Pertanyaan yang diberi tag «cox-model»

Pemahaman saya adalah bahwa rasio bahaya dari model bahaya proporsional Cox membandingkan efek pada tingkat bahaya faktor tertentu dengan kelompok referensi. Bagaimana Anda melaporkan hal itu kepada audiens yang tidak tahu statistik? Mari kita coba untuk memberikan contoh. Katakanlah kita mendaftarkan orang dalam sebuah penelitian tentang berapa lama sebelum mereka …

13 survival  cox-model 

Saya telah menggunakan model tuning caret, tetapi kemudian menjalankan kembali model menggunakan gbmpaket. Ini adalah pemahaman saya bahwa caretpaket menggunakan gbmdan hasilnya harus sama. Namun, hanya menjalankan tes cepat menggunakan data(iris)menunjukkan perbedaan dalam model sekitar 5% menggunakan RMSE dan R ^ 2 sebagai metrik evaluasi. Saya ingin menemukan kinerja model …

13 r  caret  gbm  matrix  linear-algebra  logistic  modeling  logit  ordered-logit  r  confidence-interval  survival  population  weibull  classification  separation  hypothesis-testing  correlation  statistical-significance  p-value  python  r  data-visualization  r  regression  multiple-regression  chi-squared  multivariate-analysis  distributions  random-variable  experiment-design  distributions  poisson-regression  residuals  excel  time-series  garch  var  survival  modeling  cox-model  interaction  r  pca  normality-assumption 

Saya ingin menghitung fungsi survivor yang diprediksi untuk model bahaya proporsional Cox dengan persyaratan yang rapuh [menggunakan paket survival]. Tampaknya ketika istilah kelemahan ada dalam model, fungsi survivor yang diprediksi tidak dapat dihitung. ## Example require(survival) data(rats) ## Create fake weight set.seed(90989) rats$weight<-runif(nrow(rats),0.2,0.9) ## Cox model with gamma frailty on …

13 r  survival  cox-model  frailty 

Saya perlu memperkirakan fungsi dasar bahaya dalam model Cox tergantung waktuλ0( t )λ0(t)\lambda_0(t) λ ( t ) = λ0( t ) exp( Z( t )′β)λ(t)=λ0(t)exp⁡(Z(t)′β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Ketika saya mengikuti kursus Survival, saya ingat bahwa turunan langsung dari fungsi bahaya kumulatif ( ) tidak akan menjadi penaksir yang baik …

13 r  survival  cox-model 

Saya ingin membuat data survival mainan (waktu untuk acara) yang disensor dengan benar dan mengikuti distribusi dengan bahaya proporsional dan bahaya baseline konstan. Saya membuat data sebagai berikut, tetapi saya tidak dapat memperoleh estimasi rasio bahaya yang mendekati nilai sebenarnya setelah menyesuaikan model bahaya proporsional Cox dengan data yang disimulasikan. …

12 survival  cox-model  monte-carlo 

Saya ingin memahami uji pasti fisher dengan lebih baik, jadi saya menyusun contoh mainan berikut ini, di mana f dan m berhubungan dengan pria dan wanita, dan n dan y berhubungan dengan "konsumsi soda" seperti ini: > soda_gender f m n 0 5 y 5 0 Jelas, ini adalah penyederhanaan …

12 fishers-exact  hypergeometric  clustering  supervised-learning  modeling  econometrics  r  regression  residuals  heteroscedasticity  independence  distributions  self-study  matlab  libsvm  self-study  conditional-probability  conditional-expectation  hypothesis-testing  self-study  multiple-comparisons  mode  statistical-significance  chi-squared  multiple-comparisons  maximum-likelihood  poisson-process  optimization  uncertainty  genetic-algorithms  bayesian  model-selection  overfitting  maximum-likelihood  optimization  approximation  r  prediction  model-evaluation  r  machine-learning  survival  neural-networks  cox-model  machine-learning  bayesian  bayesian-network  hierarchical-bayesian  pooling 

Dalam model bahaya proporsional Cox dengan banyak variabel, jika residu Schoenfeld tidak rata untuk salah satu variabel, apakah ini membatalkan seluruh model atau dapatkah hanya variabel yang berkinerja buruk diabaikan? Artinya, tafsirkan koefisien untuk variabel lain, tetapi jangan menafsirkan koefisien yang dihasilkan untuk variabel berkinerja buruk. Ada beberapa cara standar …

11 residuals  cox-model  schoenfeld-residuals 

Saya memiliki model Cox PH berikut: (Waktu, Acara) ~ X + Y + Z Saya ingin mendapatkan bahaya diprediksi tingkat (saya berbicara tentang tingkat bahaya TIDAK rasio hazard) diberikan nilai-nilai tertentu dari X, Y, Z. Saya tahu paket muhaz R dapat menghitung tingkat bahaya yang diamati, tetapi saya tertarik dengan …

11 r  survival  hazard  cox-model 

Saya tertarik mengetahui apakah ada konsensus tentang cara optimal untuk menganalisis data lama tinggal di rumah sakit dari RCT. Ini biasanya distribusi yang sangat condong ke kanan, di mana sebagian besar pasien dipulangkan dalam beberapa hari hingga satu minggu, tetapi pasien lainnya memiliki masa inap yang tidak dapat diprediksi (dan …

11 t-test  power  skewness  cox-model  logrank 

Mengenai pembobotan skor kecenderungan (IPTW) saat melakukan pemodelan bahaya proporsional Cox dari data survival waktu-ke-peristiwa: Saya memiliki data registri prospektif di mana kami tertarik untuk melihat efek pengobatan dari obat yang dalam kebanyakan kasus pasien sudah memakai pada awal. Karena itu saya tidak yakin bagaimana cara terbaik menganalisis data. Secara …

11 r  survival  cox-model  propensity-scores 

Saya baru dalam analisis bertahan hidup dan saya baru-baru ini belajar bahwa ada berbagai cara untuk melakukannya dengan tujuan tertentu. Saya tertarik pada implementasi aktual dan kesesuaian metode ini. Saya diberi Cox Proportional-Hazards tradisional , model waktu kegagalan yang dipercepat dan jaringan saraf (multilayer perceptron) sebagai metode untuk mendapatkan kelangsungan …

10 r  machine-learning  survival  neural-networks  cox-model 

Konteks Saya mencoba memahami bagaimana R's coxph () menerima dan menangani entri berulang untuk subjek (atau pasien / pelanggan jika Anda suka). Beberapa menyebutnya format Panjang ini, yang lain menyebutnya 'tindakan berulang'. Lihat misalnya kumpulan data yang menyertakan kolom ID di bagian Jawaban di: Paket terbaik untuk model Cox dengan …

10 r  repeated-measures  survival  cox-model  frailty 

Dalam regresi logistik, rasio odds 2 berarti bahwa kejadian tersebut 2 kali lebih mungkin diberikan peningkatan satu unit dalam prediktor. Dalam regresi Cox, rasio bahaya 2 berarti peristiwa tersebut akan terjadi dua kali lebih sering pada setiap titik waktu mengingat peningkatan satu unit dalam prediktor. Apakah ini secara praktis tidak …

10 logistic  cox-model  odds-ratio  hazard 

Ini hanya contoh yang saya temui beberapa kali, jadi saya tidak punya data sampel. Menjalankan model regresi linier di R: a.lm = lm(Y ~ x1 + x2) x1adalah variabel kontinu. x2bersifat kategorikal dan memiliki tiga nilai, mis. "Rendah", "Sedang" dan "Tinggi". Namun output yang diberikan oleh R akan menjadi seperti: …

10 r  regression  categorical-data  regression-coefficients  categorical-encoding  machine-learning  random-forest  anova  spss  r  self-study  bootstrap  monte-carlo  r  multiple-regression  partitioning  neural-networks  normalization  machine-learning  svm  kernel-trick  self-study  survival  cox-model  repeated-measures  survey  likert  correlation  variance  sampling  meta-analysis  anova  independence  sample  assumptions  bayesian  covariance  r  regression  time-series  mathematical-statistics  graphical-model  machine-learning  linear-model  kernel-trick  linear-algebra  self-study  moments  function  correlation  spss  probability  confidence-interval  sampling  mean  population  r  generalized-linear-model  prediction  offset  data-visualization  clustering  sas  cart  binning  sas  logistic  causality  regression  self-study  standard-error  r  distributions  r  regression  time-series  multiple-regression  python  chi-squared  independence  sample  clustering  data-mining  rapidminer  probability  stochastic-processes  clustering  binary-data  dimensionality-reduction  svd  correspondence-analysis  data-visualization  excel  c#  hypothesis-testing  econometrics  survey  rating  composite  regression  least-squares  mcmc  markov-process  kullback-leibler  convergence  predictive-models  r  regression  anova  confidence-interval  survival  cox-model  hazard  normal-distribution  autoregressive  mixed-model  r  mixed-model  sas  hypothesis-testing  mediation  interaction 

Di R, saya melakukan analisis data kelangsungan hidup pasien kanker. Saya telah membaca hal-hal yang sangat membantu tentang analisis survival di CrossValidated dan tempat-tempat lain dan berpikir saya mengerti bagaimana menafsirkan hasil regresi Cox. Namun, satu hasil masih mengganggu saya ... Saya membandingkan kelangsungan hidup dengan jenis kelamin. Kurva Kaplan-Meier …

9 r  survival  cox-model  kaplan-meier