Anda dapat membuat cadangan dan memulihkan partisi sistem TrueCrypt jika Anda menggunakan perangkat lunak pencitraan yang mampu membaca dan menulis dalam mode mentah - menyalin seluruh partisi byte demi byte tanpa memperhatikan sistem file yang mendasarinya. Anda juga perlu mencadangkan MBR (master boot record), dan mungkin data antara MBR dan partisi pertama.
Dan Anda tidak boleh mencitrakannya saat menjalankan Windows, seperti dengan perangkat lunak gambar "hot running" seperti Acronis TrueImage. Anda harus mem-boot dari disk terpisah (CD atau drive eksternal) dengan perangkat lunak imaging Anda dan kemudian mengambil gambar.
Saya menggunakan Clonezilla untuk membuat cadangan dan memulihkan partisi root terenkripsi Linux dan MBR; Saya tidak mengerti mengapa itu tidak juga berfungsi dengan partisi terenkripsi TrueCrypt.
Terkadang masalahnya hanya dengan header partisi TrueCrypt, dan memulihkan hanya header yang mungkin memecahkan masalah. TrueCrypt menyediakan kemampuan untuk mencadangkan dan mengembalikan tajuk (Anda harus melakukan booting dengan cakram penyelamatan TrueCrypt atau CD Langsung lainnya untuk memulihkan tajuk).
Perangkat lunak apa yang Anda gunakan dalam upaya pencadangan dan pemulihan? Saya akan merekomendasikan Parted Magic, yang merupakan Live CD yang berisi utilitas pencitraan disk dan partisi (termasuk Clonezilla), dan juga termasuk TrueCrypt.