Untuk NTFS, ruang selalu diambil (oleh Tabel File Master yang merupakan file tersembunyi khusus).
Tidak ada cara untuk membuatnya benar-benar kosong. Anda dapat sedikit memvariasikan ukuran MFT dengan menggunakan parameter yang berbeda saat memformat partisi NTFS.
(Windows menggunakan MFT yang cukup besar secara default, yang bagus pada harddisk normal dengan pola penggunaan umum, tetapi kadang-kadang tidak sangat efisien pada media yang dapat dilepas, atau pada disk server, yang memiliki pola penggunaan non-generik. )
Istilah BOOTMGR adalah herring merah. Utilitas khusus yang Anda gunakan mungkin selalu memanggil sektor pertama dari disk BOOOTMGR, apa pun yang benar-benar ada.
Biasanya 512 byte pertama berisi tabel partisi dan (opsional) tahap pertama bootmanager. Jika disk menggunakan sektor yang lebih besar dari 512 byte (4K dalam kasus Anda), sisa sektor pertama itu tidak digunakan.
Untuk FAT32, blok pertama yang bisa digunakan sebenarnya adalah sektor ke-2 dari disk dan itu juga akan berisi beberapa overhead sistem file. Folder pernah mengambil beberapa ruang. Itu juga berlaku untuk folder ROOT (kosong) disk.
Tidak ada cara untuk memiliki sistem file menjadi 100% kosong. Beberapa overhead selalu diperlukan.