Pertanyaan yang diberi tag «mgcv»

Saya semakin sering menggunakan GAM. Ketika saya pergi untuk memberikan referensi untuk berbagai komponen mereka (pemilihan parameter smoothing, berbagai basis spline, p-nilai istilah halus), mereka semua dari satu peneliti - Simon Wood, di University of Bath, di Inggris. Dia juga pemelihara mgcvdi R, yang mengimplementasikan tubuh kerjanya. mgcvsangat rumit, tetapi …

19 nonparametric  gam  mgcv  academia  semiparametric 

Saya mencoba mencari cara untuk mengontrol parameter smoothing dalam model mgcv: gam. Saya memiliki variabel binomial yang saya coba modelkan terutama sebagai fungsi koordinat x dan y pada grid tetap, ditambah beberapa variabel lain dengan pengaruh yang lebih kecil. Di masa lalu saya telah membangun model regresi lokal yang cukup …

14 r  smoothing  mgcv 

Saya telah menjelajahi sejumlah alat untuk perkiraan, dan telah menemukan Generalized Additive Models (GAMs) memiliki potensi paling besar untuk tujuan ini. GAM itu luar biasa! Mereka memungkinkan untuk model yang rumit untuk ditentukan dengan sangat ringkas. Namun, kejelasan yang sama itu membuat saya kebingungan, khususnya terkait dengan bagaimana GAM memahami …

12 r  modeling  gam  mgcv 

The mgcvpaket untuk Rmemiliki dua fungsi untuk pas interaksi produk tensor: te()dan ti(). Saya memahami pembagian kerja dasar antara keduanya (menyesuaikan interaksi non-linear vs menguraikan interaksi ini menjadi efek utama dan interaksi). Yang tidak saya mengerti adalah mengapa te(x1, x2)dan ti(x1) + ti(x2) + ti(x1, x2)mungkin menghasilkan (sedikit) hasil yang …

11 r  gam  mgcv  conditional-probability  mixed-model  references  bayesian  estimation  conditional-probability  machine-learning  optimization  gradient-descent  r  hypothesis-testing  wilcoxon-mann-whitney  time-series  bayesian  inference  change-point  time-series  anova  repeated-measures  statistical-significance  bayesian  contingency-tables  regression  prediction  quantiles  classification  auc  k-means  scikit-learn  regression  spatial  circular-statistics  t-test  effect-size  cohens-d  r  cross-validation  feature-selection  caret  machine-learning  modeling  python  optimization  frequentist  correlation  sample-size  normalization  group-differences  heteroscedasticity  independence  generalized-least-squares  lme4-nlme  references  mcmc  metropolis-hastings  optimization  r  logistic  feature-selection  separation  clustering  k-means  normal-distribution  gaussian-mixture  kullback-leibler  java  spark-mllib  data-visualization  categorical-data  barplot  hypothesis-testing  statistical-significance  chi-squared  type-i-and-ii-errors  pca  scikit-learn  conditional-expectation  statistical-significance  meta-analysis  intuition  r  time-series  multivariate-analysis  garch  machine-learning  classification  data-mining  missing-data  cart  regression  cross-validation  matrix-decomposition  categorical-data  repeated-measures  chi-squared  assumptions  contingency-tables  prediction  binary-data  trend  test-for-trend  matrix-inverse  anova  categorical-data  regression-coefficients  standard-error  r  distributions  exponential  interarrival-time  copula  log-likelihood  time-series  forecasting  prediction-interval  mean  standard-error  meta-analysis  meta-regression  network-meta-analysis  systematic-review  normal-distribution  multiple-regression  generalized-linear-model  poisson-distribution  poisson-regression  r  sas  cohens-kappa 

Saya tertarik dalam memodelkan total tangkapan ikan menggunakan gam dalam mgcv untuk memodelkan efek acak sederhana untuk masing-masing kapal (yang melakukan perjalanan berulang kali dalam perikanan). Saya memiliki 98 subjek, jadi saya pikir saya akan menggunakan gam daripada gamm untuk memodelkan efek acak. Model saya adalah: modelGOM <- gam(TotalFish ~ …

10 prediction  random-effects-model  gam  mgcv 

Nama saya Hugh, dan saya seorang mahasiswa PhD yang menggunakan model aditif umum untuk melakukan beberapa analisis eksplorasi. Saya tidak yakin bagaimana menafsirkan nilai-p yang berasal dari paket MGCV dan ingin memeriksa pemahaman saya (saya menggunakan versi 1.7-29, dan telah berkonsultasi dengan beberapa dokumentasi Simon Wood). Saya pertama-tama mencari pertanyaan …

10 p-value  mgcv 

Pertanyaan saya berkaitan dengan GAM dalam paket mgcv R. Karena ukuran sampel yang kecil saya ingin menentukan kesalahan prediksi menggunakan validasi silang leave-one-out. Apakah ini masuk akal? Apakah ada paket atau kode bagaimana saya bisa melakukan ini? The errorest()fungsi dalam ipred paket tidak bekerja. Dataset tes sederhana adalah: library(mgcv) set.seed(0) …

10 r  cross-validation  gam  mgcv 

Saya ingin mengetahui nilai-nilai yang (x, y)digunakan dalam merencanakan plot(b, seWithMean=TRUE)di mgcv paket. Adakah yang tahu bagaimana saya bisa mengekstraksi atau menghitung nilai-nilai ini? Berikut ini sebuah contoh: library(mgcv) set.seed(0) dat <- gamSim(1, n=400, dist="normal", scale=2) b <- gam(y~s(x0), data=dat) plot(b, seWithMean=TRUE)

10 r  time-series  smoothing  mgcv 

Buku Simon Wood tentang GAM dan paket R terkait mgcv keduanya sangat terperinci dan informatif dalam hal teori GAM dan penyesuaian model dengan data nyata dan disimulasikan. Untuk smooths 1D, benar-benar tidak ada yang perlu dikhawatirkan, kecuali untuk memutuskan apakah akan mengimplementasikan fungsi basis siklik vs adaptif, yang dapat memberikan …

9 r  mgcv 

Pertanyaan berikut didasarkan pada diskusi yang ditemukan di halaman ini . Diberikan variabel respons y, variabel penjelas kontinu xdan faktor fac, dimungkinkan untuk mendefinisikan Model Aditif Umum (GAM) dengan interaksi antara xdan facmenggunakan argumen by=. Menurut file bantuan ?gam.models dalam paket R mgcv, ini dapat dilakukan sebagai berikut: gam1 <- …

8 r  interaction  gam  mgcv 

Saya sedang membangun model di mana beberapa kovariat saya hidup pada "lingkaran", dalam arti bahwa mereka mengambil nilai dalam interval [0,1), dan 0 = 1. Saya bertanya-tanya tentang teknik untuk menghadapi situasi ini. Satu ide adalah untuk mewakili theta variabel lingkaran sebagai pasangan variabel (sin (theta), cos (theta)). Adakah pemikiran …

8 data-transformation  seasonality  mgcv  circular-statistics