Pertanyaan yang diberi tag «r»

Paket R mclustmenggunakan BIC sebagai kriteria untuk pemilihan model klaster. Dari pemahaman saya, model dengan BIC terendah harus dipilih daripada model lain (jika Anda hanya peduli tentang BIC). Namun, ketika nilai BIC semuanya negatif, Mclustfungsi tersebut default ke model dengan nilai BIC tertinggi. Pemahaman saya secara keseluruhan dari berbagai uji …

11 r  clustering  gaussian-mixture  bic  model-based-clustering 

Pertanyaan saya terinspirasi oleh generator nomor acak eksponensial bawaan R , fungsinya rexp(). Ketika mencoba untuk menghasilkan angka acak yang didistribusikan secara eksponensial, banyak buku teks merekomendasikan metode transformasi terbalik seperti yang diuraikan dalam halaman Wikipedia ini . Saya sadar bahwa ada metode lain untuk menyelesaikan tugas ini. Secara khusus, …

11 r  simulation  random-generation  exponential  inverse-cdf 

Saya sedang melakukan penelitian untuk melihat perbedaan dalam kepadatan ikan dan kekayaan spesies ikan ketika menggunakan dua metode sensus visual bawah air yang berbeda. Data saya awalnya menghitung data tetapi biasanya ini diubah menjadi kepadatan ikan tetapi saya masih memutuskan untuk menggunakan Poisson GLM, yang saya harap benar. model1 <- …

11 r  generalized-linear-model  poisson-distribution  offset 

Saya sudah mendapat data permintaan setengah jam, yang merupakan rangkaian waktu multi-musiman. Aku digunakan tbatsdalam forecastpaket di R, dan mendapat hasil seperti ini: TBATS(1, {5,4}, 0.838, {<48,6>, <336,6>, <17520,5>}) Apakah ini berarti seri tidak harus menggunakan transformasi Box-Cox, dan istilah kesalahan adalah ARMA (5, 4), dan 6, 6 dan 5 …

11 r  time-series  diagnostic  multiple-seasonalities  tbats 

Saya mencoba memahami dan tahu apa yang harus dilaporkan dari analisis saya tentang beberapa data menggunakan model rata-rata di R. Saya menggunakan skrip berikut untuk menganalisis pengaruh metode pengukuran terhadap variabel yang diberikan: Berikut adalah dataset: https://www.dropbox.com/s/u9un273gzw9o30u/VMT4.csv?dl=0 Model yang akan dipasang: LM.1 <- gls(VMTf ~ turn+sex+method, na.action="na.fail", method = "ML",VMT4) …

11 r  model-averaging 

Saya telah mengidentifikasi beberapa tempat di buku teks di mana GLM dijelaskan dengan 5 distribusi (yaitu, Gamma, Gaussian, Binomial, Inverse Gaussian, & Poisson). Ini juga dicontohkan dalam fungsi keluarga dalam R. Kadang-kadang saya menemukan referensi ke GLM di mana distribusi tambahan disertakan ( contoh ). Dapatkah seseorang menjelaskan mengapa 5 …

11 r  probability  distributions  generalized-linear-model 

Saya ingin mensimulasikan proses tamasya Brown (gerakan Brown yang dikondisikan selalu positif ketika hingga pada t = 1 ). Karena proses tamasya Brown adalah jembatan Brown yang dikondisikan untuk selalu positif, saya berharap untuk mensimulasikan gerakan tamasya Brown menggunakan jembatan Brown.0<t<10<t<10 \lt t \lt 1000t=1t=1t=1 Dalam R, saya menggunakan paket …

11 r  gaussian-process  brownian 

Saya akan melalui bagian LAB §6.6 tentang Ridge Regression / Lasso dalam buku 'Pengantar Pembelajaran Statistik dengan Aplikasi dalam R' oleh James, Witten, Hastie, Tibshirani (2013). Lebih khusus lagi, saya mencoba menerapkan model scikit-learning Ridgeke dataset 'Hitters' dari paket R 'ISLR'. Saya telah membuat set fitur yang sama seperti yang …

11 r  machine-learning  scikit-learn  regression 

Ini mirip dengan Bootstrap: perkiraan di luar interval kepercayaan Saya memiliki beberapa data yang mewakili jumlah genotipe dalam suatu populasi. Saya ingin memperkirakan keragaman genetik menggunakan indeks Shannon dan juga menghasilkan interval kepercayaan menggunakan bootstrap. Namun, saya perhatikan bahwa perkiraan melalui bootstrap cenderung sangat bias dan menghasilkan interval kepercayaan yang …

11 r  confidence-interval  bootstrap  bias  diversity 

Saya sedang mencari metode binning optimal (diskritisasi) dari variabel kontinu sehubungan dengan respon yang diberikan (target) variabel biner dan dengan jumlah interval maksimum sebagai parameter. contoh: Saya memiliki satu set pengamatan orang dengan variabel "tinggi" (angka kontinu) dan "has_back_pains" (biner). Saya ingin melakukan diskritisasi tinggi menjadi 3 interval (kelompok) paling …

11 r  dataset  optimization  discrete-data  binning 

Saya mencoba menentukan rumus untuk model efek campuran linier (dengan lme4) untuk desain eksperimental saya, tetapi saya tidak yakin saya melakukannya dengan benar. Desain: pada dasarnya saya mengukur parameter respons pada tanaman. Saya memiliki 4 tingkat perawatan, dan 2 tingkat irigasi. Tanaman dikelompokkan dalam 16 plot, dalam setiap plot saya …

11 r  experiment-design  mixed-model 

Saya telah membangun model GLM di R dan telah mengujinya menggunakan kelompok pengujian dan pelatihan sehingga saya yakin itu bekerja dengan baik. Hasil dari R adalah: Coefficients: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) (Intercept) -2.781e+00 1.677e-02 -165.789 < 2e-16 *** Coeff_A 1.663e-05 5.438e-06 3.059 0.00222 ** log(Coeff_B) 8.925e-01 1.023e-02 87.245 …

11 r  generalized-linear-model  chi-squared 

Saya mencoba menggunakan analisis faktor konfirmatori (CFA) lavaan. Saya mengalami kesulitan menafsirkan output yang dihasilkan oleh lavaan. Saya memiliki model sederhana - masing-masing 4 faktor didukung oleh item dari data survei yang dikumpulkan. Faktor-faktor ini sejalan dengan apa yang diukur oleh item, sejauh tampaknya mereka dapat berfungsi sebagai pengukuran yang …

11 r  sem  confirmatory-factor  lavaan 

Ketika memodelkan proporsi berkelanjutan (misalnya tutupan vegetasi proporsional pada kuadrat survei, atau proporsi waktu yang terlibat dalam suatu kegiatan), regresi logistik dianggap tidak sesuai (misalnya Warton & Hui (2011). Arcsine adalah asinin: analisis proporsi dalam ekologi ). Sebaliknya, regresi OLS setelah mentransformasi proporsi, atau mungkin regresi beta, lebih tepat. Di …

11 r  regression  logistic 

Saya ingin melakukan hal berikut: 1) Regresi OLS (tanpa istilah hukuman) untuk mendapatkan koefisien beta ; adalah variabel yang digunakan untuk regresi. Saya melakukan ini denganb∗jbj∗b_{j}^{*}jjj lm.model = lm(y~ 0 + x) betas = coefficients(lm.model) 2) Regresi Lasso dengan masa hukuman, kriteria pemilihannya adalah Kriteria Informasi Bayesian (BIC), yang diberikan …

11 r  regression  glmnet  lars