Pertanyaan yang diberi tag «lme4-nlme»

Saya mencoba menyesuaikan model campuran multivarian (yaitu, beberapa respons) di R. Selain dari paket ASReml-rdan SabreR(yang memerlukan perangkat lunak eksternal), sepertinya ini hanya mungkin di MCMCglmm. Dalam makalah yang menyertai MCMCglmmpaket (hal.6), Jarrod Hadfield menggambarkan proses pemasangan model seperti seperti membentuk kembali beberapa variabel respon menjadi satu variabel format panjang …

10 r  mixed-model  multivariate-analysis  lme4-nlme  multivariate-regression 

Saya baru saja (kembali) membaca Gelman's Why kita (biasanya) tidak perlu khawatir tentang beberapa perbandingan . Khususnya bagian "Berbagai hasil dan tantangan lain" menyebutkan menggunakan model hierarkis untuk situasi ketika ada beberapa tindakan terkait dari orang / unit yang sama pada waktu / kondisi yang berbeda. Tampaknya memiliki sejumlah properti …

10 multiple-comparisons  multilevel-analysis  lme4-nlme  jags  hierarchical-bayesian 

Struktur data > str(data) 'data.frame': 6138 obs. of 10 variables: $ RT : int 484 391 422 516 563 531 406 500 516 578 ... $ ASCORE : num 5.1 4 3.8 2.6 2.7 6.5 4.9 2.9 2.6 7.2 ... $ HSCORE : num 6 2.1 7.9 1 6.9 8.9 …

10 r  mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme 

Saya ingin memodelkan dua variabel waktu yang berbeda, beberapa di antaranya sangat collinear dalam data saya (usia + kohort = periode). Melakukan ini saya mengalami beberapa masalah dengan lmerdan dan interaksi poly(), tetapi mungkin tidak terbatas lmer, saya mendapat hasil yang sama dengan nlmeIIRC. Jelas, pemahaman saya tentang apa fungsi …

10 r  lme4-nlme  polynomial 

Saya sedang menyelesaikan beberapa analisis pada sejumlah besar data. Saya ingin mengambil model linier yang digunakan di bagian pertama pekerjaan dan menyesuaikannya menggunakan model campuran linier (LME). LME akan sangat mirip dengan pengecualian bahwa salah satu variabel yang digunakan dalam model akan digunakan sebagai efek acak. Data ini berasal dari …

10 r  regression  hypothesis-testing  mixed-model  lme4-nlme 

Ini lebih merupakan pertanyaan konseptual, tetapi karena saya menggunakan Rsaya akan merujuk ke paket di R. Jika tujuannya adalah agar sesuai dengan model linier untuk keperluan prediksi, dan kemudian membuat prediksi di mana efek acak mungkin tidak tersedia, apakah ada manfaat menggunakan model efek campuran, atau haruskah model efek tetap …

10 r  multiple-regression  mixed-model  lme4-nlme 

Saya menganalisis data pelacakan mata dari percobaan yang dirancang. Versi sederhana dari data saya terlihat seperti ini (Anda bisa mendapatkan data dput () di sini ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 9 Face 90 …

10 r  mixed-model  poisson-regression  lsmeans  lme4-nlme 

Saya menganalisa beberapa data perilaku menggunakan lme4di R, sebagian besar mengikuti tutorial Bodo Winter baik , tapi saya tidak mengerti jika saya menangani interaksi dengan benar. Lebih buruk lagi, tidak ada orang lain yang terlibat dalam penelitian ini menggunakan model campuran, jadi saya sedikit terombang-ambing ketika datang untuk memastikan semuanya …

10 r  mixed-model  p-value  lme4-nlme 

Bagaimana struktur varians-kovarians default untuk efek acak dalam glmeratau lmerdalam lme4paket? Bagaimana cara menentukan struktur varians-kovarians lain untuk efek-acak dalam kode? Saya tidak dapat menemukan informasi mengenai ini di lme4dokumentasi.

10 mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

Saya merasa kewalahan setelah mencoba menggali literatur tentang bagaimana menjalankan analisis model campuran saya dengan menggunakan AIC untuk memilih model atau model terbaik. Saya tidak berpikir bahwa data saya serumit itu, tetapi saya mencari konfirmasi bahwa apa yang telah saya lakukan adalah benar, dan kemudian memberi saran tentang bagaimana melanjutkan. …

10 r  lme4-nlme  random-effects-model  aic 

Bagaimana saya bisa mendapatkan efek acak dikumpulkan untuk lmer setelah beberapa kali imputasi? Saya menggunakan mouse untuk menghubungkan beberapa frame data. Dan lme4 untuk model campuran dengan intersep acak dan kemiringan acak. Pooling lmer baik-baik saja, kecuali bahwa itu tidak mengumpulkan efek acak. Saya telah mencari banyak solusi tanpa keberuntungan. …

10 r  lme4-nlme  multiple-imputation 

Intro Saya memiliki peserta yang berulang kali menyentuh permukaan yang terkontaminasi dengan E. coli dalam dua kondisi ( A = memakai sarung tangan, B = tanpa sarung tangan). Saya ingin tahu apakah ada perbedaan antara jumlah bakteri di ujung jari mereka dengan dan tanpa sarung tangan tetapi juga antara jumlah …

9 r  anova  repeated-measures  lme4-nlme  glmm 

Kejadian yang tidak biasa ketika berhadapan dengan model campuran maksimal yang kompleks (memperkirakan semua efek acak yang mungkin untuk data dan model yang diberikan) adalah sempurna (+1 atau -1) atau korelasi yang hampir sempurna di antara beberapa efek acak. Untuk tujuan diskusi, mari kita amati model dan ringkasan model berikut …

9 r  correlation  mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

Saya punya beberapa pertanyaan tentang spesifikasi dan interpretasi GLMM. 3 pertanyaan pasti statistik dan 2 lebih spesifik tentang R. Saya posting di sini karena pada akhirnya saya pikir masalahnya adalah interpretasi hasil GLMM. Saat ini saya mencoba untuk menyesuaikan GLMM. Saya menggunakan data sensus AS dari Longitudinal Tract Database . …

9 r  lme4-nlme  poisson-distribution  negative-binomial  glmm 

Saya menyesuaikan model efek campuran dengan istilah spline dalam aplikasi di mana tren dari waktu ke waktu dikenal sebagai kurva-linier. Namun, apa yang ingin saya nilai adalah apakah tren kurva-linier terjadi karena penyimpangan individu dari linieritas, atau apakah itu efek pada tingkat kelompok yang membuat tingkat kelompok yang sesuai tampak …

9 r  splines  lme4-nlme