Pertanyaan yang diberi tag «glmm»

Saya mencoba memahami kapan harus menggunakan efek acak dan kapan itu tidak perlu. Ive diberitahu aturan praktis adalah jika Anda memiliki 4 grup atau lebih yang saya lakukan (15 moose individu). Beberapa dari mereka rusa percobaan pada 2 atau 3 kali untuk total 29 percobaan. Saya ingin tahu apakah mereka …

34 mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model  glmm 

Saya bertanya-tanya apa perbedaan antara GLM campuran dan tidak dicampur. Misalnya, di SPSS menu tarik turun memungkinkan pengguna untuk masuk: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models & analyze-> mixed models-> generalized linear Apakah mereka menangani nilai-nilai yang hilang secara berbeda? Variabel dependen saya adalah biner dan saya memiliki beberapa …

34 mixed-model  generalized-linear-model  glmm  gee 

Saat ini saya kesulitan menemukan model yang tepat untuk data penghitungan yang sulit (variabel dependen). Saya telah mencoba berbagai model yang berbeda (model efek campuran diperlukan untuk jenis data saya) seperti lmerdan lme4(dengan log transformasi) serta model efek campuran linier umum dengan berbagai keluarga seperti Gaussian atau binomial negatif. Namun, …

25 generalized-linear-model  residuals  negative-binomial  count-data  glmm 

Kami telah menjalankan regresi logistik efek campuran menggunakan sintaks berikut; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Subjek dan Barang adalah efek acak. Kami mendapatkan hasil yang aneh yaitu koefisien dan standar deviasi untuk istilah …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

Saya memiliki percobaan tindakan berulang di mana variabel dependen adalah persentase, dan saya memiliki beberapa faktor sebagai variabel independen. Saya ingin menggunakan glmerdari paket R lme4untuk memperlakukannya sebagai masalah regresi logistik (dengan menentukan family=binomial) karena tampaknya mengakomodasi pengaturan ini secara langsung. Data saya terlihat seperti ini: > head(data.xvsy) foldnum featureset …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

Saya memiliki GLMM dengan distribusi binomial dan fungsi tautan logit dan saya merasa bahwa aspek penting dari data tidak terwakili dengan baik dalam model. Untuk menguji ini, saya ingin tahu apakah data dijelaskan dengan baik oleh fungsi linear pada skala logit. Oleh karena itu, saya ingin tahu apakah residunya berperilaku …

19 binomial  residuals  glmm  lme4-nlme 

Saya menggunakan glmerfungsi dari lme4paket dalam R, dan saya menggunakan bobyqapengoptimal (yaitu default dalam kasus saya). Saya mendapat peringatan, dan saya ingin tahu apa artinya. Warning message: In optwrap(optimizer, devfun, start, rho$lower, control = control, : convergence code 3 from bobyqa: bobyqa -- a trust region step failed to reduce …

16 r  optimization  lme4-nlme  convergence  glmm 

Saya mencoba menggunakan lme4::glmer()agar sesuai dengan model campuran binomial umum (GLMM) dengan variabel dependen yang bukan biner, tetapi variabel kontinu antara nol dan satu. Orang dapat menganggap variabel ini sebagai probabilitas; sebenarnya itu adalah probabilitas sebagaimana dilaporkan oleh subyek manusia (dalam percobaan yang saya bantu analisis). Yaitu itu bukan fraksi …

15 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

Saya memiliki satu set data di mana variabel yang ingin saya gunakan sebagai efek acak hanya memiliki satu pengamatan untuk beberapa level. Berdasarkan jawaban atas pertanyaan sebelumnya, saya telah mengumpulkan bahwa, pada prinsipnya, ini baik-baik saja. Bisakah saya memasukkan model campuran dengan subjek yang hanya memiliki 1 observasi? Model penyadapan …

14 r  mixed-model  generalized-linear-model  glmm  lme4-nlme 

Saya menjalankan model regresi logistik dalam bentuk: lmer(response~1+(1|site), family=binomial, REML = FALSE) Biasanya saya akan menghitung ICC dari varian intersep dan residual, tetapi ringkasan model tidak termasuk varians residual. Bagaimana saya menghitung ini?

13 logistic  lme4-nlme  glmm 

Saya telah menemukan sejumlah pertanyaan praktis ketika memodelkan menghitung data dari penelitian eksperimental menggunakan eksperimen dalam subjek. Saya jelaskan secara singkat eksperimen, data, dan apa yang telah saya lakukan sejauh ini, diikuti oleh pertanyaan saya. Empat film berbeda diperlihatkan kepada sampel responden secara berurutan. Setelah setiap film wawancara dilakukan dimana …

12 generalized-linear-model  negative-binomial  glmm  poisson-regression  overdispersion 

Saya memiliki model berikut: > model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop +(1|landscape),family=poisson) ... dan ini adalah output ringkasan. > summary(model1) Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1 + sbare + season + crop + (1 | landscape) AIC BIC logLik deviance 4057 4088 -2019 4039 …

12 r  poisson-distribution  lme4-nlme  glmm  overdispersion 

Dalam mencari info tentang model marginal dan model efek-acak , dan bagaimana memilih di antara mereka, saya telah menemukan beberapa info tetapi itu adalah penjelasan abstrak matematika yang kurang lebih (seperti misalnya di sini: https: //stats.stackexchange .com / a / 68753/38080 ). Di suatu tempat saya telah menemukan bahwa terdapat …

11 mixed-model  random-effects-model  glmm  gee  marginal-model 

Saya memiliki regresi logistik intersep acak (karena pengukuran berulang) dan saya ingin melakukan beberapa diagnostik, khususnya mengenai pencilan dan pengamatan yang berpengaruh. Saya melihat residu untuk melihat apakah ada pengamatan yang menonjol. Tetapi saya juga ingin melihat jarak seperti Cook atau DFFIT. Hosmer dan Lemeshow (2000) mengatakan bahwa karena kurangnya …

11 mixed-model  outliers  glmm  cooks-distance 

Saya berharap seseorang dapat membantu dengan apa yang saya pikir merupakan pertanyaan yang relatif sederhana, dan saya pikir saya tahu jawabannya tetapi tanpa konfirmasi itu sudah menjadi sesuatu yang saya tidak bisa yakin. Saya memiliki beberapa data hitungan sebagai variabel respon dan saya ingin mengukur bagaimana variabel itu berubah dengan …

11 r  binomial  proportion  glmm  lme4-nlme