Pertanyaan yang diberi tag «lme4-nlme»

Tutup. Pertanyaan ini di luar topik . Saat ini tidak menerima jawaban. Ingin meningkatkan pertanyaan ini? Perbarui pertanyaan sehingga sesuai topik untuk Cross Validated. Ditutup 6 bulan lalu . Saya sedang mengerjakan paket R nlme dan lme4 , mencoba menentukan model dengan beberapa efek acak. Saya menemukan, bahwa hanya nlme …

25 r  random-effects-model  lme4-nlme 

Saya mencoba untuk beralih dari menggunakan ezpaket ke lmeuntuk tindakan berulang ANOVA (karena saya berharap saya akan dapat menggunakan kontras kustom dengan lme). Mengikuti saran dari posting blog ini saya dapat mengatur model yang sama menggunakan keduanya aov(seperti halnya ez, ketika diminta) dan lme. Namun, sedangkan dalam contoh yang diberikan …

24 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Saya telah melihat ikhtisar rumus lm / lmer R oleh @conjugateprior dan bingung dengan entri berikut: Sekarang asumsikan A adalah acak, tetapi B adalah tetap dan B bersarang dalam A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Formula model campuran analog di bawah lmer(Y ~ B + (1 | A:B), data=d) …

23 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Saya bertanya-tanya apakah ada metode untuk menghitung ukuran sampel dalam model campuran? Saya menggunakan lmerdi R agar sesuai dengan model (saya punya lereng acak dan penyadapan).

23 r  mixed-model  lme4-nlme  power-analysis 

Kami telah menjalankan regresi logistik efek campuran menggunakan sintaks berikut; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Subjek dan Barang adalah efek acak. Kami mendapatkan hasil yang aneh yaitu koefisien dan standar deviasi untuk istilah …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

Misalkan saya memiliki beberapa pengukuran untuk setiap subjek di setiap situs. Dua variabel, subjek dan situs, yang menarik dalam hal nilai-nilai korelasi intraclass computing (ICC). Biasanya saya akan menggunakan fungsi lmerdari paket R lme4, dan jalankan lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | site), mydata) Nilai-nilai ICC …

22 r  lme4-nlme  intraclass-correlation 

Saya memiliki percobaan tindakan berulang di mana variabel dependen adalah persentase, dan saya memiliki beberapa faktor sebagai variabel independen. Saya ingin menggunakan glmerdari paket R lme4untuk memperlakukannya sebagai masalah regresi logistik (dengan menentukan family=binomial) karena tampaknya mengakomodasi pengaturan ini secara langsung. Data saya terlihat seperti ini: > head(data.xvsy) foldnum featureset …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

Dengan dataset berikut, saya ingin melihat apakah respons (efek) berubah sehubungan dengan situs, musim, durasi, dan interaksinya. Beberapa forum online tentang statistik menyarankan saya untuk melanjutkan dengan Linear Mixed-Effects Model, tetapi masalahnya adalah karena replikat diacak di setiap stasiun, saya memiliki sedikit kesempatan untuk mengumpulkan sampel dari tempat yang persis …

21 r  mixed-model  lme4-nlme 

Saya telah bekerja dengan beberapa data yang memiliki beberapa masalah dengan pengukuran berulang. Dengan melakukan itu saya memperhatikan perilaku yang sangat berbeda antara lme()dan lmer()menggunakan data pengujian saya dan ingin tahu mengapa. Kumpulan data palsu yang saya buat memiliki pengukuran tinggi dan berat badan untuk 10 subjek, masing-masing diambil dua …

20 r  mixed-model  lme4-nlme 

Saya telah melihat pemodelan efek campuran menggunakan paket lme4 di R. Saya terutama menggunakan lmerperintah jadi saya akan mengajukan pertanyaan saya melalui kode yang menggunakan sintaks itu. Saya kira pertanyaan umum yang mudah mungkin, apakah boleh untuk membandingkan dua model yang dibangun dalam lmermenggunakan rasio kemungkinan berdasarkan pada dataset identik? …

20 r  mixed-model  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Kita tahu bahwa uji- t berpasangan hanyalah kasus khusus dari ANOVA langkah-langkah berulang satu arah (atau dalam subjek) serta model efek campuran linier, yang dapat ditunjukkan dengan fungsi lme () yang berfungsi sebagai paket nlme dalam R seperti yang ditunjukkan di bawah ini. #response data from 10 subjects under two …

20 r  mixed-model  t-test  repeated-measures  lme4-nlme 

Pertimbangkan data berikut dari dua arah dalam desain subjek: df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 Jim Cued Neu …

19 mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Katakanlah kita harus GLMM mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) Model-model ini tidak bersarang dalam arti biasa: a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) b <- glmer(y …

19 r  mixed-model  aic  lme4-nlme  nested-models 

Katakanlah kami sedang mengerjakan model efek acak dari beberapa data jumlah dari waktu ke waktu, dan kami ingin mengendalikan beberapa tren. Biasanya, Anda akan melakukan sesuatu seperti: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") untuk memasukkan bentuk kuadrat untuk t. Apakah mungkin untuk menggunakan beberapa teknik smoothing yang lebih canggih seperti …

19 mixed-model  lme4-nlme  splines 

Ada perbedaan yang membuat saya bingung dengan model campuran, dan saya bertanya-tanya apakah saya bisa mendapatkan kejelasan tentang itu. Mari kita asumsikan Anda punya model campuran data hitungan. Ada variabel yang Anda tahu Anda inginkan sebagai efek tetap (A) dan variabel lain untuk waktu (T), dikelompokkan dengan mengatakan variabel "Situs". …

19 r  mixed-model  lme4-nlme