Terlepas dari jenisnya, semua cokelat harus disimpan di tempat yang sejuk dan kelembaban rendah (kering) jauh dari sinar matahari langsung. Akan lebih baik untuk menyegelnya dalam wadah kedap udara, karena, seperti kata ElendiTheTall, mentega kakao di dalamnya akan menyerap rasa.
Cokelat hitam akan bertahan selama bertahun-tahun. Susu dan coklat putih akan bertahan untuk waktu yang jauh lebih singkat (beberapa bulan), karena kandungan susu mereka.
Cokelat yang disimpan dengan tidak benar akan berkembang, yang menunjukkan garis atau bercak putih atau abu-abu di permukaan. Bintik-bintik atau goresannya memisahkan lemak mentega kakao dan merupakan tanda bahwa amarah cokelat telah hilang. Cokelat jenis ini masih cocok untuk aplikasi apa pun di mana cokelat akan sepenuhnya meleleh (kebanyakan dipanggang). Ini bahkan dapat digunakan sebagai cokelat dasar (bukan biji) untuk tempering dengan metode penyemaian, tetapi tidak boleh digunakan untuk pembuatan permen lainnya.