Nested versus non-nested dapat berarti banyak hal. Anda memiliki desain bersarang versus desain bersilang (lihat misalnya penjelasan ini ). Anda memiliki model bersarang dalam perbandingan model. Nested berarti di sini bahwa semua persyaratan model yang lebih kecil terjadi dalam model yang lebih besar. Ini adalah kondisi yang diperlukan untuk menggunakan sebagian besar uji perbandingan model seperti tes rasio kemungkinan.
Dalam konteks model bertingkat saya pikir lebih baik untuk berbicara tentang faktor bersarang dan tidak bersarang. Perbedaannya terletak pada bagaimana faktor-faktor yang berbeda terkait satu sama lain. Dalam desain bersarang, level satu faktor hanya masuk akal di dalam level faktor lain.
Katakanlah Anda ingin mengukur produksi oksigen daun. Anda mencicipi sejumlah spesies pohon, dan pada setiap pohon Anda mencicipi beberapa daun di bagian bawah, di tengah dan di atas pohon. Ini adalah desain bersarang. Perbedaan daun pada posisi berbeda hanya masuk akal dalam satu spesies pohon. Jadi membandingkan daun bagian bawah, daun tengah dan daun atas di semua pohon adalah tidak masuk akal. Atau dikatakan berbeda: posisi daun tidak boleh dimodelkan sebagai efek utama.
Faktor non-bersarang adalah kombinasi dari dua faktor yang tidak terkait. Katakanlah Anda mempelajari pasien, dan tertarik pada perbedaan usia dan jenis kelamin. Jadi, Anda memiliki ageclass faktor dan faktor gender yang tidak terkait. Anda harus memodelkan usia dan jenis kelamin sebagai efek utama, dan Anda dapat melihat interaksi jika perlu.
Perbedaannya tidak selalu jelas. Jika dalam contoh pertama saya, spesies pohon terkait erat dalam bentuk dan fisiologi, Anda dapat mempertimbangkan posisi daun juga sebagai efek utama yang valid. Dalam banyak kasus, pilihan untuk desain bersarang versus desain non-bersarang lebih merupakan keputusan peneliti daripada fakta sebenarnya.