Model efek campuran linier tidak umum digunakan di sudut biologi saya, dan saya perlu melaporkan uji statistik yang saya gunakan dalam makalah yang saya coba tulis. Saya tahu bahwa kesadaran pemodelan multilevel mulai muncul di beberapa bidang biosains ( Solusi untuk ketergantungan: menggunakan analisis multilevel untuk mengakomodasi data bersarang ), tetapi saya masih mencoba mempelajari cara melaporkan hasil saya!
Desain eksperimental saya, secara singkat:
* Subjek ditugaskan ke salah satu dari empat kelompok perlakuan
* Pengukuran variabel dependen diambil pada berbagai hari setelah dimulainya pengobatan
* Desain tidak seimbang (jumlah subjek yang tidak sama dalam kelompok perlakuan, dan hilang pengukuran untuk beberapa subjek pada beberapa hari)
* Pengobatan A adalah kategori referensi
* Saya memusatkan data pada hari terakhir perawatan
Saya ingin tahu apakah Pengobatan A (kategori referensi) menghasilkan hasil yang jauh lebih baik daripada perawatan lain (pada akhir pengobatan).
Saya melakukan analisis saya di R, menggunakan nlme:
mymodel <- lme(dv ~ Treatment*Day, random = ~1|Subject, data = mydf, na.action = na.omit,
+ correlation = corAR1(form = ~1 |Subject), method = "REML")
Dan hasilnya (sebagian; dipotong untuk singkatnya) adalah:
>anova(mymodel)
numDF denDF F-value p-value
(Intercept) 1 222 36173.09 <.0001
Treat 3 35 16.61 <.0001
Day 7 222 3.43 0.0016
Treat:Day 21 222 3.62 <.0001
>summary(mymodel)
Fixed effects: dv ~ Treatment * Day
Value Std.Error DF t-value p-value
(Intercept) 7.038028 0.1245901 222 56.48945 0.0000
TreatmentB 0.440560 0.1608452 35 2.73903 0.0096
TreatmentC 0.510214 0.1761970 35 2.89570 0.0065
TreatmentD 0.106202 0.1637436 35 0.64859 0.5208
Jadi, saya tahu bahwa efek Hari berbeda dengan Pengobatan, dan bahwa, pada hari terakhir pengobatan (di mana data dipusatkan), dv berbeda secara signifikan dalam Pengobatan A daripada Pengobatan B atau C.
Apa yang ingin saya katakan adalah: "Seperti yang diperkirakan, kami menemukan bahwa Variabel Dependen secara signifikan lebih rendah pada subjek yang menerima Pengobatan A (rata-rata +/- SE) daripada pada subyek yang menerima Pengobatan B (rata-rata +/- SE, p = 0,0096) atau Pengobatan C (rata-rata +/- SE, p = 0,0065), yang diukur pada hari terakhir perawatan. "
Tapi, saya harus menunjukkan tes statistik apa yang dilakukan. Apakah ini akan menjadi cara yang dapat diterima untuk menggambarkan analisis? "[Metode Pengukuran] dilakukan pada hari yang ditunjukkan dan Variabel Dependen (unit) ditentukan; kami menganalisis data log-transformed menggunakan model efek campuran linier yang berpusat pada [hari terakhir perawatan]. Simbol mewakili rata-rata dv; bar kesalahan adalah kesalahan standar. Pada hari terakhir pengobatan, dv secara signifikan lebih rendah pada Pengobatan A (rata-rata +/- SE) daripada Pengobatan B (rata-rata +/- SE, p = 0,0096) ... "
Secara khusus,
* Apakah itu cukup mengatakan tentang uji statistik yang digunakan? (Pembaca terbiasa melihat sesuatu yang lebih seperti "mean +/- SE, p = 0,0096, uji-t Student," tetapi tampaknya aneh untuk menulis "p = 0,0096, koefisien untuk Pengobatan B vs Pengobatan A dari efek campuran linier model di [hari terakhir perawatan]. ")
* Apakah ada cara yang lebih baik untuk mengatakan ini?
(Bagian metode akan mencakup lebih banyak informasi tentang statistik: "Data [Metode Pengukuran] dianalisis menggunakan paket R dan R ... Kami menganalisis data Variabel Dependen yang ditransformasi log dengan menggunakan model efek campuran linier menggunakan Subjek sebagai efek acak dan struktur autokorelasi orde 1 (AR1). Sebagai efek tetap, kami menyertakan Pengobatan dan Hari, dan interaksi Pengobatan dan Hari. Kami memeriksa normalitas dan homogenitas dengan inspeksi visual plot residu terhadap nilai-nilai pas. Untuk menilai validitas dari analisis efek campuran, kami melakukan tes rasio kemungkinan membandingkan model dengan efek tetap ke model nol dengan hanya efek acak. ")
Setiap saran tentang cara melaporkan hasil model efek campuran linier untuk audiens yang sering menolak statistik (dan ditulis oleh pemula statistik relatif) akan sangat dihargai!