Pertanyaan yang diberi tag «r»

Dalam contoh berikut > m = matrix(c(3, 6, 5, 6), nrow=2) > m [,1] [,2] [1,] 3 5 [2,] 6 6 > (OR = (3/6)/(5/6)) #1 [1] 0.6 > fisher.test(m) #2 Fisher's Exact Test for Count Data data: m p-value = 0.6699 alternative hypothesis: true odds ratio is not equal …

14 r  odds-ratio  fishers-exact 

Saya menggunakan skrip. Ini untuk catatan inti. Saya memiliki kerangka data yang menunjukkan komposisi unsur yang berbeda di dalam kolom di atas kedalaman tertentu (di kolom pertama). Saya ingin melakukan PCA dengannya dan saya bingung tentang metode standardisasi yang harus saya pilih. Apakah ada di antara Anda yang menggunakan clr()untuk …

13 r  pca  normalization  compositional-data 

Douglas Bates menyatakan bahwa model-model berikut ini setara "jika matriks varians-kovarians untuk efek acak bernilai vektor memiliki bentuk khusus, yang disebut simetri gabungan" ( slide 91 dalam presentasi ini ): m1 <- lmer(y ~ factor + (0 + factor|group), data) m2 <- lmer(y ~ factor + (1|group) + (1|group:factor), data) …

13 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Sedikit latar belakang saya bekerja pada interpretasi analisis regresi tetapi saya benar-benar bingung tentang arti r, r kuadrat dan standar deviasi residual. Saya tahu definisi: Penokohan r mengukur kekuatan dan arah hubungan linear antara dua variabel pada sebar scatter R-squared adalah ukuran statistik seberapa dekat data dengan garis regresi pas. …

13 r  regression  regression-coefficients  linear  pearson-r 

Sejauh yang saya tahu, perbedaan antara model logistik dan model respons fraksional (frm) adalah bahwa variabel dependen (Y) di mana frm adalah [0,1], tetapi logistik adalah {0, 1}. Selanjutnya, frm menggunakan estimator kuasi-kemungkinan untuk menentukan parameternya. Biasanya, kita dapat menggunakan glmmodel logistik untuk mendapatkan glm(y ~ x1+x2, data = dat, …

13 r  logistic  generalized-linear-model  quasi-likelihood 

Pertanyaan saya berkaitan dengan teknik perhitungan yang dieksploitasi di geoR:::.negloglik.GRFatau geoR:::solve.geoR. Dalam pengaturan model campuran linier: mana dan masing-masing adalah efek tetap dan acak. Juga,Y= Xβ+ Zb + eY=Xβ+Zb+e Y=X\beta+Zb+e ββ\betabbbΣ=cov(Y)Σ=cov(Y)\Sigma=\text{cov}(Y) Ketika memperkirakan efek, ada kebutuhan untuk menghitung yang biasanya dapat dilakukan menggunakan sesuatu seperti , tetapi kadang-kadang hampir tidak …

13 r  eigenvalues  matrix-decomposition  matrix-inverse  cholesky 

Saya sedang mengerjakan proyek kecil di mana kami mencoba memprediksi harga komoditas (Minyak, Aluminium, Timah, dll.) Selama 6 bulan ke depan. Saya punya 12 variabel untuk diprediksi dan saya punya data dari Apr, 2008 - Mei 2013. Bagaimana saya harus pergi tentang prediksi? Saya telah melakukan yang berikut: Data yang …

13 r  time-series  forecasting  neural-networks  arima 

Saya ingin melakukan tes W Shapiro Wilk dan tes Kolmogorov-Smirnov pada residu model linier untuk memeriksa normalitas. Saya hanya bertanya-tanya residual apa yang harus digunakan untuk ini - residu mentah, residu Pearson, residu pelajar atau residu terstandarisasi? Untuk uji W Shapiro-Wilk tampak bahwa hasil untuk residu baku & Pearson identik …

13 r  regression  residuals  normality-assumption  lm 

Saya belajar dalam statistik dasar bahwa, dengan model linear umum, agar kesimpulan valid, pengamatan harus independen. Ketika pengelompokan terjadi, independensi mungkin tidak lagi mengarah pada inferensi yang tidak valid kecuali hal ini diperhitungkan. Salah satu cara untuk menjelaskan pengelompokan tersebut adalah dengan menggunakan model campuran. Saya ingin mencari contoh dataset, …

13 r  mixed-model  inference  independence 

Saya memiliki data tentang berapa banyak pengguna memposting berapa banyak pertanyaan. Sebagai contoh, [UserCount, QuestionCount] [2, 100] [9, 10] [3, 80] ... ... Ini berarti bahwa 2 pengguna masing-masing memposting 100 pertanyaan, masing-masing 9 pengguna memposting 10 pertanyaan, dan seterusnya. Jadi, bagaimana saya bisa menentukan apakah UserCount, QuestionCountdistribusi mengikuti hukum …

13 r  hypothesis-testing  goodness-of-fit  power-law 

Saya telah mendapatkan model regresi logistik (via train) untuk respons biner, dan saya telah mendapatkan matriks kebingungan logistik via confusionMatrixin caret. Ini memberi saya matriks kebingungan model logistik, meskipun saya tidak yakin apa ambang batas yang digunakan untuk mendapatkannya. Bagaimana cara mendapatkan matriks kebingungan untuk nilai ambang batas tertentu menggunakan …

13 r  classification  roc  caret  confusion-matrix 

Secara umum, saya bertanya-tanya apakah ada yang lebih baik untuk tidak menggunakan polinomial ortogonal ketika menyesuaikan regresi dengan variabel orde tinggi. Secara khusus, saya ingin tahu dengan penggunaan R: Jika poly()dengan raw = FALSEmenghasilkan nilai pas yang sama poly()dengan raw = TRUE, dan polydengan raw = FALSEmemecahkan beberapa masalah yang …

13 r  regression  polynomial 

Latar Belakang Saya mencoba untuk memahami contoh pertama dalam kursus model pas (jadi ini mungkin tampak sangat sederhana). Saya sudah melakukan perhitungan dengan tangan dan mereka cocok dengan contoh, tetapi ketika saya ulangi dalam R, koefisien model tidak aktif. Saya pikir perbedaannya mungkin karena buku teks menggunakan varians populasi ( …

13 r  regression  self-study  lm 

Saya memiliki dataset dengan asumsi bahwa tetangga terdekat adalah prediktor terbaik. Hanya contoh sempurna dari gradien dua arah divisualisasikan- Misalkan kita memiliki kasus di mana beberapa nilai hilang, kita dapat dengan mudah memprediksi berdasarkan tetangga dan tren. Matriks data yang sesuai dalam R (contoh boneka untuk latihan): miss.mat <- matrix …

13 r  prediction  outliers  data-imputation  multiple-imputation 

Saya memahami konsep penskalaan matriks data untuk digunakan dalam model regresi linier. Misalnya, dalam R Anda dapat menggunakan: scaled.data <- scale(data, scale=TRUE) Satu-satunya pertanyaan saya adalah, untuk pengamatan baru yang ingin saya prediksi nilai outputnya, bagaimana mereka diskalakan dengan benar? Apakah itu , scaled.new <- (new - mean(data)) / std(data)?

13 r  regression  prediction  scales