PDF.js adalah aplikasi web, bukan aplikasi yang dikompilasi, dan memerlukan kerangka Java dan beberapa komponen browser web agar berfungsi.
Berikut adalah diskusi tentang topik ini untuk penelitian lebih lanjut: https://groups.google.com/forum/#!topic/mozilla.dev.pdf-js/cDZwsFS1kio
Windows memang menawarkan kerangka kerja yang mungkin bisa Anda manfaatkan untuk ini, tetapi akan membutuhkan kompilasi PDF.js ke dalam file HTML, lalu ganti namanya menjadi .hta.
File HTA masih memanggil Internet Explorer, tetapi melakukannya dalam kerangka minimal yang terlihat dan berperilaku lebih seperti aplikasi biasa.
Maka Anda harus menemukan cara untuk memanggil masing-masing PDF atau harus ada browser file yang disertakan dalam produk yang dikompilasi, dan saya tidak yakin bagaimana cara kerjanya.