Pertanyaan yang diberi tag «sequence-analysis»

Entropi Shannon adalah negatif dari jumlah probabilitas setiap hasil dikalikan dengan logaritma probabilitas untuk setiap hasil. Apa tujuan yang dilayani oleh logaritma dalam persamaan ini? Jawaban intuitif atau visual (sebagai lawan dari jawaban yang sangat matematis) akan diberikan poin bonus!

72 entropy  intuition  sequence-analysis 

Distribusi binomial negatif telah menjadi model yang populer untuk menghitung data (khususnya jumlah sekuens yang diharapkan dibaca dalam wilayah genom tertentu dari percobaan yang diberikan) dalam bioinformatika. Penjelasannya bervariasi: Beberapa menjelaskannya sebagai sesuatu yang bekerja seperti distribusi Poisson tetapi memiliki parameter tambahan, memungkinkan lebih banyak kebebasan untuk memodelkan distribusi yang …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

Saya memiliki GLMM formulir: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Ketika saya menggunakan drop1(model, test="Chi"), saya mendapatkan hasil yang berbeda daripada jika saya menggunakan Anova(model, type="III")dari paket mobil atau summary(model). Dua yang terakhir ini memberikan jawaban yang sama. Menggunakan banyak data yang …

10 r  anova  glmm  r  mixed-model  bootstrap  sample-size  cross-validation  roc  auc  sampling  stratification  random-allocation  logistic  stata  interpretation  proportion  r  regression  multiple-regression  linear-model  lm  r  cross-validation  cart  rpart  logistic  generalized-linear-model  econometrics  experiment-design  causality  instrumental-variables  random-allocation  predictive-models  data-mining  estimation  contingency-tables  epidemiology  standard-deviation  mean  ancova  psychology  statistical-significance  cross-validation  synthetic-data  poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis  distributions  binomial  classification  k-means  distance  unsupervised-learning  euclidean  correlation  chi-squared  spearman-rho  forecasting  excel  exponential-smoothing  binomial  sample-size  r  change-point  wilcoxon-signed-rank  ranks  clustering  matlab  covariance  covariance-matrix  normal-distribution  simulation  random-generation  bivariate  standardization  confounding  z-statistic  forecasting  arima  minitab  poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion  probability  self-study  markov-process  estimation  maximum-likelihood  classification  pca  group-differences  chi-squared  survival  missing-data  contingency-tables  anova  proportion 

Situasi: Dua burung (jantan dan betina) melindungi telur mereka di sarang dari pengganggu. Setiap burung dapat menggunakan serangan atau ancaman untuk perlindungan, dan hadir atau tidak ada. Ada pola yang muncul dari data bahwa perilaku mungkin saling melengkapi - serangan laki-laki sementara perempuan menggunakan tampilan ancaman dan sebaliknya. Pertanyaan saya …

10 r  sequence-analysis 

Saya menganalisis dataset yang berisi pengamatan dari n sejumlah upaya oleh pemain dalam sebuah permainan. Jika saya membangun model regresi untuk memprediksi hasil dari setiap upaya yang diberikan 1 atau lebih deskriptor mengenai upaya masing-masing pemain , bagaimana cara mengukur berapa banyak upaya pemain harus sebelum deskriptor tertentu menjadi "bermakna" …

8 regression  statistical-significance  bayesian  p-value  sequence-analysis 

Saya bekerja dengan data urutan yang merupakan daftar panjang panggilan win-api malware. Saya mencoba memasukkan masalah mengidentifikasi 'perilaku malware' ke dalam salah satu pola pencarian berurutan. Saya memperlakukan setiap panggilan api sebagai Itemet item tunggal. Jumlah item yang mungkin berbeda (panggilan api) cukup besar. Sekarang, ketika saya menerapkan algoritma SPADE …

8 sequence-analysis  sequential-pattern-mining