Pertanyaan yang diberi tag «mixed-model»

Saya telah melihat pemodelan efek campuran menggunakan paket lme4 di R. Saya terutama menggunakan lmerperintah jadi saya akan mengajukan pertanyaan saya melalui kode yang menggunakan sintaks itu. Saya kira pertanyaan umum yang mudah mungkin, apakah boleh untuk membandingkan dua model yang dibangun dalam lmermenggunakan rasio kemungkinan berdasarkan pada dataset identik? …

20 r  mixed-model  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Logika multiple imputation (MI) adalah untuk menghitung nilai yang hilang tidak hanya sekali tetapi beberapa kali (biasanya M = 5) kali, menghasilkan set data selesai M. Kumpulan data M lengkap kemudian dianalisis dengan metode data lengkap tempat estimasi M dan kesalahan standarnya digabungkan menggunakan rumus Rubin untuk mendapatkan taksiran "keseluruhan" …

20 modeling  confidence-interval  mixed-model  data-imputation 

Presisi didefinisikan sebagai: p = true positives / (true positives + false positives) Apakah benar bahwa, sebagai true positivesdan false positivespendekatan 0, presisi mendekati 1? Pertanyaan yang sama untuk diingat: r = true positives / (true positives + false negatives) Saat ini saya sedang menerapkan tes statistik di mana saya …

20 precision-recall  data-visualization  logarithm  references  r  networks  data-visualization  standard-deviation  probability  binomial  negative-binomial  r  categorical-data  aggregation  plyr  survival  python  regression  r  t-test  bayesian  logistic  data-transformation  confidence-interval  t-test  interpretation  distributions  data-visualization  pca  genetics  r  finance  maximum  probability  standard-deviation  probability  r  information-theory  references  computational-statistics  computing  references  engineering-statistics  t-test  hypothesis-testing  independence  definition  r  censoring  negative-binomial  poisson-distribution  variance  mixed-model  correlation  intraclass-correlation  aggregation  interpretation  effect-size  hypothesis-testing  goodness-of-fit  normality-assumption  small-sample  distributions  regression  normality-assumption  t-test  anova  confidence-interval  z-statistic  finance  hypothesis-testing  mean  model-selection  information-geometry  bayesian  frequentist  terminology  type-i-and-ii-errors  cross-validation  smoothing  splines  data-transformation  normality-assumption  variance-stabilizing  r  spss  stata  python  correlation  logistic  logit  link-function  regression  predictor  pca  factor-analysis  r  bayesian  maximum-likelihood  mcmc  conditional-probability  statistical-significance  chi-squared  proportion  estimation  error  shrinkage  application  steins-phenomenon 

Kita tahu bahwa uji- t berpasangan hanyalah kasus khusus dari ANOVA langkah-langkah berulang satu arah (atau dalam subjek) serta model efek campuran linier, yang dapat ditunjukkan dengan fungsi lme () yang berfungsi sebagai paket nlme dalam R seperti yang ditunjukkan di bawah ini. #response data from 10 subjects under two …

20 r  mixed-model  t-test  repeated-measures  lme4-nlme 

Pertimbangkan data berikut dari dua arah dalam desain subjek: df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 Jim Cued Neu …

19 mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Katakanlah kita harus GLMM mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) Model-model ini tidak bersarang dalam arti biasa: a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) b <- glmer(y …

19 r  mixed-model  aic  lme4-nlme  nested-models 

Katakanlah kami sedang mengerjakan model efek acak dari beberapa data jumlah dari waktu ke waktu, dan kami ingin mengendalikan beberapa tren. Biasanya, Anda akan melakukan sesuatu seperti: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") untuk memasukkan bentuk kuadrat untuk t. Apakah mungkin untuk menggunakan beberapa teknik smoothing yang lebih canggih seperti …

19 mixed-model  lme4-nlme  splines 

Ada perbedaan yang membuat saya bingung dengan model campuran, dan saya bertanya-tanya apakah saya bisa mendapatkan kejelasan tentang itu. Mari kita asumsikan Anda punya model campuran data hitungan. Ada variabel yang Anda tahu Anda inginkan sebagai efek tetap (A) dan variabel lain untuk waktu (T), dikelompokkan dengan mengatakan variabel "Situs". …

19 r  mixed-model  lme4-nlme 

Pada dasarnya apa yang saya pikirkan adalah bagaimana struktur kovarian yang berbeda ditegakkan, dan bagaimana nilai-nilai di dalam matriks ini dihitung. Fungsi seperti lme () memungkinkan kami untuk memilih struktur mana yang kami inginkan, tetapi saya ingin tahu bagaimana perkiraannya. Pertimbangkan model efek campuran linier .Y= Xβ+ Zu + ϵY=Xβ+Zkamu+ϵY=X\beta+Zu+\epsilon …

19 mixed-model  random-effects-model  covariance  covariance-matrix 

Saya mencoba menggunakan lmedari nlmepaket untuk mereplikasi hasil dari aovuntuk ANOVA tindakan berulang. Saya telah melakukan ini untuk percobaan pengukuran berulang faktor tunggal dan untuk eksperimen dua faktor dengan satu faktor antar-subjek dan satu faktor dalam-subyek, tetapi saya mengalami kesulitan melakukannya untuk eksperimen dua faktor dengan dua dalam -subyek faktor. …

19 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Saya mencoba untuk menghasilkan model yang saya punya variabel respon yang merupakan proporsi antara 0 dan 1, ini mencakup beberapa 0s dan 1s tetapi juga banyak nilai di antaranya. Saya sedang berpikir tentang mencoba regresi beta. Paket yang saya temukan untuk R (betareg) hanya memungkinkan nilai antara 0 dan 1 …

19 regression  mixed-model  beta-distribution  zero-inflation  beta-regression 

Silakan pertimbangkan data ini: dt.m <- structure(list(id = c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12), occasion = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, …

19 r  mixed-model  stata  lme4-nlme 

Menanggapi pertanyaan ini , mengenai apakah desain saya di mana saya secara acak menyajikan peserta dengan gambar-gambar dari kategori yang berbeda adalah contoh di mana saya harus menggunakan langkah-langkah ANOVA yang berulang, saya mendapat jawaban bahwa saya harus menggunakan model campuran, sebagai gantinya. alasannya adalah bahwa saya memiliki dua bentuk …

19 anova  mixed-model  repeated-measures 

Bisakah saya mendapatkan bantuan untuk menyelesaikan upaya sementara (sedang berlangsung) untuk mendapatkan posisi yang sesuai dengan ANOVA dan REGRESI? Saya telah berusaha mendamaikan konsep, nomenklatur dan sintaksis dari kedua metodologi ini. Ada banyak posting di situs ini tentang kesamaan mereka, misalnya ini atau ini , tetapi masih bagus untuk memiliki …

18 regression  anova  mixed-model 

Saya telah membaca beberapa buku (Raudenbush & Bryk, Snijders & Bosker, Gelman & Hill, dll.) Dan beberapa artikel (Gelman, Jusko, Primo & Jacobsmeier, dll.), Dan saya masih belum benar-benar membungkus kepala saya perbedaan utama antara menggunakan kesalahan standar berkerumun ayat pemodelan bertingkat. Saya memahami bagian-bagian yang berkaitan dengan pertanyaan penelitian …

18 mixed-model  multilevel-analysis  clustered-standard-errors