Pertanyaan yang diberi tag «mpi»

Versi 3.0 dari standar MPI secara formal menghapus antarmuka C ++ (sebelumnya tidak digunakan lagi). Sementara implementasi mungkin masih mendukungnya, fitur-fitur yang baru di MPI-3 tidak memiliki antarmuka C ++ yang didefinisikan dalam standar MPI. Lihat http://blogs.cisco.com/performance/the-mpi-c-bindings-what-happened-and-why/ untuk informasi lebih lanjut. Motivasi untuk menghapus antarmuka C ++ dari MPI adalah …

28 c++  mpi 

Saya memiliki aplikasi yang dapat diparalelkan secara sepele tetapi kinerjanya sebagian besar terikat I / O. Aplikasi membaca larik input tunggal yang disimpan dalam file yang biasanya berukuran 2-5 GB (tapi saya berharap angka ini bertambah di masa mendatang). Perhitungan tipikal berlaku operasi yang sama untuk setiap baris atau kolom …

20 io  parallel-computing  mpi 

Hal yang saya paling tidak suka tentang MPI adalah berurusan dengan tipe data (yaitu peta data / topeng) karena mereka tidak cocok dengan C + berorientasi objek. boost::mpiNamun, hanya mendukung MPI 1.1 dari situs web mereka: boost :: mpi adalah antarmuka ramah C ++ ke Antarmuka Lulus Pesan standar ... …

16 hpc  c++  mpi 

Saya memparalelkan kode untuk memecahkan model keseimbangan populasi 5 dimensi secara numerik. Saat ini saya memiliki kode paralel MPICH2 yang sangat baik di FORTRAN tetapi ketika kami meningkatkan nilai parameter array menjadi terlalu besar untuk dijalankan dalam mode memori terdistribusi. Saya memiliki akses ke sebuah cluster dengan 15 node, di …

14 parallel-computing  fortran  numerics  mpi  compiling 

Biasanya, saya menulis kode seri, dan ketika saya melakukannya, saya menulis unit test dengan beberapa kerangka pengujian gaya xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose, atau kerangka pengujian C ++ Google). Berdasarkan pencarian Google sepintas, saya belum melihat banyak tentang bagaimana praktisi menguji kode yang menggunakan MPI. Apakah ada praktik terbaik …

13 parallel-computing  petsc  mpi  testing  reproducibility 

Saya sedang mengerjakan masalah yang dapat diparalelkan dengan menggunakan satu operasi mpi_allgather atau satu mpi_scatter dan satu operasi mpi_gather. Operasi-operasi ini dipanggil dalam loop sementara, sehingga mereka dapat dipanggil berkali-kali. Dalam implementasi dengan skema MPI_allgather, saya mengumpulkan vektor terdistribusi ke semua proses untuk pemecahan matriks duplikat. Dalam implementasi lain, saya …

11 algorithms  complexity  mpi 

Saya mencoba untuk mengoptimalkan aplikasi MPI dengan pola komunikasi yang sangat tidak sinkron. Setiap peringkat memiliki daftar hal-hal untuk dihitung, dan mengirim pesan seperlunya jika input atau output berada pada peringkat yang berbeda. Selain itu, setiap peringkat di utas (saat ini dengan satu utas komunikasi dan 5 pekerja). Saya telah …

10 mpi  visualization 

Saya mencari referensi yang kredibel yang menyatakan berapa banyak sumber daya superkomputer menghabiskan pada koordinasi dibandingkan melakukan pekerjaan yang berhubungan dengan tugas yang sebenarnya. Sumber daya bisa menjadi kekuatan pemrosesan yang tersedia tetapi bahkan Watts tampak seperti unit yang valid. Saya percaya salah satu profesor atau buku teks saya pernah …

10 hpc  mpi