Pertanyaan yang diberi tag «hpc»

Dalam program PhD sains komputasi saya, kami bekerja hampir secara eksklusif di C ++ dan Fortran. Sepertinya beberapa profesor lebih suka satu daripada yang lain. Saya bertanya-tanya mana yang 'lebih baik' atau apakah yang lebih baik dari yang lain dalam keadaan tertentu.

56 hpc  fortran  c++  languages 

Apakah ide yang baik untuk menggunakan vector<vector<double>>(menggunakan std) untuk membentuk kelas matriks untuk kode komputasi ilmiah kinerja tinggi? Jika jawabannya tidak. Mengapa? Terima kasih

37 hpc  c++ 

Cukup jelas dari survei top500 bahwa industri ini cenderung meningkat secara eksponensial dalam core pemrosesan . Superkomputer terbesar semua menggunakan MPI untuk komunikasi antar node, meskipun tampaknya tidak ada tren yang jelas untuk paralelisme on-node, dengan pendekatan yang paling sederhana (tetapi tidak harus paling efisien) untuk memetakan proses MPI tunggal …

36 exascale  programming-paradigms  hpc 

Bagaimana CUDA dan OpenCL dibandingkan satu sama lain pada akhir 2013 dari perspektif programmer? Grup saya sedang berpikir tentang mencoba memanfaatkan komputasi GPU. Apakah kita akan membatasi diri kita secara signifikan dengan memilih perangkat keras yang hanya mendukung OpenCL tetapi tidak CUDA? Untuk menjadi sedikit lebih spesifik, apakah asumsi berikut …

34 hpc  gpu  cuda  opencl 

Sebuah cluster komputasi EC2 Amazon berharga sekitar $ 800 - $ 1000 (tergantung pada siklus tugas) per inti CPU fisik selama 3 tahun. Dalam putaran terakhir akuisisi perangkat keras kami, lab saya mengambil perangkat keras senilai 48 core yang sangat mirip dengan cluster Amazon dengan harga sekitar $ 300 per …

23 cloud-computing  hpc 

Paradigma pemrograman OpenCL berjanji untuk menjadi standar bebas royalti untuk komputasi heterogen. Haruskah kita menginvestasikan waktu kita dalam mengembangkan perangkat lunak berbasis OpenCL? Pro kontra?

22 hpc  programming-paradigms 

Saya akan mulai dengan pengalaman pribadi saya di lab kami. Kembali ke ifort 9 dan 10 hari, kami dulu cukup agresif dengan optimasi, mengkompilasi dengan -O3 dan flag spesifik prosesor (-xW -xSSE4.2 misalnya). Tetapi mulai dengan ifort 11, kami mulai memperhatikan: 1. beberapa inkonsistensi dalam hasil (karena semantik tidak dipertahankan) …

21 performance  hpc  compiling  fortran 

Saya ingin mengembangkan perangkat lunak komputasi paralel ilmiah dari awal. Saya ingin beberapa pemikiran tentang bahasa mana untuk memulai. Program ini melibatkan membaca / menulis data ke file txt dan melakukan perhitungan berat secara paralel, dengan banyak faktorisasi LU dan penggunaan pemecah linier yang jarang. Solusi kandidat yang saya pikirkan …

18 python  hpc  c++  fortran  simulation 

Saya telah menjalankan GROMACS kode dinamika molekul (MD) pada cluster Linux Ubuntu yang terdiri dari node yang berisi 24 CPU Intel Xeon. Titik perhatian saya ternyata agak sensitif terhadap presisi aritmatika floating point, jadi saya harus menjalankan GROMACS dalam presisi ganda daripada presisi tunggal - meskipun biaya komputasi presisi ganda …

17 hpc  floating-point  molecular-dynamics  gpu 

Banyak pekerjaan saya sendiri berkisar membuat skala algoritma lebih baik, dan salah satu cara yang disukai untuk menunjukkan penskalaan paralel dan / atau efisiensi paralel adalah untuk memplot kinerja algoritma / kode pada jumlah inti, misalnya di mana sumbu mewakili jumlah core dan sumbu beberapa metrik, misalnya pekerjaan yang dilakukan …

17 parallel-computing  hpc  scaling  plotting 

Kembali ke awal OS X, tampaknya ada banyak keriuhan, setidaknya di dunia Mac (saya tidak berada di dekat komputasi ilmiah pada saat itu) tentang Mac OS sebagai platform untuk komputasi ilmiah dan aplikasi HPC. XGrid keluar dari kotak, Virginia Tech memiliki cluster komputasi berbasis Mac yang mewah, Stanford melakukan hal-hal …

17 software  hpc 

Workgroup kami menghasilkan aplikasi desktop yang mensimulasikan kinerja energi gedung. Ini adalah aplikasi .NET dan ketika pengguna menjalankan banyak simulasi, mereka bisa sangat memakan waktu. Simulasi sepenuhnya dapat diparalelkan, dan kami memiliki beberapa sumber daya komputasi HPC yang sangat signifikan di "kantor". Satu ide yang kami miliki adalah untuk memungkinkan …

17 hpc  partitioning 

Karena pertanyaan ini terkait dengan perhitungan, saya memutuskan untuk memposting di sini. Semoga itu akan dipandang tepat. Saya baru saja mulai menjalankan model atmosfer dan samudera, dan saya menyadari bahwa saya membutuhkan lebih banyak inti, memori, dan ruang disk daripada yang dimiliki desktop saya saat ini. Lembaga saya memiliki layanan …

16 hpc 

Hal yang saya paling tidak suka tentang MPI adalah berurusan dengan tipe data (yaitu peta data / topeng) karena mereka tidak cocok dengan C + berorientasi objek. boost::mpiNamun, hanya mendukung MPI 1.1 dari situs web mereka: boost :: mpi adalah antarmuka ramah C ++ ke Antarmuka Lulus Pesan standar ... …

16 hpc  c++  mpi 

Saya menggunakan Valgrind + Callgrind ke profil pemecah yang saya tulis. Seperti yang dinyatakan oleh manual pengguna Valgrind, saya telah mengkompilasi kode saya dengan opsi debugging untuk kompiler: "Tanpa info debug, alat Valgrind terbaik yang dapat Anda lakukan adalah menebak fungsi kode mana yang menjadi miliknya, yang membuat pesan kesalahan …

16 hpc