Pertanyaan yang diberi tag «bioinformatics»

Saya punya suka file1: 0 AFFX-SNP-000541 NA 0 AFFX-SNP-002255 NA 1 rs12103 0.6401 1 rs12103_1247494 0.696 1 rs12142199 0.7672 Dan file2: 0 AFFX-SNP-000541 1 0 AFFX-SNP-002255 1 1 rs12103 0.5596 1 rs12103_1247494 0.5581 1 rs12142199 0.4931 Dan ingin file3 sedemikian rupa sehingga: 0 AFFX-SNP-000541 NA 1 0 AFFX-SNP-002255 NA 1 …

33 text-processing  awk  join  bioinformatics 

Saya punya folder dengan banyak file (xyz1, xyz2, hingga xyz5025) dan saya perlu menjalankan skrip pada setiap file, mendapatkan xyz1.faa, xyz2.faa, dan seterusnya sebagai output. Perintah untuk satu file adalah: ./transeq xyz1 xyz1.faa -table 11 Apakah ada cara untuk melakukan itu secara otomatis? Mungkin kombo yang harus dikerjakan?

19 shell-script  text-processing  files  scripting  bioinformatics 

Seperti saat ini, pertanyaan ini tidak cocok untuk format tanya jawab kami. Kami berharap jawaban didukung oleh fakta, referensi, atau keahlian, tetapi pertanyaan ini kemungkinan akan mengundang debat, argumen, polling, atau diskusi panjang. Jika Anda merasa bahwa pertanyaan ini dapat diperbaiki dan mungkin dibuka kembali, kunjungi pusat bantuan untuk panduan. …

19 linux  distribution-choice  bioinformatics 

Ini adalah file bagian N W N N N N N N N N N N C N N N N N N N N N N A N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N G …

9 text-processing  bioinformatics 

Saya memiliki file yang dibatasi tab yang terlihat seperti ini: gene v1 v2 v3 v4 g1 NA NA NA NA g2 NA NA 2 3 g3 NA NA NA NA g4 1 2 3 2 Jumlah bidang di setiap baris adalah tetap dan sama. Saya ingin menghapus baris-baris itu dari …

8 text-processing  awk  perl  bioinformatics