Pertanyaan yang diberi tag «r»

Saya ingin menemukan cara untuk mengukur intensitas bimodality dari beberapa distribusi yang saya dapatkan secara empiris. Dari apa yang saya baca, masih ada beberapa perdebatan tentang cara mengukur bimodality. Saya memilih untuk menggunakan tes dip Hartigans 'yang tampaknya menjadi satu-satunya yang tersedia di R (kertas asli: http://www.stat.washington.edu/wxs/Stat593-s03/Literature/hartigan85a.pdf ). Uji celup …

18 r  distributions 

Saya menggunakan K-means untuk mengelompokkan data saya dan sedang mencari cara untuk menyarankan nomor cluster "optimal". Statistik gap tampaknya menjadi cara umum untuk menemukan nomor cluster yang baik. Untuk beberapa alasan ia mengembalikan 1 sebagai nomor cluster optimal, tetapi ketika saya melihat data jelas bahwa ada 2 cluster: Ini adalah …

18 r  machine-learning  clustering  k-means 

Misalkan saya memiliki data dengan dua grup independen: g1.lengths <- c (112.64, 97.10, 84.18, 106.96, 98.42, 101.66) g2.lengths <- c (84.44, 82.10, 83.26, 81.02, 81.86, 86.80, 85.84, 97.08, 79.64, 83.32, 91.04, 85.92, 73.52, 85.58, 97.70, 89.72, 88.92, 103.72, 105.02, 99.48, 89.50, 81.74) group = rep (c ("g1", "g2"), c (length …

18 r  hypothesis-testing  bootstrap  small-sample  permutation-test 

Saya ingin mendeteksi perubahan dalam data deret waktu, yang biasanya memiliki bentuk yang sama. Sejauh ini saya telah bekerja dengan changepointpaket untuk R cpt.mean(), cpt.var()dan cpt.meanvar()fungsi. cpt.mean()dengan metode PELT berfungsi dengan baik ketika data biasanya tetap pada satu tingkat. Namun saya juga ingin mendeteksi perubahan saat turun. Contoh untuk perubahan, …

18 r  time-series  change-point  structural-change 

Beberapa dari Anda mungkin telah membaca makalah yang bagus ini: O'Hara RB, Kotze DJ (2010) Jangan log-transform data hitungan. Metode dalam Ekologi dan Evolusi 1: 118-122. klick . Dalam bidang penelitian saya (ekotoksikologi), kita sedang berhadapan dengan eksperimen yang direplikasi dengan buruk dan GLM tidak banyak digunakan. Jadi saya melakukan …

18 r  generalized-linear-model  simulation  negative-binomial  type-i-and-ii-errors 

Tutup. Pertanyaan ini di luar topik . Saat ini tidak menerima jawaban. Ingin meningkatkan pertanyaan ini? Perbarui pertanyaan sehingga sesuai topik untuk Cross Validated. Ditutup 5 tahun yang lalu . Saya mencoba menyusun daftar algoritma pengelompokan yang: Diimplementasikan dalam R Beroperasi pada matriks data jarang (bukan (dis) matriks kesamaan), seperti …

18 r  clustering  sparse 

Saya ingin melakukan regresi linier yang sangat sederhana di R. Rumusnya sesederhana . Namun saya ingin kemiringan ( ) berada di dalam interval, katakanlah, antara 1,4 dan 1,6.ay= a x + by=Sebuahx+by = ax + bSebuahSebuaha Bagaimana ini bisa dilakukan?

18 r  regression  constrained-regression 

Untuk membuat bagan ini, saya membuat sampel acak dengan ukuran berbeda dari distribusi normal dengan mean = 0 dan sd = 1. Interval kepercayaan kemudian dihitung menggunakan cutoff alfa mulai dari 0,001 hingga 0,999 (garis merah) dengan fungsi t.test (), kemungkinan profil dihitung menggunakan kode di bawah ini yang saya …

18 r  confidence-interval  profile-likelihood 

Apakah implementasi ER lebih efisien (mirip Extreme Gradient Boostingdengan peningkatan gradien) - apakah perbedaannya penting dari sudut pandang praktis? Ada paket R yang mengimplementasikannya. Apakah ini algoritma baru yang mengatasi implementasi "generik" (paket RandomForest dari R) tidak hanya dalam hal efisiensi atau juga di beberapa area lain? Extreme Random Forest …

18 r  machine-learning  algorithms  random-forest 

Saya tahu bahwa salah satu keuntungan dari model campuran adalah bahwa mereka memungkinkan untuk menentukan matriks varians-kovarians untuk data (simetri gabungan, autoregresif, tidak terstruktur, dll.) Namun, lmerfungsi dalam R tidak memungkinkan spesifikasi mudah dari matriks ini. Adakah yang tahu struktur apa yang lmerdigunakan secara default dan mengapa tidak ada cara …

18 r  mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

Saya perlu menghitung jarak sampel Mahalanobis dalam R antara setiap pasangan pengamatan dalam matriks kovariat . Saya memerlukan solusi yang efisien, yaitu hanya jarak yang dihitung, dan lebih baik diimplementasikan dalam C / RCpp / Fortran dll. Saya berasumsi bahwa , matriks kovarian populasi, tidak diketahui dan menggunakan sampel matriks …

18 r  algorithms  distance 

Saya telah menggunakan SAS secara profesional selama hampir 5 tahun sekarang. Saya sudah menginstalnya di laptop saya dan sering harus menganalisis dataset dengan 1.000-2.000 variabel dan ratusan ribu pengamatan. Saya telah mencari alternatif untuk SAS yang memungkinkan saya untuk melakukan analisis pada set data berukuran serupa. Saya ingin tahu apa …

18 r  sas  large-data 

Berapa nilai diberikan dalam ringkasan model coxph dalam R? Sebagai contoh,R2R2R^2 Rsquare= 0.186 (max possible= 0.991 ) Saya dengan bodohnya memasukkannya sebagai manuskrip sebagai nilai dan pengulas langsung mengatakan bahwa ia tidak mengetahui analog dari statistik dari regresi linier klasik yang sedang dikembangkan untuk model Cox dan jika ada, silakan …

18 r  survival  r-squared  cox-model 

Saya berencana untuk melakukan studi simulasi di mana saya membandingkan kinerja beberapa teknik korelasi kuat dengan distribusi yang berbeda (condong, dengan outlier, dll.). Dengan robust , maksud saya kasus ideal kuat terhadap a) distribusi yang miring, b) outlier, dan c) ekor yang berat. Seiring dengan korelasi Pearson sebagai garis dasar, …

18 r  correlation  robust  spearman-rho  winsorizing 

Secara khusus, bagaimana kesalahan standar efek tetap dalam model efek campuran linier harus dihitung (dalam arti frequentist)? Saya telah memimpin untuk percaya bahwa perkiraan tipikal ( ), seperti yang disajikan dalam Laird dan Ware [1982] akan memberikan SE ukurannya diremehkan karena estimasi komponen varians diperlakukan seolah-olah mereka adalah nilai sebenarnya.Var(β^)=(X′VX)-1Var(β^)=(X′VX)-1{\rm …

18 r  mixed-model  random-effects-model