Pertanyaan yang diberi tag «computational-biology»

Latar belakang saya adalah genomik, tetapi saya baru-baru ini bekerja dengan masalah yang berkaitan dengan struktur protein. Saya menulis beberapa program yang relevan di C, membangun parser file PDB saya sendiri dari awal dalam proses. Saya tidak khawatir membuat parser yang benar-benar kuat, saya hanya tahu bahwa membuat parser sendiri …

17 computational-biology  pdb  c 

Saya bekerja cukup banyak dalam biologi matematika / epidemiologi, di mana sebagian besar karya ilmu pemodelan / komputasi masih didominasi oleh set ODE, diakui kadang-kadang set cukup rumit dari mereka. Salah satu kelebihan model-model ini adalah model-model itu agak mudah digambarkan dan ditiru. Tabel nilai parameter, dan persamaan itu sendiri …

14 ode  computational-biology 

Saya telah mencoba membuat model spasial 2D yang akurat secara biologis dari lapisan jaringan, di mana proses fisiologis yang berbeda terjadi. Ini termasuk terutama reaksi kimia, difusi dan fluks terhadap batas. Saya membuat model ini dalam COMSOL Multiphysics, paket perangkat lunak elemen hingga yang memecahkan fisika yang berbeda seperti sistem …

10 finite-element  comsol  computational-biology 

Saya punya sistem persamaan diferensial biasa - 7 persamaan, dan ~ 30 parameter yang mengatur perilaku mereka sebagai bagian dari model matematika penularan penyakit. Aku suka mencari negara yang stabil bagi mereka persamaan Mengubah dx/dt = rest of the equationke 0 = equationuntuk masing-masing persamaan membuat masalah aljabar sederhana. Ini …

9 ode  symbolic-computation  computational-biology