Referensi dasar tentang MCMC untuk Bayesian Statistics

11

Saya mencari beberapa makalah atau buku dengan contoh praktis dan teoritis tentang MCMC dasar untuk Bayesian Statistics (With R). Saya belum pernah belajar tentang simulasi, dan itulah sebabnya saya mencari informasi "dasar". Bisakah Anda memberi saya beberapa rekomendasi atau saran?

bayesian references mcmc

— Kebisingan Merah
sumber

Saya sangat menyarankan Anda untuk mempelajari beberapa simulasi dasar sebelum mencoba menangani MCMC.

— Glen_b -Reinstate Monica

Mengingat silsilah dari beberapa rekomendasi di bawah ini, saya ragu untuk memposting ini di sini, tetapi jika Anda benar - benar ingin "dasar", saya punya beberapa catatan tentang penggunaan MCMC untuk inferensi parameter dalam model berbasis fisik di sini (menggunakan Python daripada R ). Referensi lain yang diberikan di bawah ini jauh lebih ketat, jadi silakan gunakan dengan hati-hati, tetapi saya ingin berpikir suatu hari nanti mungkin berguna bagi orang lain selain saya :-)

— JamesS

8

Selain judul di atas, ada buku yang khusus menargetkan R, seperti

Komputasi Bayesian Jim Albert dengan R
buku kami Bayesian Essentials with R dengan manual solusi pada arXiv
buku kami Pengantar Metode Monte Carlo dengan R yang merupakan versi pemula dari Metode Statistik Monte Carlo kami yang lebih komprehensif dan juga memiliki manual solusi arXived
Pemikiran Ulang Statistik Richard McElreath dengan Contoh dalam R dan STAN yang saya ulas di blog saya

— Xi'an
sumber

1

Saya sangat menyukai buku Anda Christian

— bdeonovic

1

Christian, saya ingin mengucapkan selamat kepada Anda karena TBC! sebagai pemula di statistik Bayesian, buku Anda telah banyak membantu saya!

— Red Noise

@ user135273: terima kasih. The Bayesian Choice terkadang keras untuk pemula ...!

— Xi'an

13

orang sering sangat merekomendasikan Analisis Data Kruschke's Doing Bayesian sebagai buku pengantar yang bagus.

Dari sana mungkin coba Analisis Data Bayesian Gelman .

Kemudian akhiri dengan Metode Statistik Monte Carlo yang sangat baik

Tanpa informasi lebih lanjut tentang apa yang Anda cari secara khusus ini mungkin yang terbaik yang bisa saya lakukan.

— bdeonovic
sumber

5

Ketika saya mulai belajar statistik, saya menemukan buku Gelman tentang analisis data Bayesian sangat sulit untuk dipahami, mungkin agak berlebihan bagi seseorang yang baru mengenal statistik!

Saya sarankan Anda untuk mulai dengan buku Peter Hoff, A First Course in Bayesian Statistics Methods .

Ini bukan buku yang komprehensif untuk topik statistik lanjutan tetapi berisi sejumlah besar model statistik dan contoh dan kode-R disediakan di seluruh teks atau dari situs web untuk buku ini.

— Bahgat Nassour
sumber

5

Jika Anda bertanya tentang makalah pengantar , Anda dapat memeriksa hal-hal berikut:

Casella, G., & George, EI (1992). Menjelaskan sampler Gibbs. The American Statistician, 46 (3), 167-174.

Andrieu, C., de Freitas, N., Doucet, A. & Jordan, MI (2003). Pengantar MCMC untuk pembelajaran mesin. Pembelajaran Mesin, 50, 5-43.

Tierney, L. (1994). Rantai Markov untuk menjelajahi distribusi posterior. The Annals of Statistics, 1701-1728.

Hartig, F., Calabrese, JM, Reineking, B., Wiegand, T., & Huth, A. (2011). Kesimpulan statistik untuk model simulasi stokastik - teori dan aplikasi. Surat Ekologi, 14, 816–827.

— Tim
sumber

1

Secara historis, makalah Statistik Amerika oleh George dan Ed seharusnya berhak Gibbs untuk anak-anak, tetapi editor tidak menyukainya. Butuh seorang peternak hewan, Dan Gianola, untuk mendaur ulang gelar itu menjadi Gibbs untuk babi dan menerbitkan ulasannya.

— Xi'an

1

Teori Bayes selalu masuk akal bagi saya, tetapi analisis Bayes selalu sangat membingungkan. Hal-hal benar-benar mulai mengklik ketika saya membaca posting blog ini tentang 8 Sekolah contoh: http://andrewgelman.com/2014/01/21/everything-need-know-bayesian-statistics-learned-eight-schools/

Saya benar-benar berpikir contoh itu bisa lebih bermakna dengan contoh yang lebih baik, metrik yang dijelaskan dalam 8 Sekolah adalah beberapa hasil "pembinaan" abstrak.

— geneorama
sumber

0

Penjelasan grafis hebat MCMC dari Stata

https://www.youtube.com/watch?v=OTO1DygELpY

— Sengiley
sumber