Pertanyaan yang diberi tag «mixed-model»

Saya mencoba untuk beralih dari menggunakan ezpaket ke lmeuntuk tindakan berulang ANOVA (karena saya berharap saya akan dapat menggunakan kontras kustom dengan lme). Mengikuti saran dari posting blog ini saya dapat mengatur model yang sama menggunakan keduanya aov(seperti halnya ez, ketika diminta) dan lme. Namun, sedangkan dalam contoh yang diberikan …

24 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Saya telah melihat ikhtisar rumus lm / lmer R oleh @conjugateprior dan bingung dengan entri berikut: Sekarang asumsikan A adalah acak, tetapi B adalah tetap dan B bersarang dalam A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Formula model campuran analog di bawah lmer(Y ~ B + (1 | A:B), data=d) …

23 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Saya bertanya-tanya apakah ada metode untuk menghitung ukuran sampel dalam model campuran? Saya menggunakan lmerdi R agar sesuai dengan model (saya punya lereng acak dan penyadapan).

23 r  mixed-model  lme4-nlme  power-analysis 

Bagaimana model efek campuran (linier) secara normal dibandingkan satu sama lain? Saya tahu tes rasio kemungkinan dapat digunakan, tetapi ini tidak berhasil jika satu model bukan 'bagian' dari yang lain yang benar? Apakah estimasi model selalu mudah? Jumlah efek tetap + jumlah komponen varian diperkirakan? Apakah kita mengabaikan perkiraan efek …

22 hypothesis-testing  mixed-model  cross-validation  aic  degrees-of-freedom 

Kami telah menjalankan regresi logistik efek campuran menggunakan sintaks berikut; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Subjek dan Barang adalah efek acak. Kami mendapatkan hasil yang aneh yaitu koefisien dan standar deviasi untuk istilah …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

Di sebuah konferensi saya mendengar pernyataan berikut: 100 pengukuran untuk 5 subjek memberikan informasi yang jauh lebih sedikit daripada 5 pengukuran untuk 100 subjek. Ini agak jelas bahwa ini benar, tetapi saya bertanya-tanya bagaimana orang dapat membuktikannya secara matematis ... Saya pikir model campuran linear dapat digunakan. Namun, saya tidak …

21 mixed-model  variance  repeated-measures  sample-size  intraclass-correlation 

Saya memiliki percobaan tindakan berulang di mana variabel dependen adalah persentase, dan saya memiliki beberapa faktor sebagai variabel independen. Saya ingin menggunakan glmerdari paket R lme4untuk memperlakukannya sebagai masalah regresi logistik (dengan menentukan family=binomial) karena tampaknya mengakomodasi pengaturan ini secara langsung. Data saya terlihat seperti ini: > head(data.xvsy) foldnum featureset …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

Saya baru-baru ini memulai model campuran regresi pas dalam kerangka Bayesian, menggunakan algoritma MCMC (fungsi MCMCglmm dalam R sebenarnya). Saya percaya saya telah mengerti bagaimana cara mendiagnosis konvergensi proses estimasi (jejak, alur geweke, autokorelasi, distribusi posterior ...). Salah satu hal yang mengejutkan saya dalam kerangka Bayesian adalah bahwa banyak upaya …

21 r  bayesian  mixed-model  mcmc  residuals 

Saya menjalankan Generalized Linear Mixed Model dalam R dan memasukkan efek interaksi antara dua prediktor. Interaksi itu tidak signifikan, tetapi efek utama (dua prediktor) keduanya. Sekarang banyak contoh buku teks memberi tahu saya bahwa jika ada efek interaksi yang signifikan, efek utama tidak dapat ditafsirkan. Tetapi bagaimana jika interaksi Anda …

21 logistic  mixed-model  interaction  interpretation  regression-coefficients 

Setelah melakukan analisis komponen utama (PCA), saya ingin memproyeksikan vektor baru ke ruang PCA (yaitu menemukan koordinatnya dalam sistem koordinat PCA). Saya telah menghitung PCA dalam bahasa R menggunakan prcomp. Sekarang saya harus bisa mengalikan vektor saya dengan matriks rotasi PCA. Haruskah komponen utama dalam matriks ini disusun dalam baris …

21 r  pca  r  variance  heteroscedasticity  misspecification  distributions  time-series  data-visualization  modeling  histogram  kolmogorov-smirnov  negative-binomial  likelihood-ratio  econometrics  panel-data  categorical-data  scales  survey  distributions  pdf  histogram  correlation  algorithms  r  gpu  parallel-computing  approximation  mean  median  references  sample-size  normality-assumption  central-limit-theorem  rule-of-thumb  confidence-interval  estimation  mixed-model  psychometrics  random-effects-model  hypothesis-testing  sample-size  dataset  large-data  regression  standard-deviation  variance  approximation  hypothesis-testing  variance  central-limit-theorem  kernel-trick  kernel-smoothing  error  sampling  hypothesis-testing  normality-assumption  philosophical  confidence-interval  modeling  model-selection  experiment-design  hypothesis-testing  statistical-significance  power  asymptotics  information-retrieval  anova  multiple-comparisons  ancova  classification  clustering  factor-analysis  psychometrics  r  sampling  expectation-maximization  markov-process  r  data-visualization  correlation  regression  statistical-significance  degrees-of-freedom  experiment-design  r  regression  curve-fitting  change-point  loess  machine-learning  classification  self-study  monte-carlo  markov-process  references  mathematical-statistics  data-visualization  python  cart  boosting  regression  classification  robust  cart  survey  binomial  psychometrics  likert  psychology  asymptotics  multinomial 

Dengan dataset berikut, saya ingin melihat apakah respons (efek) berubah sehubungan dengan situs, musim, durasi, dan interaksinya. Beberapa forum online tentang statistik menyarankan saya untuk melanjutkan dengan Linear Mixed-Effects Model, tetapi masalahnya adalah karena replikat diacak di setiap stasiun, saya memiliki sedikit kesempatan untuk mengumpulkan sampel dari tempat yang persis …

21 r  mixed-model  lme4-nlme 

Saya telah bekerja dengan beberapa data yang memiliki beberapa masalah dengan pengukuran berulang. Dengan melakukan itu saya memperhatikan perilaku yang sangat berbeda antara lme()dan lmer()menggunakan data pengujian saya dan ingin tahu mengapa. Kumpulan data palsu yang saya buat memiliki pengukuran tinggi dan berat badan untuk 10 subjek, masing-masing diambil dua …

20 r  mixed-model  lme4-nlme 

Saya mengerti bahwa perbedaan di antara mereka terkait dengan apakah variabel pengelompokan dalam model diperkirakan sebagai efek tetap atau acak, tetapi tidak jelas bagi saya mengapa mereka tidak sama (jika mereka tidak sama). Saya secara khusus tertarik pada bagaimana ini bekerja ketika menggunakan estimasi area kecil, jika itu relevan, tetapi …

20 mixed-model  blue  blup  small-area-estimation 

Seorang rekan kerja menganalisis beberapa data biologis untuk disertasinya dengan beberapa Heteroscedasticity jahat (gambar di bawah). Dia menganalisanya dengan model campuran tetapi masih mengalami masalah dengan residu. Mentransformasi variabel-variabel respons membersihkan semuanya dan berdasarkan umpan balik terhadap pertanyaan ini, ini tampaknya merupakan pendekatan yang tepat. Awalnya, bagaimanapun, kami berpikir ada …

20 mixed-model  poisson-distribution  biostatistics 

Saya telah menggunakan beberapa imputasi untuk mendapatkan sejumlah set data yang lengkap. Saya telah menggunakan metode Bayesian pada masing-masing set data yang lengkap untuk mendapatkan distribusi posterior untuk parameter (efek acak). Bagaimana saya bisa menggabungkan / menggabungkan hasil untuk parameter ini? Lebih banyak konteks: Model saya bersifat hierarkis dalam arti …

20 bayesian  mixed-model  missing-data