Pertanyaan yang diberi tag «r»

Saya mencoba menggunakan lme4::glmer()agar sesuai dengan model campuran binomial umum (GLMM) dengan variabel dependen yang bukan biner, tetapi variabel kontinu antara nol dan satu. Orang dapat menganggap variabel ini sebagai probabilitas; sebenarnya itu adalah probabilitas sebagaimana dilaporkan oleh subyek manusia (dalam percobaan yang saya bantu analisis). Yaitu itu bukan fraksi …

15 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

Pertanyaan CV Saya mencoba memberikan (a) representasi matematis yang terperinci dan ringkas dari model efek campuran. Saya menggunakan lme4paket dalam R. Apa representasi matematika yang benar untuk model saya? Data, Pertanyaan Sains, dan Kode R Kumpulan data saya terdiri dari spesies di berbagai daerah. Saya sedang menguji apakah prevalensi suatu …

15 r  mixed-model  multilevel-analysis  lme4-nlme 

Saya bereksperimen dengan algoritma mesin peningkat gradien melalui caretpaket di R. Menggunakan dataset penerimaan perguruan tinggi kecil, saya menjalankan kode berikut: library(caret) ### Load admissions dataset. ### mydata <- read.csv("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/binary.csv") ### Create yes/no levels for admission. ### mydata$admit_factor[mydata$admit==0] <- "no" mydata$admit_factor[mydata$admit==1] <- "yes" ### Gradient boosting machine algorithm. ### set.seed(123) …

15 machine-learning  caret  boosting  gbm  hypothesis-testing  t-test  panel-data  psychometrics  intraclass-correlation  generalized-linear-model  categorical-data  binomial  model  intercept  causality  cross-correlation  distributions  ranks  p-value  z-test  sign-test  time-series  references  terminology  cross-correlation  definition  probability  distributions  beta-distribution  inverse-gamma  missing-data  paired-comparisons  paired-data  clustered-standard-errors  cluster-sample  time-series  arima  logistic  binary-data  odds-ratio  medicine  hypothesis-testing  wilcoxon-mann-whitney  unsupervised-learning  hierarchical-clustering  neural-networks  train  clustering  k-means  regression  ordinal-data  change-scores  machine-learning  experiment-design  roc  precision-recall  auc  stata  multilevel-analysis  regression  fitting  nonlinear  jmp  r  data-visualization  gam  gamm4  r  lme4-nlme  many-categories  regression  causality  instrumental-variables  endogeneity  controlling-for-a-variable 

Setelah membaca posting blog ini tentang model deret waktu struktural Bayesian, saya ingin melihat penerapan ini dalam konteks masalah yang sebelumnya saya gunakan untuk ARIMA. Saya memiliki beberapa data dengan beberapa komponen musiman yang diketahui (tetapi berisik) - pasti ada komponen tahunan, bulanan dan mingguan untuk ini, dan juga beberapa …

15 r  time-series  bayesian  mcmc  bsts 

Saya punya contoh yang berhasil (dalam R), yang saya coba mengerti lebih lanjut. Saya menggunakan Limma untuk membuat model linier dan saya mencoba memahami apa yang terjadi langkah demi langkah dalam perhitungan perubahan lipat. Saya kebanyakan berusaha mencari tahu apa yang terjadi untuk menghitung koefisien. Dari apa yang saya tahu, …

15 r  regression  linear-model 

Saya ingin tahu apakah hutan acak Breiman (hutan acak dalam paket R randomForest) digunakan sebagai kriteria pemisahan (kriteria untuk pemilihan atribut) informasi atau indeks Gini? Saya mencoba untuk mengetahuinya di http://www.stat.berkeley.edu/~breiman/RandomForests/cc_home.htm dan dalam dokumentasi untuk paket randomForest di R. Tetapi satu-satunya hal yang saya temukan adalah bahwa indeks Gini dapat …

15 r  random-forest  entropy  gini 

Saya memiliki dua variabel - X dan Y dan saya perlu membuat kluster maksimum (dan optimal) = 5. Mari plot variabel yang ideal adalah seperti berikut: Saya ingin membuat 5 kelompok ini. Sesuatu seperti ini: Jadi saya pikir ini adalah model campuran dengan 5 kluster. Setiap kelompok memiliki titik pusat …

15 r  clustering  gaussian-mixture 

Saya telah mencoba menghitung AIC dari regresi linier dalam R tetapi tanpa menggunakan AICfungsi, seperti ini: lm_mtcars <- lm(mpg ~ drat, mtcars) nrow(mtcars)*(log((sum(lm_mtcars$residuals^2)/nrow(mtcars))))+(length(lm_mtcars$coefficients)*2) [1] 97.98786 Namun, AICmemberikan nilai berbeda: AIC(lm_mtcars) [1] 190.7999 Bisakah seseorang memberi tahu saya apa yang saya lakukan salah?

15 r  aic  information-theory 

Tes permutasi (juga disebut tes pengacakan, uji pengacakan ulang, atau tes yang tepat) sangat berguna dan berguna ketika asumsi distribusi normal yang diperlukan misalnya, t-testtidak terpenuhi dan ketika transformasi nilai dengan peringkat dari tes non-parametrik seperti Mann-Whitney-U-testakan menyebabkan lebih banyak informasi hilang. Namun, satu dan hanya satu asumsi yang tidak …

15 hypothesis-testing  permutation-test  exchangeability  r  statistical-significance  loess  data-visualization  normal-distribution  pdf  ggplot2  kernel-smoothing  probability  self-study  expected-value  normal-distribution  prior  correlation  time-series  regression  heteroscedasticity  estimation  estimators  fisher-information  data-visualization  repeated-measures  binary-data  panel-data  mathematical-statistics  coefficient-of-variation  normal-distribution  order-statistics  regression  machine-learning  one-class  probability  estimators  forecasting  prediction  validation  finance  measurement-error  variance  mean  spatial  monte-carlo  data-visualization  boxplot  sampling  uniform  chi-squared  goodness-of-fit  probability  mixture  theory  gaussian-mixture  regression  statistical-significance  p-value  bootstrap  regression  multicollinearity  correlation  r  poisson-distribution  survival  regression  categorical-data  ordinal-data  ordered-logit  regression  interaction  time-series  machine-learning  forecasting  cross-validation  binomial  multiple-comparisons  simulation  false-discovery-rate  r  clustering  frequency  wilcoxon-mann-whitney  wilcoxon-signed-rank  r  svm  t-test  missing-data  excel  r  numerical-integration  r  random-variable  lme4-nlme  mixed-model  weighted-regression  power-law  errors-in-variables  machine-learning  classification  entropy  information-theory  mutual-information 

Saya masih baru dalam glmnetpaket ini, dan saya masih tidak yakin bagaimana menafsirkan hasilnya. Adakah yang bisa membantu saya membaca plot jejak berikut? Grafik diperoleh dengan menjalankan yang berikut: library(glmnet) return <- matrix(ret.ff.zoo[which(index(ret.ff.zoo)==beta.df$date[2]), ]) data <- matrix(unlist(beta.df[which(beta.df$date==beta.df$date[2]), ][ ,-1]), ncol=num.factors) model <- cv.glmnet(data, return, standardize=TRUE) op <- par(mfrow=c(1, 2)) plot(model$glmnet.fit, …

15 r  data-visualization  interpretation  lasso  glmnet 

Saya memiliki beberapa data yang dibatasi antara 0 dan 1. Saya telah menggunakan betaregpaket dalam R agar sesuai dengan model regresi dengan data terikat sebagai variabel dependen. Pertanyaan saya adalah: bagaimana cara menafsirkan koefisien dari regresi?

15 r  regression  interpretation  beta-distribution  regression-coefficients 

Saya memperkirakan sampel matriks kovarian CCC sampel dan mendapatkan matriks simetris. Dengan CCC , saya ingin membuat nnn -variate rn didistribusikan normal, tetapi karena itu saya membutuhkan Cholesky dekomposisi . Apa yang harus saya lakukan jika tidak pasti positif?CCCCCC

15 r  random-generation  covariance-matrix  multivariate-normal  cholesky 

Saya menggunakan serangkaian data penjualan harian yang berisi sekitar 2 tahun titik data harian. Berdasarkan beberapa tutorial / contoh online, saya mencoba mengidentifikasi musiman dalam data. Tampaknya ada periodisitas / musiman musiman, bulanan, dan mungkin tahunan. Misalnya, ada hari gajian, khususnya pada hari gajian pertama efek bulan yang berlangsung selama …

15 r  time-series  forecasting  arima  multiple-seasonalities 

Paket R plotting ggplot2 memiliki fungsi luar biasa yang disebut stat_smooth untuk memplot garis regresi (atau kurva) dengan pita kepercayaan terkait. Namun saya mengalami kesulitan mencari tahu persis bagaimana pita kepercayaan ini dihasilkan, untuk setiap kali garis regresi (atau "metode"). Bagaimana saya dapat menemukan informasi ini?

15 r  regression  confidence-interval  ggplot2 

Saya memiliki database peristiwa (yaitu variabel tanggal) dan kovariat terkait. Peristiwa ini dihasilkan oleh proses Poisson non-stasioner dengan parameter menjadi fungsi yang tidak diketahui (tetapi mungkin linier) dari beberapa kovariat. Saya pikir paket NHPoisson ada hanya untuk tujuan ini; tetapi setelah 15 jam penelitian yang gagal, saya masih belum tahu …

15 r  poisson-distribution  poisson-process