Cara grep string yang sama dengan membandingkan dua file


9

Saya punya dua file file A dan file B

File A berisi semua informasi sementara file B berisi id informasi unik. Yang ingin saya lakukan adalah membandingkan kedua file dan mengambil informasi id dari file A

file A:

acb:A1S_1863    ncbi-proteinid:ABO12290
acb:A1S_1864    ncbi-proteinid:ABO12291
acb:A1S_1865    ncbi-proteinid:ABO12292
acb:A1S_0105    ncbi-proteinid:ABO10592
acb:A1S_0106    ncbi-proteinid:ABO10593

file B:

A1S_1865
A1S_1774
A1S_1116
A1S_0106
A1S_2677

output yang diinginkan:

acb:A1S_1865    ncbi-proteinid:ABO12292
acb:A1S_0106    ncbi-proteinid:ABO10593

Jawaban:


15

Dengan grep:

grep -Ff fileB fileA

-f <filename>memberitahu grepuntuk membaca pola dari file, dan -Fmembuatnya memperlakukan pola sebagai string tetap, bukan ekspresi reguler. (Ini dengan asumsi ID tidak muncul di kolom lain.)

Dengan menggunakan situs kami, Anda mengakui telah membaca dan memahami Kebijakan Cookie dan Kebijakan Privasi kami.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.