Uji chi-squared dengan 0 nilai yang diharapkan

Tabel kontingensi saya:

         heterozygous homozygous.minor homozygous.major
observed    2                 0               3
expected    0                 0               5

Populasi yang diharapkan hanya terdiri dari genotipe AA, tetapi dalam populasi yang diamati kami mengamati 2 genotipe AB. Untuk menghitung Chi-sq untuk ini saya hanya akan mengabaikan dua kasus di mana yang diharapkan = 0? Jadi saya akan melakukan:

$(3-5)^2/5=0.8$

chi-squared

— crysis405
sumber

Jika yang diharapkan sebenarnya nol dan yang diamati bukan nol, nilai chi-square akan menjadi tak terbatas. Ini sebagaimana mestinya: Anda mengamati sesuatu yang menurut model tidak mungkin, sehingga harus otomatis ditolak. Mungkin Anda harus mengatakan lebih banyak tentang bagaimana nilai yang diharapkan diperoleh.

— Glen_b -Reinstate Monica

Apakah itu tak terhingga atau 1,6 tergantung pada apakah nilai yang diharapkan adalah 0 karena tidak mungkin atau karena alasan lain. Saya setuju dengan kalimat terakhir Anda.

— Peter Flom

@PeterFlom Saya merujuk ke sel paling kiri, yang memiliki kontribusi statistik dari .

χ^{2}

$\chi^2$

(2 - 0)^{2} / 0 = 4 / 0

$(2-0)^2/0 = 4/0$

— Glen_b -Reinstate Monica

Intinya di sini tetap bagaimana frekuensi yang diharapkan dihitung. Kalau tidak, semua bukti menunjukkan bahwa sesuatu yang dianggap mustahil telah terjadi. Ada pilihan cara melaporkan ini: Anda mungkin ingin mengatakan bahwa hipotesis harus ditolak, atau Anda mungkin ingin mengatakan bahwa tes itu tidak berlaku, yang mungkin lebih mungkin.

— Nick Cox

Ya kalian benar. Kedua heterozigot adalah kesalahan mendelian yang membuatnya tidak mungkin.

— crysis405

Anda hanya akan mengabaikan angka 0 jika ada alasan (bukan alasan statistik) untuk melakukannya; tetapi termasuk itu hanya akan mengubah derajat kebebasan karena (0-0), tentu saja, 0. Namun, saya tidak yakin Anda ingin chi-square di sini sama sekali. Itu akan tergantung pada mengapa Anda hanya mengharapkan genotipe AA.

Jika Anda tidak ingin chi-square, itu akan menjadi

$\frac{(2-0)^2}{0} + \frac{(3-5)^2}{5} = \infty$

— Peter Flom
sumber

Perkiraan ChiSquare tidak valid ketika jumlah sel kecil. Coba uji eksak Fisher, menggunakan distribusi probabilitas multinomial.

Wiki: https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%27s_exact_test

— RL Rogers
sumber