Menggabungkan kolom dari dua file terpisah

10

Bagaimana cara membuat file baru menggabungkan kolom selektif dari dua file terpisah menggunakan awk? Tanpa mengacaukan pesanan elemen file KEDUA.

Contoh: File 3 dapat berisi kolom 1,2,3 dari File 1 dan kolom 4 dari File 2.

File 1
A   23  8   T
A   63  9   9
B   45  3   J

File 2
A   0
A   6   
B   5

File 3
A   23  8   0
A   63  9   6
B   45  3   5

text-processing awk columns

— dovah
sumber

4

Coba ini:

$ awk 'FNR==NR{a[FNR]=$2;next};{$NF=a[FNR]};1' file2 file1
A 23 8 0
A 63 9 6
B 45 3 5

— cuonglm
sumber

Terima kasih! Saya juga berhasil mencoba jalan keluar ini menggunakan gawk:pr -m -t -s\ File1.txt File2.txt | gawk '{print $1,$2,$3, $6}' > File3.txt

— dovah

2

@Dovah: Anda dapat menggunakan paste file1 file2dan kemudian mencetak bidang yang dipilih di awk.

— cuonglm

Ini menyimpan file2dalam memori, yang bisa menjadi penghalang jika file berukuran besar. Ada cara yang lebih sederhana untuk melakukan ini tanpa overhead memori (lihat jawaban saya).

— Gilles 'SO- stop being evil'

17

Ada alat khusus untuk itu: paste. Ini menggabungkan setiap baris penuh dari file pertama dengan baris yang sesuai dari file kedua; Anda dapat menghapus kolom yang tidak diinginkan sebelum atau sesudah. Misalnya, dengan asumsi bahwa kolom Anda dibatasi-tab:

paste file1.txt file2.txt | cut -f 1,2,3,6

Berikut adalah cara untuk menyaring kedua file yang bergantung pada substitusi proses ksh / bash / zsh.

paste <(<file1.txt sed 's/[[:space:]][[:space:]]*[^[:space:]]*$//') \
      <(<file1.txt sed 's/^[^[:space:]]*[[:space:]][[:space:]]*//')

Awk terutama diarahkan untuk memproses satu file pada satu waktu, tetapi Anda dapat menelepon getlineuntuk membaca dari file lain secara paralel.

awk '
  BEGIN {file2=ARGV[2]; ARGV[2]="";}
  {$0 = $0 ORS getline(); print $1, $2, $3, $6;}
' file1.txt file2.txt

Sejauh ini saya berasumsi bahwa Anda ingin mencocokkan baris 1 dari file 1 dengan baris 1 dari file 2, baris 2 dari file 1 dengan baris 2 dari file 2, dll. Jika Anda ingin mencocokkan isi kolom, itu adalah hal yang sama sekali berbeda. joinakan melakukan pekerjaan asalkan kolom yang ingin Anda cocok diurutkan.

— Gilles 'SANGAT berhenti menjadi jahat'
sumber