Pertanyaan yang diberi tag «r»

Jika saya tertarik untuk menyesuaikan interaksi dua arah antara variabel penjelas linier dan variabel penjelas lain yang memiliki hubungan kuadratik dengan variabel dependen , apakah saya harus memasukkan interaksi dengan komponen kuadratik dan interaksi dengan linier komponen dalam model? Misalnya: Pada gilirannya membangun di utas saya sebelumnya: Istilah kelengkungan dan …

13 r  regression  model-selection 

Maaf jika ini adalah pertanyaan newb; Saya mencoba untuk belajar statistik sendiri untuk pertama kalinya. Saya pikir saya memiliki prosedur dasar, tapi saya berjuang untuk melaksanakannya dengan R. Jadi, saya mencoba untuk mengevaluasi signifikansi koefisien regresi dalam bentuk regresi linier berganda y^= Xβ^y^=Xβ^ \hat y = X \hat \beta Saya …

13 r  statistical-significance  multiple-regression 

Semoga seseorang di forum ini dapat membantu saya mengatasi masalah mendasar ini dalam studi ekspresi gen. Saya melakukan sekuensing dalam jaringan eksperimental dan kontrol. Saya kemudian memperoleh nilai pengayaan lipat gen dalam sampel eksperimental alih kontrol. Genom referensi memiliki ~ 15.000 gen. 3.000 dari 15.000 gen diperkaya di atas batas …

13 r  genetics  bioinformatics  microarray  biostatistics 

Saya menggunakan RandomForestpaket R dan bingung bagaimana menafsirkan nilai-nilai sumbu Y di plot ketergantungan parsial mereka. Help docs menyatakan bahwa plot adalah "penggambaran grafis dari efek marginal suatu variabel terhadap probabilitas kelas." Namun, saya masih bingung apa tepatnya yang mewakili sumbu y. Khususnya, apa artinya nilai negatif? Apa artinya memiliki …

13 r  interpretation  random-forest  partial-plot 

Saya mencoba menafsirkan output dari nls (). Saya telah membaca posting ini tetapi saya masih tidak mengerti bagaimana memilih yang paling cocok. Dari cocok saya, saya memiliki dua output: > summary(m) Formula: y ~ I(a * x^b) Parameters: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) a 479.92903 62.96371 7.622 0.000618 *** …

12 r  least-squares  nonlinear-regression  goodness-of-fit 

Dalam sebuah makalah baru-baru ini Norton et al. (2018) menyatakan itu[1][1]^{[1]} Rasio odds yang berbeda dari studi yang sama tidak dapat dibandingkan ketika model statistik yang menghasilkan estimasi rasio odds memiliki variabel penjelas yang berbeda karena setiap model memiliki faktor penskalaan arbitrer yang berbeda. Juga tidak bisa besarnya rasio odds …

12 r  logistic  meta-analysis  odds-ratio  adjustment 

Masalah berikut telah diposting di Halaman Facebook Mensa International: \quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad Posting itu sendiri menerima 1000+ komentar tetapi saya tidak akan membahas detail tentang perdebatan di sana karena saya tahu ini adalah paradoks kotak Bertrand dan jawabannya adalah . Apa yang membuat saya tertarik di sini adalah bagaimana seseorang menjawab masalah …

12 r  probability  simulation  monte-carlo  paradox 

Saya telah menjelajahi sejumlah alat untuk perkiraan, dan telah menemukan Generalized Additive Models (GAMs) memiliki potensi paling besar untuk tujuan ini. GAM itu luar biasa! Mereka memungkinkan untuk model yang rumit untuk ditentukan dengan sangat ringkas. Namun, kejelasan yang sama itu membuat saya kebingungan, khususnya terkait dengan bagaimana GAM memahami …

12 r  modeling  gam  mgcv 

Dalam R, saya memiliki sampel 348 tindakan, dan ingin tahu apakah saya dapat berasumsi bahwa itu didistribusikan secara normal untuk tes di masa mendatang. Pada dasarnya mengikuti jawaban Stack lain , saya melihat plot kepadatan dan plot QQ dengan: plot(density(Clinical$cancer_age)) qqnorm(Clinical$cancer_age);qqline(Clinical$cancer_age, col = 2) Saya tidak memiliki pengalaman yang kuat …

12 r  normal-distribution 

Polinomial ortogonal dalam set titik univariat adalah polinomial yang menghasilkan nilai pada titik-titik tersebut dengan cara yang mana produk titiknya dan korelasi berpasangannya nol. R dapat menghasilkan polinomial ortogonal dengan fungsi poli . Fungsi yang sama memiliki varian polim yang menghasilkan polinomial ortogonal pada set titik multivariat. Bagaimanapun polinomial yang …

12 r  multiple-regression  polynomial  orthogonal 

Saya ingin mendapatkan interval kepercayaan 95% pada prediksi nlmemodel campuran non-linear . Karena tidak ada standar yang disediakan untuk melakukan hal ini di dalam nlme, saya bertanya-tanya apakah benar menggunakan metode "interval prediksi populasi", sebagaimana diuraikan dalam bab buku Ben Bolker dalam konteks model yang sesuai dengan kemungkinan maksimum , …

12 r  mixed-model  confidence-interval  lme4-nlme 

Saya telah menggunakan model linier untuk melakukan tes proporsi 2 sampel untuk sementara waktu, tetapi telah menyadari bahwa mungkin tidak sepenuhnya benar. Tampaknya menggunakan model linier umum dengan tautan keluarga + identitas binomial memberikan hasil tes proporsi 2 sampel yang tidak dikumpulkan. Namun, menggunakan model linier (atau glm dengan keluarga …

12 r  hypothesis-testing  generalized-linear-model  proportion 

Misalnya, dalam R jika Anda memanggil acf()fungsinya, ia akan memplot sebuahogram korelasi secara default, dan menggambar interval kepercayaan 95%. Melihat kode, jika Anda menelepon plot(acf_object, ci.type="white"), Anda melihat: qnorm((1 + ci)/2)/sqrt(x$n.used) sebagai batas atas untuk jenis white-noise. Bisakah seseorang menjelaskan teori di balik metode ini? Mengapa kita mendapatkan qnorm 1 …

12 r  confidence-interval  autocorrelation 

Saya mencoba mencari cara untuk mendeteksi jumlah suku kata dalam korpus rekaman audio. Saya pikir proxy yang baik mungkin adalah puncak dalam file wave. Inilah yang saya coba dengan file saya berbicara dalam bahasa Inggris (kasus penggunaan saya yang sebenarnya adalah dalam Kiswahili). Transkrip rekaman contoh ini adalah: "Ini saya …

12 r  signal-processing 

Saya membuat pengukuran dua variabel dan . Mereka berdua mengetahui ketidakpastian dan terkait dengannya. Saya ingin menemukan hubungan antara dan . Bagaimana saya bisa melakukannya?x y σ x σ y x ynnnxxxyyyσxσx\sigma_xσyσy\sigma_yxxxyyy EDIT : setiap memiliki terkait dengannya, dan sama dengan .σ x , i y ixsayaxix_iσx , sayaσx,i\sigma_{x,i}ysayayiy_i Contoh …

12 r  regression  deming-regression