Paralelisasi untuk loop


9

Saya ingin memparalelkan forloop dari kode berikut. Bagaimana cara melakukannya?

#!/bin/bash
N=$1 
n=$2
for (( i=1; i<=$N; i++ )); do
  min=100000000000000  //set min to some garbage value
  for (( j=1; j<=$n; j++ )); do
    val=$(/path/to/a.out)
    val2=`echo $val | bc`  

      if (( $val2 < $min )); then
        min=$val2; 
      fi
  done
  arr=("${arr[@]}" "$min")
done


Jawaban:


10
#!/bin/bash
# set -x # debug version
N=${1:-123}
n=${2:-45}
workers=${workers:-${3:-10}}
((workers < 1)) && ((workers = 1))
((workers > 20)) && ((workers = 20))

((min=100000000000000))  #set min to some garbage value

work() {
  for i in ${*}; do
    for (( j=1; j<=${n}; j++ )); do
      val=$(/path/to/a.out)
      val2=$(echo ${val} | bc)
      (( val2 < min )) && (( min = val2 ));
    done
    echo ${min}
    # # debug version
    # echo ${i} ${j} ${min}
  done
}

# --
arr=($(
  seq ${N} | xargs -n$[N/workers + 1] | while read i; do
    work ${i} &
  done
  wait
))
echo ${arr[*]}
# --

# # debug version
# seq ${N} | xargs -t -n$[N/workers + 1] | while read i; do
#  work ${i} &
# done
# wait

Selalu gunakan pekerja saat menelurkan jumlah proses berparameter dan batasi jumlah maksimum pekerja yang bisa muncul .

xargs -n | while read adalah cara sederhana daftar iterasi dalam batch.

  • seq membuat daftar angka dari 1 hingga N.
  • xargs -n memecah daftar itu menjadi N / pekerja + 1 batch.
    • misal N = 100 pekerja = 10 akan menghasilkan 10 baris hingga 11 angka dari 1 hingga 100.
  • while read i membaca setiap baris angka.
  • work ${i} &hanya memanggil workfungsi dengan ${i}sejumlah angka.

Untuk debug saya telah menambahkan kode debug komentar. Cukup ganti echodengan versi debug dan kode antara # --dengan versi debug-nya dan Anda dapat melihat cara kerjanya pada batch. Batalkan komentar set -xuntuk hasil debug yang lebih terperinci yang mungkin ingin Anda redirect ke file.

Jalankan saja versi debug dengan parameter berbeda untuk melihat bagaimana operasinya:

parallel.sh 223 5 1
parallel.sh 223 5 5
parallel.sh 223 5 10
parallel.sh 223 5 20

Penafian: Kode ini tidak menyinkronkan minnilai antara proses pekerja. Mendapatkan nilai minimum bukanlah latihan yang mengerikan. Ini mungkin akan dilakukan:

parallel.sh 223 5 20 | tr ' ' '\n' | sort -n | head -1

Atau cukup tambahkan yang sama ke skrip itu sendiri:

echo ${arr[*]} | tr ' ' '\n' | sort -n | head -1

Bisakah Anda menjelaskan kodenya? Tidak jelas bagi saya bagaimana Anda menggunakan utas pekerja di sini.
— RIchard Williams

@prasenjit Selesai. Saya harap itu membantu.
— nicerobot

8

Menggunakan GNU Parallel:

#!/bin/bash

N=$1
n=$2

arr=($(
# Generate all combinations of 1..n and 1..N
parallel -k --tag /path/to/a.out {1} {2} '|' bc :::: <(seq $N) <(seq $n) |
  perl -ane 'BEGIN{$min=1e30} $last||=$F[0]; if($F[0] != $last) {print $min,"\n";$min=1e30;$last=$F[0]} $min = $F[2]<$min ? $F[2] : $min; END {print $min,"\n"}'
))
echo ${arr[*]}

Ini akan berjalan /path/to/a.outpada masing-masing cpu. Outputnya akan seperti:

1 1 19269
1 2 6158
1 3 2794
1 4 25104
2 1 13160
2 2 32683
2 3 12535
2 4 15197
3 1 8228
3 2 7673
3 3 8428
3 4 24463

Script perl melihat kolom pertama dan menemukan minimum di kolom ke-3 yang memiliki kolom pertama yang sama.

Anda dapat menginstal GNU Parallel hanya dengan:

wget http://git.savannah.gnu.org/cgit/parallel.git/plain/src/parallel
chmod 755 parallel

Tonton video intro untuk mempelajari lebih lanjut: https://www.youtube.com/playlist?list=PL284C9FF2488BC6D1


Tautan di paragraf terakhir Anda terhubung ke halaman pencarian Facebook yang memberi tahu pengunjung bahwa ia telah memenangkan hadiah eksklusif (iklan atau penipuan). Tidak ada video. Anda harus menghapusnya.
— Marco
Dengan menggunakan situs kami, Anda mengakui telah membaca dan memahami Kebijakan Cookie dan Kebijakan Privasi kami.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.