Pertanyaan yang diberi tag «efficiency»

Saya memiliki beberapa masalah optimisasi global non-cembung yang menantang untuk dipecahkan. Saat ini saya menggunakan MATLAB's Optimization Toolbox (khusus, fmincon()dengan algoritma = 'sqp'), yang cukup efektif . Namun, sebagian besar kode saya menggunakan Python, dan saya ingin melakukan optimasi dengan Python juga. Apakah ada pemecah NLP dengan binding Python yang …

77 python  optimization  nonlinear-programming  linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix  ode  automatic-differentiation  efficiency  matrix  symbolic-computation  pde  multiphysics  operator-splitting  fluid-dynamics  pde  multigrid  pde  hyperbolic-pde  quadrature  precision  numerical-analysis  fluid-dynamics  interpolation  c  ode  testing  data-sets  pde  fluid-dynamics  hyperbolic-pde  pde  finite-element  fluid-dynamics  stability  incompressible  pde  hyperbolic-pde  fluid-dynamics  pde  precision  floating-point  convex-optimization  conditioning  pde  hyperbolic-pde  stability  implicit-methods  explicit-methods  fluid-dynamics  accuracy  pde  hyperbolic-pde  petsc  linear-algebra 

Salah satu masalah utama yang harus kita hadapi dalam simulasi molekuler adalah perhitungan gaya yang bergantung pada jarak. Jika kita dapat membatasi fungsi gaya dan jarak agar memiliki kekuatan genap dari jarak pemisahan , maka kita bisa menghitung kuadrat jarak r 2 = r ⋅ r dan tidak perlu khawatir …

26 efficiency 

Saya menjalankan simulasi dinamika molekul (MD) menggunakan beberapa paket perangkat lunak, seperti Gromacs dan DL_POLY. Gromacs sekarang mendukung algoritma dekomposisi partikel dan domain dekomposisi. Secara default, simulasi Gromacs menggunakan dekomposisi domain, meskipun selama bertahun-tahun, hingga saat ini, dekomposisi partikel adalah satu-satunya metode yang diterapkan dalam Gromacs. Dalam salah satu makalah …

15 parallel-computing  efficiency  molecular-dynamics  simulation 

Grup penelitian saya berfokus pada dinamika molekuler, yang jelas dapat menghasilkan gigabytes data sebagai bagian dari lintasan tunggal yang kemudian harus dianalisis. Beberapa masalah yang kami khawatirkan melibatkan korelasi dalam set data, yang berarti bahwa kita perlu melacak sejumlah besar data dalam memori dan menganalisisnya, daripada menggunakan pendekatan yang lebih …

15 python  c  efficiency 

Saya telah membaca bahwa jika, misalnya, saya memiliki forloop ganda yang berjalan di atas indeks matriks, maka menempatkan indeks berjalan kolom di loop luar lebih efisien. Sebagai contoh: a=zeros(1000); for j=1:1000 for i=1:1000 a(i,j)=1; end end Apa cara paling efisien untuk mengkodekannya jika saya memiliki tiga forloop atau lebih ? …

12 matlab  efficiency 

Saya tertarik dalam mendirikan perhitungan untuk memeriksa apakah kriteria jarak puas: yaitu, jarak antara vektor dan vektor anter x j harus kurang dari beberapa nilai r m a x . Data saya dipartisi berdasarkan kisi koordinat ortogonal. Karena cutoff saya lebih kecil dari jarak antara titik akhir koordinat tetangga terdekat, …

12 efficiency 

Diferensiasi otomatis memungkinkan kita untuk mengevaluasi turunan dari suatu program berdasarkan input tertentu. Ada teorema bahwa perhitungan ini dapat dilakukan dengan biaya kurang dari lima kali biaya untuk menjalankan program asli. Faktor lima ini adalah batas atas. Dalam situasi apa biaya ini dapat dikurangi lebih lanjut? Banyak kode turunan di …

12 automatic-differentiation  efficiency 

Tutup. Pertanyaan ini di luar topik . Saat ini tidak menerima jawaban. Ingin meningkatkan pertanyaan ini? Perbarui pertanyaan agar sesuai dengan topik untuk Computational Science Stack Exchange. Ditutup 5 tahun yang lalu . Apakah ada tingkat kompleksitas yang lebih besar dari dan lebih kecil dari ?O ( n log n …

10 algorithms  complexity  efficiency 

Saya mencoba memahami perbedaan antara kedua kartu grafis ini untuk komputasi akademik, khususnya untuk komponen DGEMM. Jika kita melihat statistik mentah, keduanya memiliki chip GK110 yang sama, memiliki statistik yang sebanding di hampir setiap kategori, dan, saya percaya, memiliki arsitektur inti yang sama. Sebelum ada diskon, K20X kira-kira 4x biaya …

10 performance  gpu  efficiency 

Apa cara canggih menerapkan fungsi khusus presisi ganda? Saya membutuhkan integral berikut: untuk dan , yang dapat ditulis dalam bentuk fungsi gamma bawah yang tidak lengkap. Inilah implementasi Fortran dan C saya: m=0,1,2,. . . t>0Fm( t ) = ∫10kamu2 me- t u2du = γ( m + 12, t )2 …

10 efficiency  accuracy  special-functions