Kedengarannya seperti disk USB Anda diformat menggunakan tabel partisi GUID (GPT); partisi EFI merupakan bagian standar tentang cara format OS X disk dengan GPT, jadi mungkin tidak boleh dihapus. Yang saya duga Anda benar-benar inginkan, adalah mengganti GPT dengan tabel partisi master boot record (MBR).
Untuk mengubahnya di OS X, Anda perlu memformat ulang (menghapus) disk menggunakan Disk Utility. Di bilah sisi, pilih disk. Pastikan Anda memilih entri perangkat disk, bukan volume; volume akan berlekuk di bawah entri disk di sidebar. Info tentang disk yang dipilih akan dicantumkan di bagian bawah jendela Disk Utility, termasuk skema partisi. Jika itu GUID Partition Table (atau GUID Partition Map), Anda perlu menghapus disk. Jika tertulis Master Boot Record, sesuatu yang aneh terjadi karena partisi EFI seharusnya tidak ada di bawahnya. Jika ia mengatakan sesuatu tentang MS-DOS atau Windows, Anda memiliki volume yang dipilih daripada disk; coba lagi.
Dengan asumsi ini masalahnya, Anda dapat menghapus disk (sekali lagi, pastikan Anda memiliki disk, bukan volume yang dipilih; juga disk yang benar!). Akan ada menu pop-up "Format": pilih "MS-DOS (FAT)". Jika Anda menggunakan El Capitan, juga akan ada menu pop-up "Skema": pilih "Master Boot Record" (versi lama menganggap ini secara otomatis berdasarkan pilihan MS-DOS). Itu seharusnya membuat Anda disk dengan volume FAT32 tunggal, tanpa partisi EFI.
Perhatikan bahwa jika Anda menghapus hanya volume, bukan seluruh perangkat disk, itu akan meninggalkan skema partisi sendirian, dan partisi EFI tersembunyi akan tetap ada. Anda harus menghapus seluruh disk!