Yang terbesar adalah sistem file. Sayangnya, tidak peduli berapa banyak Anda defrag, ada file yang tidak akan dan tidak dapat diatur dengan benar. Akibatnya, komputer semakin sering digunakan file-file ini (seperti registri, file sistem kritis) tumbuh lebih besar dan lebih terfragmentasi, yang mengarah pada penurunan kinerja.
Kunci registri yang tidak valid juga merupakan masalah kinerja yang besar. Meskipun Anda telah menyebutkan bahwa Anda membersihkan registri secara teratur, Anda tidak memiliki cara untuk mengetahui bahwa apa yang Anda lakukan sebenarnya menghilangkan semua kunci yang tidak valid - kecuali jika Anda ingin mencari melalui registri dengan tangan, Anda mengandalkan apa yang oleh pembuat alat dianggap tidak sah.
(Yang mengatakan, pembersih registri seperti CCleaner mengagumkan, bahkan jika mereka mungkin kehilangan hal-hal yang mungkin saya hapus)
Juga, sistem file dapat mengalami masalah korupsi dari waktu ke waktu - biasanya orang melakukan format deskripsi ketika mereka menginstal ulang, yang menggantikan sistem file, dan biasanya setiap korupsi yang menyertainya.
Sayangnya, Windows seperti lemari arsip raksasa. Anda dapat melakukan yang terbaik untuk menjaganya tetap bersih dan teratur, tetapi pada akhirnya Anda hanya perlu merobek file Anda dan memulai dari awal lagi.
Edit: Molly menunjukkan beberapa alat yang luar biasa dalam komentar yang dapat membantu dalam mendefrag file sistem besar yang biasanya tidak dapat di-defrag (bahkan sepatah kata pun) oleh alat defrag normal. Alat-alat ini jika digunakan dengan benar, dapat membantu dalam memperpanjang format ulang itu.