Ilmu Komputasi

Apakah ada yang punya rekomendasi tentang perpustakaan matriks C ++ yang dapat digunakan dan cepat? Yang saya maksud dengan dapat digunakan adalah sebagai berikut: Objek matriks memiliki antarmuka yang intuitif (mis .: saya dapat menggunakan baris dan kolom saat pengindeksan) Saya dapat melakukan apa saja dengan kelas matriks yang dapat …

158 linear-algebra  software  implicit-methods 

Saya sangat yakin akan nilai menggunakan tes yang memverifikasi program lengkap (misalnya tes konvergensi), termasuk serangkaian uji regresi otomatis . Setelah membaca beberapa buku pemrograman, saya merasa ngeri bahwa saya "harus" menulis unit test (yaitu, tes yang memverifikasi kebenaran fungsi tunggal dan tidak sama dengan menjalankan seluruh kode untuk menyelesaikan …

89 programming-paradigms  testing 

Jadi saya punya kepala yang layak untuk masalah apa yang saya kerjakan yang terbaik dalam serial, dan mana yang bisa dikelola secara paralel. Tapi saat ini, saya tidak punya banyak ide tentang apa yang terbaik ditangani oleh perhitungan berbasis CPU, dan apa yang harus diturunkan ke GPU. Saya tahu ini …

84 gpu 

Saya memiliki beberapa masalah optimisasi global non-cembung yang menantang untuk dipecahkan. Saat ini saya menggunakan MATLAB's Optimization Toolbox (khusus, fmincon()dengan algoritma = 'sqp'), yang cukup efektif . Namun, sebagian besar kode saya menggunakan Python, dan saya ingin melakukan optimasi dengan Python juga. Apakah ada pemecah NLP dengan binding Python yang …

77 python  optimization  nonlinear-programming  linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix  ode  automatic-differentiation  efficiency  matrix  symbolic-computation  pde  multiphysics  operator-splitting  fluid-dynamics  pde  multigrid  pde  hyperbolic-pde  quadrature  precision  numerical-analysis  fluid-dynamics  interpolation  c  ode  testing  data-sets  pde  fluid-dynamics  hyperbolic-pde  pde  finite-element  fluid-dynamics  stability  incompressible  pde  hyperbolic-pde  fluid-dynamics  pde  precision  floating-point  convex-optimization  conditioning  pde  hyperbolic-pde  stability  implicit-methods  explicit-methods  fluid-dynamics  accuracy  pde  hyperbolic-pde  petsc  linear-algebra 

Pertanyaan ini merupakan perpanjangan dari dua diskusi yang muncul baru-baru ini di balasan untuk " C ++ vs Fortran untuk HPC ". Dan ini sedikit lebih menantang daripada sebuah pertanyaan ... Salah satu argumen yang paling sering terdengar dalam mendukung Fortran adalah bahwa penyusunnya lebih baik. Karena sebagian besar kompiler …

74 fortran  c  blas  benchmarking 

Saya bekerja dalam ilmu komputasi, dan sebagai hasilnya, saya menghabiskan banyak waktu untuk mencoba meningkatkan throughput ilmiah banyak kode, serta memahami efisiensi kode-kode ini. Mari kita asumsikan saya telah mengevaluasi kinerja vs keterbacaan / penggunaan kembali / pemeliharaan tradeoff dari perangkat lunak yang saya kerjakan, dan saya telah memutuskan bahwa …

66 performance 

Dalam program PhD sains komputasi saya, kami bekerja hampir secara eksklusif di C ++ dan Fortran. Sepertinya beberapa profesor lebih suka satu daripada yang lain. Saya bertanya-tanya mana yang 'lebih baik' atau apakah yang lebih baik dari yang lain dalam keadaan tertentu.

56 hpc  fortran  c++  languages 

Algoritma Fast Fourier Transform menghitung dekomposisi Fourier dengan asumsi bahwa titik inputnya sama-sama diberi spasi dalam domain waktu, . Bagaimana jika tidak? Apakah ada algoritma lain yang bisa saya gunakan, atau beberapa cara saya bisa memodifikasi FFT, untuk menjelaskan apa yang secara efektif tingkat sampling variabel?tk=kTtk=kTt_k = kT Jika solusinya …

55 fourier-analysis 

Saya sedang mempertimbangkan mempelajari bahasa baru untuk digunakan untuk proyek pemodelan numerik / simulasi, sebagai pengganti (sebagian) untuk C ++ dan Python yang saat ini saya gunakan. Saya menemukan Julia , yang terdengar sempurna. Jika ia melakukan semua yang diklaimnya, saya dapat menggunakannya untuk mengganti C ++ dan Python di …

55 parallel-computing  languages  julia 

Banyak algoritma numerik (integrasi, diferensiasi, interpolasi, fungsi khusus, dll.) Tersedia di perpustakaan perhitungan ilmiah seperti GSL . Tapi saya sering melihat kode dengan implementasi "linting" dari fungsi-fungsi ini. Untuk program-program kecil yang tidak dimaksudkan untuk distribusi publik, apakah merupakan praktik yang umum di antara para ilmuwan komputasi untuk hanya mengimplementasikan …

54 libraries  c 

Setiap ilmuwan perlu tahu sedikit tentang statistik: apa artinya korelasi, apa interval kepercayaan itu, dan sebagainya. Demikian pula, setiap ilmuwan harus tahu sedikit tentang komputasi: pertanyaannya adalah, apa? Apa yang masuk akal untuk mengharapkan setiap ilmuwan yang bekerja tahu tentang membangun dan menggunakan perangkat lunak? Daftar keterampilan inti kami --- …

52 education 

Sistem linear yang jarang muncul dengan meningkatnya frekuensi dalam aplikasi. Seseorang memiliki banyak rutinitas untuk dipilih untuk menyelesaikan sistem ini. Pada level tertinggi, ada batas antara metode langsung (mis. Eliminasi Gaussian yang jarang atau dekomposisi Cholesky, dengan algoritma pemesanan khusus, dan metode multirontal) dan iteratif (misalnya metode GMRES, (bi-) konjugat …

49 linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix 

Ada perbedaan yang jelas antara perbedaan hingga dan metode volume hingga (bergerak dari definisi titik persamaan ke rata-rata integral atas sel). Tapi saya menemukan FEM dan FVM sangat mirip; keduanya menggunakan bentuk integral dan rata-rata di atas sel. Apa yang dilakukan metode FEM sehingga FVM tidak? Saya telah membaca sedikit …

48 finite-element  finite-volume 

Saya terbiasa memikirkan perbedaan hingga sebagai kasus khusus elemen hingga, pada grid yang sangat terbatas. Jadi, bagaimana kondisi bagaimana memilih antara Metode Perbedaan Hingga (FDM) dan Metode Elemen Hingga (FEM) sebagai metode numerik? Di sisi Metode Perbedaan Hingga (FDM), orang dapat menghitung bahwa mereka secara konsep lebih sederhana dan lebih …

46 pde  finite-element 

Sering kali, ketika saya mewarisi atau menemukan kode ilmiah yang ditulis oleh orang lain (atau kadang-kadang, bahkan karya saya sendiri), saya perhatikan bahwa dokumentasi jarang atau tidak ada. Jika saya beruntung, saya melihat komentar informatif. Jika saya sangat beruntung, bahkan ada komentar Doxygen dan Doxyfile sehingga saya memiliki antarmuka fungsi …

44 software  documentation