Proyek https://reproducible-builds.org/ adalah semua tentang ini, dan berusaha keras untuk membuat jawaban atas pertanyaan Anda "tidak, mereka tidak akan berbeda" di banyak tempat sebanyak mungkin. NixOS dan Debian kini memiliki reproduksibilitas lebih dari 90% untuk paket mereka.
Jika Anda mengkompilasi biner, dan saya mengkompilasi biner, dan mereka sedikit-untuk-bit identik, maka saya dapat diyakinkan bahwa kode sumber dan alat-alat adalah apa yang menentukan output, dan bahwa Anda tidak menyelinap di beberapa kode trojan di sepanjang jalan.
Jika kita menggabungkan reproduktifitas dengan bootstrappability dari sumber yang dapat dibaca manusia, seperti yang dilakukan oleh http://bootstrappable.org/ , kita mendapatkan sistem yang ditentukan dari bawah ke atas oleh sumber yang dapat dibaca oleh manusia, dan hanya pada saat itulah kita berada pada titik di mana kita bisa percaya bahwa kita tahu apa yang dilakukan sistem.