa perbedaan sepele. Namun, hanya karena itu, saya sekarang selalu menggunakan R Notebook (bukan RMarkdown) di RStudio untuk semua dokumen saya. Dalam hal lain, mereka tampak sama (setidaknya untuk kebutuhan saya, seperti menghasilkan html dan pdf)

Jika tidak, komentar saya tiba-tiba menjadi tajuk, seperti di bawah ini:

# This part is commented out, but will show as Heading 1 font text

http://rmarkdown.rstudio.com/r_notebooks.html#notebook_file

"Dokumen R Markdown biasa adalah" rajutan ", tetapi notebook" pratinjau ". Sementara pratinjau notebook terlihat mirip dengan dokumen R Markdown yang diberikan, pratinjau notebook tidak mengeksekusi potongan kode R apa pun"

Persamaan: Dokumen R notebook dan Markdown R cukup mirip. Format penurunan harga berfungsi di kedua jenis file. Kedua format file dapat digunakan untuk mengkomunikasikan kode bersama dengan hasil dan komentar kepada orang lain. Seseorang dapat memilih untuk merajut dokumen yang dibuat ke format output HTML, PDF dan WORD. Jika ada kesalahan dalam kode, output tidak akan dihasilkan. Untuk menjalankan file: CTRL + SHIFT + K dan untuk memasukkan potongan kode: CTRL + ALT + I.

Dokumen R Markdown: Dokumen Rmd dapat dikonfigurasi melalui wizard dan memiliki opsi untuk dokumen yang dapat direproduksi, slide presentasi, aplikasi mengkilap, dll, dan opsi untuk membuat dokumen dari templat. Jika Anda mengubah kode, ouput dijalankan dalam output Rmd. Itu tidak menawarkan opsi untuk Pratinjau dokumen. Header YAML memiliki format output sebagai: output: html_document

R Notebook Document: Dokumen R nb diluncurkan langsung dan tidak ada panduan (seperti dalam kasus .RMD) muncul. Bersamaan dengan file notebook, file html tambahan yang ekstensi * .nb.html dihasilkan. Notebook ini memiliki opsi untuk Pratinjau. Jika ada kode yang diubah atau diedit, output baru tidak ditampilkan. Outputnya ditampilkan dalam editor kode itu sendiri. Apapun output lama itu hanya diberikan. Tidak ada output baru yang dihasilkan dari perubahan kode. Untuk menampilkan output kode, kita perlu menjalankan chunk dan kemudian akan muncul di output. Header YAML memiliki output sebagai: output: html_notebook

Header YAML : Jika kita mengubah header YAML dari satu file ke yang lain, itu akan mengubah jenis dokumen. Misalnya, Anda memiliki buku catatan R yang memiliki tajuk YAML sebagai html_notebook. Jika Anda mengubah tajuk YAML, R notebook Anda akan dikonversi menjadi dokumen R Markdown.

Jika Anda harus memilih satu, pergi dengan dokumen RMarkdown karena ia menawarkan lebih banyak kontrol dan memperbarui dokumen segera setelah Anda merajutnya.

Dari jrnold :

File notebook R menunjukkan output di dalam editor, sambil menyembunyikan konsol. File penurunan harga menunjukkan output di dalam konsol, dan tidak menunjukkan output di dalam editor. Mereka berbeda dalam nilai output di header YAML mereka.
Header YAML untuk notebook R akan memiliki garis,

---
ouptut: html_notebook
---

Header YAML untuk file penurunan harga R akan memiliki baris,

ouptut: html_document

Menyalin header YAML dari notebook R ke file markdown R mengubahnya menjadi file markdown R, dan sebaliknya. Lebih khusus lagi, mengubah nilai outputmenjadi Ini karena RStudio IDE saat membuka dan paket rmarkdown saat merajut menggunakan header YAML file, dan khususnya nilai outputkunci di header YAML, untuk menentukan jenis dokumen apa itu adalah.