Pertanyaan yang diberi tag «r»

Gunakan tag ini untuk setiap * pada topik * pertanyaan yang (a) melibatkan `R` baik sebagai bagian penting dari pertanyaan atau jawaban yang diharapkan, & (b) bukan * hanya * tentang cara menggunakan` R`.

1
Menghitung pengulangan efek dari model lmer
Saya baru saja menemukan makalah ini , yang menjelaskan bagaimana menghitung pengulangan (alias reliabilitas, alias korelasi intraclass) dari pengukuran melalui pemodelan efek campuran. Kode R adalah: #fit the model fit = lmer(dv~(1|unit),data=my_data) #obtain the variance estimates vc = VarCorr(fit) residual_var = attr(vc,'sc')^2 intercept_var = attr(vc$id,'stddev')[1]^2 #compute the unadjusted repeatability R …
28 mixed-model  reliability  intraclass-correlation  repeatability  spss  factor-analysis  survey  modeling  cross-validation  error  curve-fitting  mediation  correlation  clustering  sampling  machine-learning  probability  classification  metric  r  project-management  optimization  svm  python  dataset  quality-control  checking  clustering  distributions  anova  factor-analysis  exponential  poisson-distribution  generalized-linear-model  deviance  machine-learning  k-nearest-neighbour  r  hypothesis-testing  t-test  r  variance  levenes-test  bayesian  software  bayesian-network  regression  repeated-measures  least-squares  change-scores  variance  chi-squared  variance  nonlinear-regression  regression-coefficients  multiple-comparisons  p-value  r  statistical-significance  excel  sampling  sample  r  distributions  interpretation  goodness-of-fit  normality-assumption  probability  self-study  distributions  references  theory  time-series  clustering  econometrics  binomial  hypothesis-testing  variance  t-test  paired-comparisons  statistical-significance  ab-test  r  references  hypothesis-testing  t-test  normality-assumption  wilcoxon-mann-whitney  central-limit-theorem  t-test  data-visualization  interactive-visualization  goodness-of-fit 
3
Mulai seRious tentang deret waktu dengan R
Jika Anda berpikir kembali, ke saat Anda pertama kali memulai dengan analisis deret waktu. Alat apa, paket R, dan sumber daya internet yang Anda ingin ketahui? Yang ingin saya tanyakan adalah, di mana kita harus mulai? Secara khusus, apakah ada sumber daya untuk R yang benar-benar mendidih untuk orang yang …
28 r  time-series 
4
Formula kuadrat Pseudo R untuk GLM
Saya menemukan formula untuk pseudo R2R2R^2 dalam buku Extending the Linear Model with R, Julian J. Faraway (hlm. 59). 1−ResidualDevianceNullDeviance1−ResidualDevianceNullDeviance1-\frac{\text{ResidualDeviance}}{\text{NullDeviance}} . Apakah ini formula umum untuk pseudo untuk GLM?R2R2R^2
3
Apakah ada fungsi default untuk distribusi seragam diskrit di R?
Sebagian besar distribusi standar dalam R memiliki keluarga perintah - pdf / pmf, cdf / cmf, quantile, penyimpangan acak (misalnya - dnorm, pnorm, qnorm, rnorm). Saya tahu itu cukup mudah untuk menggunakan beberapa perintah standar untuk mereproduksi fungsi-fungsi ini untuk distribusi seragam diskrit, tetapi apakah sudah ada keluarga fungsi bawaan …
26
Paket R apa yang menurut Anda paling berguna dalam pekerjaan sehari-hari Anda?
Duplikat utas: Saya baru saja menginstal versi terbaru R. Paket apa yang harus saya peroleh? Apa paket R yang tidak bisa Anda bayangkan pekerjaan harian Anda dengan data? Harap sebutkan alat umum dan khusus. UPDATE: Adapun 24.10.10 ggplot2tampaknya menjadi pemenang dengan 7 suara. Paket lain yang disebutkan lebih dari satu …
28 r 
3
Bagaimana cara menangani multikolinieritas saat melakukan pemilihan variabel?
Saya memiliki dataset dengan 9 variabel independen kontinu. Saya mencoba untuk memilih antara variabel-variabel ini sesuai model untuk persentase tunggal (tergantung) variabel, Score. Sayangnya, saya tahu akan ada kolinearitas yang serius antara beberapa variabel. Saya sudah mencoba menggunakan stepAIC()fungsi dalam R untuk pemilihan variabel, tetapi metode itu, anehnya, tampaknya sensitif …
4
Bagaimana cara mengurangi dimensi dalam R
Saya memiliki matriks di mana a (i, j) memberi tahu saya berapa kali individu yang saya lihat halaman j. Ada 27K individu dan 95K halaman. Saya ingin memiliki beberapa "dimensi" atau "aspek" dalam ruang halaman yang sesuai dengan set halaman yang sering dilihat bersama. Tujuan utama saya adalah untuk kemudian …
1
Bisakah derajat kebebasan menjadi angka non-integer?
Ketika saya menggunakan GAM, itu memberi saya sisa DF adalah (baris terakhir dalam kode). Apa artinya? Melampaui contoh GAM, Secara umum, bisakah jumlah derajat kebebasan menjadi angka yang bukan bilangan bulat?26.626.626.6 > library(gam) > summary(gam(mpg~lo(wt),data=mtcars)) Call: gam(formula = mpg ~ lo(wt), data = mtcars) Deviance Residuals: Min 1Q Median 3Q …
27 r  degrees-of-freedom  gam  machine-learning  pca  lasso  probability  self-study  bootstrap  expected-value  regression  machine-learning  linear-model  probability  simulation  random-generation  machine-learning  distributions  svm  libsvm  classification  pca  multivariate-analysis  feature-selection  archaeology  r  regression  dataset  simulation  r  regression  time-series  forecasting  predictive-models  r  mean  sem  lavaan  machine-learning  regularization  regression  conv-neural-network  convolution  classification  deep-learning  conv-neural-network  regression  categorical-data  econometrics  r  confirmatory-factor  scale-invariance  self-study  unbiased-estimator  mse  regression  residuals  sampling  random-variable  sample  probability  random-variable  convergence  r  survival  weibull  references  autocorrelation  hypothesis-testing  distributions  correlation  regression  statistical-significance  regression-coefficients  univariate  categorical-data  chi-squared  regression  machine-learning  multiple-regression  categorical-data  linear-model  pca  factor-analysis  factor-rotation  classification  scikit-learn  logistic  p-value  regression  panel-data  multilevel-analysis  variance  bootstrap  bias  probability  r  distributions  interquartile  time-series  hypothesis-testing  normal-distribution  normality-assumption  kurtosis  arima  panel-data  stata  clustered-standard-errors  machine-learning  optimization  lasso  multivariate-analysis  ancova  machine-learning  cross-validation 
4
Apa yang salah dengan t-SNE vs PCA untuk pengurangan dimensi menggunakan R?
Saya memiliki matriks 336x256 angka titik apung (336 genom bakteri (kolom) x 256 frekuensi tetranukleotida yang dinormalisasi (baris), misalnya setiap kolom menambahkan hingga 1). Saya mendapatkan hasil yang bagus ketika saya menjalankan analisis saya menggunakan analisis komponen utama. Pertama-tama saya menghitung kluster kmeans pada data, kemudian menjalankan PCA dan mewarnai …
27 r  pca  tsne 
2
Dalam model multi-level, apa implikasi praktis dari memperkirakan dan tidak mengestimasi parameter korelasi efek acak?
Dalam model multi-level, apa implikasi praktis dan terkait interpretasi parameter estimasi efek korelasi acak dan tidak diperkirakan? Alasan praktis untuk menanyakan hal ini adalah bahwa dalam kerangka lmer dalam R, tidak ada metode yang diimplementasikan untuk memperkirakan nilai-p melalui teknik MCMC ketika estimasi dibuat dalam model korelasi antara parameter. Misalnya, …
1
Derajat kebebasan residual yang sesuai setelah menjatuhkan persyaratan dari suatu model
Saya merenungkan diskusi seputar pertanyaan ini dan khususnya komentar Frank Harrell bahwa estimasi untuk varians dalam model yang dikurangi (yaitu satu dari mana sejumlah variabel penjelas telah diuji dan ditolak) harus menggunakan Tingkat Kemerdekaan Umum Ye . Profesor Harrell menunjukkan ini akan jauh lebih dekat dengan derajat sisa kebebasan dari …
Dengan menggunakan situs kami, Anda mengakui telah membaca dan memahami Kebijakan Cookie dan Kebijakan Privasi kami.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.