Pertanyaan yang diberi tag «lme4-nlme»

lme4 dan nlme adalah paket R yang digunakan untuk pemasangan model efek campuran linier, linier umum, dan nonlinier. Untuk pertanyaan umum tentang model campuran, gunakan tag [model campuran].

4
Akurasi mesin peningkat gradien menurun karena jumlah iterasi meningkat
Saya bereksperimen dengan algoritma mesin peningkat gradien melalui caretpaket di R. Menggunakan dataset penerimaan perguruan tinggi kecil, saya menjalankan kode berikut: library(caret) ### Load admissions dataset. ### mydata <- read.csv("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/binary.csv") ### Create yes/no levels for admission. ### mydata$admit_factor[mydata$admit==0] <- "no" mydata$admit_factor[mydata$admit==1] <- "yes" ### Gradient boosting machine algorithm. ### set.seed(123) …
15 machine-learning  caret  boosting  gbm  hypothesis-testing  t-test  panel-data  psychometrics  intraclass-correlation  generalized-linear-model  categorical-data  binomial  model  intercept  causality  cross-correlation  distributions  ranks  p-value  z-test  sign-test  time-series  references  terminology  cross-correlation  definition  probability  distributions  beta-distribution  inverse-gamma  missing-data  paired-comparisons  paired-data  clustered-standard-errors  cluster-sample  time-series  arima  logistic  binary-data  odds-ratio  medicine  hypothesis-testing  wilcoxon-mann-whitney  unsupervised-learning  hierarchical-clustering  neural-networks  train  clustering  k-means  regression  ordinal-data  change-scores  machine-learning  experiment-design  roc  precision-recall  auc  stata  multilevel-analysis  regression  fitting  nonlinear  jmp  r  data-visualization  gam  gamm4  r  lme4-nlme  many-categories  regression  causality  instrumental-variables  endogeneity  controlling-for-a-variable 
1
Apa intuisi di balik sampel yang dapat ditukar di bawah hipotesis nol?
Tes permutasi (juga disebut tes pengacakan, uji pengacakan ulang, atau tes yang tepat) sangat berguna dan berguna ketika asumsi distribusi normal yang diperlukan misalnya, t-testtidak terpenuhi dan ketika transformasi nilai dengan peringkat dari tes non-parametrik seperti Mann-Whitney-U-testakan menyebabkan lebih banyak informasi hilang. Namun, satu dan hanya satu asumsi yang tidak …
15 hypothesis-testing  permutation-test  exchangeability  r  statistical-significance  loess  data-visualization  normal-distribution  pdf  ggplot2  kernel-smoothing  probability  self-study  expected-value  normal-distribution  prior  correlation  time-series  regression  heteroscedasticity  estimation  estimators  fisher-information  data-visualization  repeated-measures  binary-data  panel-data  mathematical-statistics  coefficient-of-variation  normal-distribution  order-statistics  regression  machine-learning  one-class  probability  estimators  forecasting  prediction  validation  finance  measurement-error  variance  mean  spatial  monte-carlo  data-visualization  boxplot  sampling  uniform  chi-squared  goodness-of-fit  probability  mixture  theory  gaussian-mixture  regression  statistical-significance  p-value  bootstrap  regression  multicollinearity  correlation  r  poisson-distribution  survival  regression  categorical-data  ordinal-data  ordered-logit  regression  interaction  time-series  machine-learning  forecasting  cross-validation  binomial  multiple-comparisons  simulation  false-discovery-rate  r  clustering  frequency  wilcoxon-mann-whitney  wilcoxon-signed-rank  r  svm  t-test  missing-data  excel  r  numerical-integration  r  random-variable  lme4-nlme  mixed-model  weighted-regression  power-law  errors-in-variables  machine-learning  classification  entropy  information-theory  mutual-information 
1
Mengapa saya tidak dapat mencocokkan output glmer (keluarga = binomial) dengan penerapan algoritma Gauss-Newton secara manual?
Saya ingin mencocokkan output dari lmer (benar-benar glmer) dengan contoh binomial mainan. Saya sudah membaca sketsa dan yakin saya mengerti apa yang sedang terjadi. Tapi ternyata saya tidak. Setelah macet, saya memperbaiki "kebenaran" dalam hal efek acak dan pergi setelah memperkirakan efek tetap saja. Saya memasukkan kode ini di bawah. …
1
Bagaimana efek acak dengan hanya 1 pengamatan mempengaruhi model campuran linier umum?
Saya memiliki satu set data di mana variabel yang ingin saya gunakan sebagai efek acak hanya memiliki satu pengamatan untuk beberapa level. Berdasarkan jawaban atas pertanyaan sebelumnya, saya telah mengumpulkan bahwa, pada prinsipnya, ini baik-baik saja. Bisakah saya memasukkan model campuran dengan subjek yang hanya memiliki 1 observasi? Model penyadapan …
2
Kesalahan LME () - batas iterasi tercapai
Dalam menentukan model efek campuran silang, saya mencoba memasukkan interaksi. Namun, saya mendapatkan pesan kesalahan berikut: Error in lme.formula(rate ~ nozzle, random = ~nozzle | operator, data = Flow) : nlminb problem, convergence error code = 1 message = iteration limit reached without convergence (10) Model memiliki yang berikut: 1. …
1
Menafsirkan output regresi dari model campuran ketika interaksi antara variabel kategori dimasukkan
Saya punya pertanyaan tentang penggunaan model campuran / lmer. Model dasarnya adalah ini: lmer(DV ~ group * condition + (1|pptid), data= df) Kelompok dan kondisi adalah kedua faktor: kelompok memiliki dua tingkat (groupA, groupB) dan kondisi memiliki tiga tingkat (kondisi1, kondisi2, kondisi3). Ini data dari subyek manusia, jadi pptid adalah …
1
Cara memperkirakan komponen varians dengan lmer untuk model dengan efek acak dan membandingkannya dengan hasil lme
Saya melakukan percobaan di mana saya membesarkan keluarga yang berbeda yang berasal dari dua populasi sumber yang berbeda. Setiap keluarga diberi satu dari dua perawatan. Setelah percobaan saya mengukur beberapa sifat pada setiap individu. Untuk menguji efek dari salah satu perlakuan atau sumber serta interaksi mereka, saya menggunakan model efek …
14 r  anova  variance  lme4-nlme 
1
Pemodelan efek campuran linier dengan data studi kembar
Misalkan saya memiliki beberapa beberapa variabel respon yang diukur dari th saudara di keluarga th. Selain itu, beberapa data perilaku dikumpulkan secara bersamaan dari masing-masing subjek. Saya mencoba menganalisis situasi dengan model efek campuran linier berikut:yijyijy_{ij}jjjiiixijxijx_{ij} yij=α0+α1xij+δ1ixij+εijyij=α0+α1xij+δ1ixij+εijy_{ij} = \alpha_0 + \alpha_1 x_{ij} + \delta_{1i} x_{ij} + \varepsilon_{ij} di mana dan …
4
Memperkirakan titik istirahat dalam tongkat yang rusak / model linier piecewise dengan efek acak dalam R [kode dan output termasuk]
Dapatkah seseorang tolong beri tahu saya bagaimana membuat R memperkirakan break point dalam model linear piecewise (sebagai parameter tetap atau acak), ketika saya juga perlu memperkirakan efek acak lainnya? Saya telah memasukkan contoh mainan di bawah ini yang cocok dengan tongkat hoki / regresi tongkat patah dengan varians kemiringan acak …
1
Kesetaraan spesifikasi efek acak (0 + faktor | kelompok) dan (1 | kelompok) + (1 | kelompok: faktor) jika simetri senyawa
Douglas Bates menyatakan bahwa model-model berikut ini setara "jika matriks varians-kovarians untuk efek acak bernilai vektor memiliki bentuk khusus, yang disebut simetri gabungan" ( slide 91 dalam presentasi ini ): m1 <- lmer(y ~ factor + (0 + factor|group), data) m2 <- lmer(y ~ factor + (1|group) + (1|group:factor), data) …
1
Menghitung ICC untuk regresi logistik efek-acak
Saya menjalankan model regresi logistik dalam bentuk: lmer(response~1+(1|site), family=binomial, REML = FALSE) Biasanya saya akan menghitung ICC dari varian intersep dan residual, tetapi ringkasan model tidak termasuk varians residual. Bagaimana saya menghitung ini?
Dengan menggunakan situs kami, Anda mengakui telah membaca dan memahami Kebijakan Cookie dan Kebijakan Privasi kami.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.