Pertanyaan yang diberi tag «gwas»

Dalam studi asosiasi genom-luas (GWAS): Apa komponen utama? Mengapa mereka digunakan? Bagaimana mereka dihitung? Bisakah studi asosiasi genome dilakukan tanpa menggunakan PCA?

20 pca  genetics  gwas 

Ambil 20 titik acak dalam ruang 10.000 dimensi dengan setiap koordinat iid dari . Bagi mereka menjadi 10 pasangan ("pasangan") dan tambahkan rata-rata setiap pasangan ("anak") ke dataset. Kemudian lakukan PCA pada 30 poin yang dihasilkan dan plot PC1 vs PC2.N(0,1)N(0,1)\mathcal N(0,1) Suatu hal yang luar biasa terjadi: setiap "keluarga" …

9 pca  python  high-dimensional  genetics  gwas