Pertanyaan yang diberi tag «negative-binomial»

Setelah melakukan analisis komponen utama (PCA), saya ingin memproyeksikan vektor baru ke ruang PCA (yaitu menemukan koordinatnya dalam sistem koordinat PCA). Saya telah menghitung PCA dalam bahasa R menggunakan prcomp. Sekarang saya harus bisa mengalikan vektor saya dengan matriks rotasi PCA. Haruskah komponen utama dalam matriks ini disusun dalam baris …

21 r  pca  r  variance  heteroscedasticity  misspecification  distributions  time-series  data-visualization  modeling  histogram  kolmogorov-smirnov  negative-binomial  likelihood-ratio  econometrics  panel-data  categorical-data  scales  survey  distributions  pdf  histogram  correlation  algorithms  r  gpu  parallel-computing  approximation  mean  median  references  sample-size  normality-assumption  central-limit-theorem  rule-of-thumb  confidence-interval  estimation  mixed-model  psychometrics  random-effects-model  hypothesis-testing  sample-size  dataset  large-data  regression  standard-deviation  variance  approximation  hypothesis-testing  variance  central-limit-theorem  kernel-trick  kernel-smoothing  error  sampling  hypothesis-testing  normality-assumption  philosophical  confidence-interval  modeling  model-selection  experiment-design  hypothesis-testing  statistical-significance  power  asymptotics  information-retrieval  anova  multiple-comparisons  ancova  classification  clustering  factor-analysis  psychometrics  r  sampling  expectation-maximization  markov-process  r  data-visualization  correlation  regression  statistical-significance  degrees-of-freedom  experiment-design  r  regression  curve-fitting  change-point  loess  machine-learning  classification  self-study  monte-carlo  markov-process  references  mathematical-statistics  data-visualization  python  cart  boosting  regression  classification  robust  cart  survey  binomial  psychometrics  likert  psychology  asymptotics  multinomial 

Presisi didefinisikan sebagai: p = true positives / (true positives + false positives) Apakah benar bahwa, sebagai true positivesdan false positivespendekatan 0, presisi mendekati 1? Pertanyaan yang sama untuk diingat: r = true positives / (true positives + false negatives) Saat ini saya sedang menerapkan tes statistik di mana saya …

20 precision-recall  data-visualization  logarithm  references  r  networks  data-visualization  standard-deviation  probability  binomial  negative-binomial  r  categorical-data  aggregation  plyr  survival  python  regression  r  t-test  bayesian  logistic  data-transformation  confidence-interval  t-test  interpretation  distributions  data-visualization  pca  genetics  r  finance  maximum  probability  standard-deviation  probability  r  information-theory  references  computational-statistics  computing  references  engineering-statistics  t-test  hypothesis-testing  independence  definition  r  censoring  negative-binomial  poisson-distribution  variance  mixed-model  correlation  intraclass-correlation  aggregation  interpretation  effect-size  hypothesis-testing  goodness-of-fit  normality-assumption  small-sample  distributions  regression  normality-assumption  t-test  anova  confidence-interval  z-statistic  finance  hypothesis-testing  mean  model-selection  information-geometry  bayesian  frequentist  terminology  type-i-and-ii-errors  cross-validation  smoothing  splines  data-transformation  normality-assumption  variance-stabilizing  r  spss  stata  python  correlation  logistic  logit  link-function  regression  predictor  pca  factor-analysis  r  bayesian  maximum-likelihood  mcmc  conditional-probability  statistical-significance  chi-squared  proportion  estimation  error  shrinkage  application  steins-phenomenon 

Beberapa dari Anda mungkin telah membaca makalah yang bagus ini: O'Hara RB, Kotze DJ (2010) Jangan log-transform data hitungan. Metode dalam Ekologi dan Evolusi 1: 118-122. klick . Dalam bidang penelitian saya (ekotoksikologi), kita sedang berhadapan dengan eksperimen yang direplikasi dengan buruk dan GLM tidak banyak digunakan. Jadi saya melakukan …

18 r  generalized-linear-model  simulation  negative-binomial  type-i-and-ii-errors 

Sebuah Skellam Distribusi menjelaskan perbedaan antara dua variabel yang memiliki distribusi Poisson. Apakah ada distribusi serupa yang menggambarkan perbedaan antara variabel yang mengikuti distribusi binomial negatif? Data saya dihasilkan oleh proses Poisson, tetapi mencakup cukup banyak noise, yang menyebabkan penyebaran berlebihan dalam distribusi. Dengan demikian, pemodelan data dengan distribusi binomial …

18 distributions  modeling  poisson-distribution  negative-binomial  skellam 

Anda dan saya memutuskan untuk memainkan permainan di mana kami bergiliran membalik koin. Pemain pertama yang membalikkan 10 kepala total memenangkan permainan. Tentu saja, ada argumen tentang siapa yang harus pergi dulu. Simulasi permainan ini menunjukkan bahwa pemain yang membalik pertama menang 6% lebih banyak daripada pemain yang membalik kedua …

17 probability  python  binomial  negative-binomial 

Pertanyaan Varian dari distribusi binomial negatif (NB) selalu lebih besar dari rata-rata. Ketika rata-rata sampel lebih besar dari variansnya, mencoba menyesuaikan parameter NB dengan kemungkinan maksimum atau dengan estimasi momen akan gagal (tidak ada solusi dengan parameter hingga). Namun, ada kemungkinan bahwa sampel yang diambil dari distribusi NB memiliki rata-rata …

17 estimation  maximum-likelihood  negative-binomial 

Saya memiliki histogram data jumlah berikut. Dan saya ingin mencocokkan distribusi diskrit dengannya. Saya tidak yakin bagaimana saya harus melakukan ini. Haruskah saya pertama menempatkan superimpose distribusi diskrit, katakanlah distribusi Binomial Negatif, pada histogram sehingga saya akan mendapatkan parameter distribusi diskrit dan kemudian menjalankan tes Kolmogorov-Smirnov untuk memeriksa nilai-p? Saya …

17 r  poisson-distribution  discrete-data  computational-statistics  negative-binomial 

Apakah ada paket yang menyediakan estimasi model efek-campuran binomial negatif yang meningkat nol dalam R? Maksud saya: Nol-inflasi tempat Anda dapat menentukan model binomial untuk inflasi nol, seperti pada fungsi zeroinfl dalam paket pscl: zeroinfl (y ~ X | Z, dist = "negbin") di mana Z adalah formula untuk model …

17 r  mixed-model  count-data  negative-binomial  zero-inflation 

Distribusi binomial negatif telah menjadi model yang populer untuk menghitung data (khususnya jumlah sekuens yang diharapkan dibaca dalam wilayah genom tertentu dari percobaan yang diberikan) dalam bioinformatika. Penjelasannya bervariasi: Beberapa menjelaskannya sebagai sesuatu yang bekerja seperti distribusi Poisson tetapi memiliki parameter tambahan, memungkinkan lebih banyak kebebasan untuk memodelkan distribusi yang …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

Distribusi Poisson dapat mengukur peristiwa per satuan waktu, dan parameternya adalah λλ\lambda . Distribusi eksponensial mengukur waktu hingga peristiwa berikutnya, dengan parameter . Satu dapat mengkonversi satu distribusi ke yang lain, tergantung pada apakah lebih mudah untuk memodelkan peristiwa atau waktu.1λ1λ\frac{1}{\lambda} Sekarang, gamma-poisson adalah poisson "stretched" dengan varian yang lebih …

16 poisson-distribution  negative-binomial  gamma-distribution  exponential-family 

Apa strategi yang tepat untuk memutuskan model mana yang akan digunakan dengan data jumlah? Saya telah menghitung data yang saya perlu model sebagai model bertingkat dan direkomendasikan kepada saya (di situs ini) bahwa cara terbaik untuk melakukannya adalah melalui bug atau MCMCglmm. Namun saya masih mencoba untuk belajar tentang statistik …

16 poisson-distribution  generalized-linear-model  negative-binomial  overdispersion 

Saya sering melihat saran untuk memeriksa apakah model Poisson cocok atau tidak tersebar melibatkan pembagian penyimpangan residual dengan derajat kebebasan. Rasio yang dihasilkan harus "sekitar 1". Pertanyaannya adalah kisaran apa yang kita bicarakan untuk "perkiraan" - berapa rasio yang harus menyalakan alarm untuk mempertimbangkan bentuk model alternatif?

16 poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion 

Berapa yang diharapkan berapa kali Anda harus melempar dadu sampai masing-masing sisi muncul 3 kali? Pertanyaan ini ditanyakan di sekolah dasar di Selandia Baru dan diselesaikan dengan simulasi. Apa solusi analitis untuk masalah ini?

15 probability  multinomial  negative-binomial  coupon-collector-problem 

Saya baru saja menjalankan GLM binomial negatif dan ini adalah output: Call: glm.nb(formula = small ~ method + site + depth, data = size.dat, init.theta = 1.080668549, link = log) Deviance Residuals: Min 1Q Median 3Q Max -2.2452 -0.9973 -0.3028 0.3864 1.8727 Coefficients: Estimate Std. Error z value Pr(>|z|) (Intercept) …

14 r  categorical-data  generalized-linear-model  interpretation  negative-binomial 

Saya melakukan glm.nb oleh glm1<-glm.nb(x~factor(group)) dengan kelompok menjadi kategororial dan x menjadi variabel metrik. Ketika saya mencoba untuk mendapatkan ringkasan hasil, saya mendapatkan hasil yang sedikit berbeda, tergantung pada apakah saya menggunakan summary()atau summary.glm. summary(glm1)memberi saya ... Coefficients: Estimate Std. Error z value Pr(>|z|) (Intercept) 0.1044 0.1519 0.687 0.4921 factor(gruppe)2 …

13 r  generalized-linear-model  negative-binomial